; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C023072 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C023072
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationchr05:6885535..6887094
RNA-Seq ExpressionMELO3C023072
SyntenyMELO3C023072
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147177.1 uncharacterized protein LOC101211925 [Cucumis sativus]2.0e-15594.31Show/hide
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XP_008460715.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499480 [Cucumis melo]9.3e-169100Show/hide
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XP_022964280.1 uncharacterized protein LOC111464344 [Cucurbita moschata]2.0e-11072.88Show/hide
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XP_023514400.1 uncharacterized protein LOC111778674 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.7e-11072.55Show/hide
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XP_038907133.1 uncharacterized protein LOC120092944 [Benincasa hispida]1.0e-13083.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKI3 Uncharacterized protein9.7e-15694.31Show/hide
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A0A1S3CD27 uncharacterized protein LOC1034994804.5e-169100Show/hide
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A0A5A7SNV9 Uncharacterized protein4.5e-169100Show/hide
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A0A6J1HKD0 uncharacterized protein LOC1114643449.5e-11172.88Show/hide
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        SWT+ML
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A0A6J1KDX0 uncharacterized protein LOC1114947731.1e-10972.13Show/hide
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Query:  WTKML
        WT+ML
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G33250.1 unknown protein1.6e-2535.86Show/hide
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        D+ +G+   + G R RK R  W    +D   D +D+  G             IL+E++D+VWI K FKSYG+ LP II+SL  ++GPKAFL++LA+ +G 
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Query:  SIIALALEKLWGIPERKPKRRTRSKTRKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNGEGNGKMGYGYQSWEVGSNG-GEVRSGGRNGNSFGGWEDLDGVGTER
        S++  A +KL G  +R+                T  +     E++EEEV R     + ++ Y   +     NG G  RS     + FGGW++LDG+GT  
Subjt:  SIIALALEKLWGIPERKPKRRTRSKTRKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNGEGNGKMGYGYQSWEVGSNG-GEVRSGGRNGNSFGGWEDLDGVGTER

Query:  KPKPGVRAKKQSSTTMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML
          +P    KK+    + K K   REK ++ PLLLRLL+++FPFL ++T ML
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AT3G04310.1 unknown protein1.4e-2637.26Show/hide
Query:  PNAETFGSHNFR--RREQYSEPDYEDDEQQGFDPGIRFRKNRRRWWSDDPAPDFEDQPSGILDEVIDSVWIFKVFKSYGWTLPPIIISLLLNSGPKAFLM
        PN  + GS + R  R   + E  + D+    F+ G   RK +R WW DD   D +D    + +E  D   +F+VF++  W L PI ISLLL +   A +M
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Query:  ALALPLGQSIIALALEKLWGIPERKPKRRTRSKT--RKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNGEGNGKMGYGYQSWEVGSNGGEVRSGGRNGNSFGGWE
        ALA+PL QS+++L + K+W  P  +  +R+R  T  R     S RT + ++          GN  G    G GY+SW VG +          G  +GGW+
Subjt:  ALALPLGQSIIALALEKLWGIPERKPKRRTRSKT--RKRPFYSTRTSRVQEEEDDEEEVARGNGEGNGKMGYGYQSWEVGSNGGEVRSGGRNGNSFGGWE

Query:  DLDGVGTERKPKP---GVRAKKQSSTTMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML
        DLD +   R   P    VR K+Q      K    WR K  + PLLLR+LIA FPFLGSWTK+L
Subjt:  DLDGVGTERKPKP---GVRAKKQSSTTMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGGCCCTGTTTCCTCATCCTTCTCATCCATTTCCATTTCCATTTCCATGTCCATGGCGGACCTTTCCATCTTCTTCTTCTTCCTTCCGCTTCACTTCTACA
CTCCTCCACTACCGTCCTCCCGATCCCAATGCCGAAACCTTCGGCTCCCACAATTTCAGACGCAGAGAACAATACTCTGAACCCGACTACGAAGACGATGAACAG
CAAGGCTTTGATCCCGGTATTCGCTTCCGTAAGAACCGTCGACGTTGGTGGTCCGATGACCCGGCGCCGGACTTCGAAGACCAACCTTCTGGGATCTTGGATGAA
GTAATCGATAGTGTCTGGATTTTCAAGGTATTCAAATCCTACGGCTGGACACTTCCACCCATAATCATCTCACTGCTGTTAAACTCAGGACCAAAAGCTTTTCTA
ATGGCGTTAGCCCTTCCACTAGGCCAATCAATCATAGCTCTGGCACTTGAGAAGTTGTGGGGAATACCAGAAAGGAAGCCGAAACGCAGAACTAGAAGCAAGACC
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TTGTTGAGATTGTTAATTGCTGTTTTTCCATTTTTGGGTTCATGGACTAAGATGCTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCCTCCCGATCCCAATGCCGAAACCTTCGGCTCCCACAATTTCAGACGCAGAGAACAATACTCTGAACCCGACTACGAAGACGATGAACAGCAAGGCTTTGATCC
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CTGGATTTTCAAGGTATTCAAATCCTACGGCTGGACACTTCCACCCATAATCATCTCACTGCTGTTAAACTCAGGACCAAAAGCTTTTCTAATGGCGTTAGCCCT
TCCACTAGGCCAATCAATCATAGCTCTGGCACTTGAGAAGTTGTGGGGAATACCAGAAAGGAAGCCGAAACGCAGAACTAGAAGCAAGACCAGGAAGAGGCCATT
TTACAGTACTAGGACTAGTCGGGTTCAAGAGGAAGAAGATGACGAAGAAGAAGTAGCAAGAGGAAATGGGGAAGGTAATGGAAAGATGGGCTATGGATATCAGTC
ATGGGAAGTTGGTAGCAATGGTGGTGAAGTTAGAAGTGGGGGCAGAAACGGGAACAGTTTTGGTGGATGGGAGGATCTTGATGGAGTTGGAACTGAGAGAAAGCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKALFPHPSHPFPFPFPCPWRTFPSSSSSFRFTSTLLHYRPPDPNAETFGSHNFRRREQYSEPDYEDDEQQGFDPGIRFRKNRRRWWSDDPAPDFEDQPSGILDE
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YGYQSWEVGSNGGEVRSGGRNGNSFGGWEDLDGVGTERKPKPGVRAKKQSSTTMEKGKLSWREKKSDTPLLLRLLIAVFPFLGSWTKML