; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C024802 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C024802
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr11:8656585..8657110
RNA-Seq ExpressionMELO3C024802
SyntenyMELO3C024802
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0048148.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-2471.11Show/hide
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KAA0055070.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-2667.35Show/hide
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KAA0066443.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-4088.78Show/hide
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TYJ98397.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]6.8e-44100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T479 Retrotransposon protein4.2e-2366.67Show/hide
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A0A5A7TYU4 Retrotransposon protein5.8e-2571.11Show/hide
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A0A5A7VE95 Putative nuclease HARBI11.7e-4088.78Show/hide
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A0A5D3BGZ9 Retrotransposon protein3.3e-44100Show/hide
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A0A5D3DLC6 Retrotransposon protein8.1e-2767.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCGATCATTGGGTCCAGACGCACCCTATAGCAAAAAGACTCCTGAATGACCCATTCCCGCATTACAACGCACTATTGTACGTGTTTAGGAAAGATCGAGCCACGGG
GACCCGTGCAAAGACCTTTGCAGACATCGATTTAAACGTGCCAGCCGATAACGATAGTGTCCCCGTAGAGGATGGCATCGACATGGAGTTCCTCGCTATGTCCAGCTCGA
GGATGAACTTGTCCTCAGAGGGCATGATGGGCGGTAGATCAGGCCAGTCGAGCGATGGTAGGACGGGCTCTAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCGGTTGTAGTTTGACGACGATCGTCATCGAAAGCCGAATAAAGTTGTTGAAGAAGATGTTTCAGGCCATTGCGGAGATGAGGGGCCCAGCTGGTAATGGCTTCGGCTAG
AACGATGACGTCAAGTTTATCATCGCCAAGAGGGACATGTTCGATCATTGGGTCCAGACGCACCCTATAGCAAAAAGACTCCTGAATGACCCATTCCCGCATTACAACGC
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GCATCGACATGGAGTTCCTCGCTATGTCCAGCTCGAGGATGAACTTGTCCTCAGAGGGCATGATGGGCGGTAGATCAGGCCAGTCGAGCGATGGTAGGACGGGCTCTAGC
TGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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