; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C024962 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C024962
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionTransmembrane protein 245-like protein
Genome locationchr01:9990894..9994335
RNA-Seq ExpressionMELO3C024962
SyntenyMELO3C024962
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR002549 - Transmembrane protein TqsA-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048253.1 transmembrane protein 245-like protein [Cucumis melo var. makuwa]0.0e+00100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K642 Uncharacterized protein0.0e+0098.31Show/hide
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A0A5A7TXB2 Transmembrane protein 245-like protein0.0e+00100Show/hide
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A0A5D3C9V5 Transmembrane protein 245-like protein0.0e+00100Show/hide
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A0A6J1IM89 uncharacterized protein LOC1114765350.0e+0090.5Show/hide
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        MELVPYSDPSS    N NSN NSSSPPWQDMFRS SVRKPSPDPQNH    SSKLP    SDS+SSFSGDPQVRLALYIAMAHAGLAFTILTLYAVGR+L
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        EAYLRPLQWAVLCSIPLRG+QQTLEGFWSEPL+LGLTETILAIPVAVFQVFVGTLVQFREVC RVVLRRKK GH+RR QSVFSKLLRWLVSFWIFILAYE
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Query:  NFGVIGSVSLLGLGFLFSSKSVDPTKYNVSSFRSLSFRRTAVSAFFTRGLLKRLKTIVAIGLIVAMIVVFLAGLVFFSYKIGVEGKDAMISLKLHVEESN
        NFGV+GSVSLLGLGFLFSSKSVD T YNVSSFRSLSFRRTAVS+FFT G+LKRLKTIVAIGLIVAMI+ FLAGLVFFSYKIGVEGKDAMISLK+HVE+SN
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Query:  YAERIGVKKWMEENDLPGMIDSYTSQFYEAVLEQIDGYAMQYNMTEFVTGIKHLALSSSRANSSGASTSLITPSPYTQKLMSLRNRVSNKEWGQIYTELD
        YAERIGVKKWME+ND+ GMIDSYTS+FY+AVLEQID  AMQYN+TEFVTGIKHLALSSSRANSSG  TSL+TPSPYT KLMSLRNR+SNKEWGQIYTELD
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Query:  AIIRELIITREDLVEKAKGLAVQGMDISQRVFASSVSVLGRSAKLMLSVGRSIISGAAEVFNFVSQSMVFFWVLYYLITSESGGVTEQVMYMLPIEDSAR
        AIIRELIITREDL+EKAK LAVQGMDISQRVFASSVSVLG SAKLMLS+G SIISGAAE+FNFVS SMVFFWVLYYLITSESGGVTEQV+YMLPIE+SAR
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Query:  IRCVEVLDHAISGVLLATAEIAIYQGCLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQLLLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQED
        IRCVEVLD+AISGVLLATA+IAIYQGCLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFP WFATIPAALQLLLEGRYVVA+CL+IIHLALMDYG+SEIQE 
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Query:  IPGHSEYLMGLSIIGGMTLFSSALEGAIMGPLITTVVIALKDLYVEFVLGENKGKEKEKEKEK
         PGHSEYLMGLSIIGGMTLFSSALEGAIMGPLITTVVIALKDLYVEFVLGENKGKEKEKEKEK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1AZA5 Transmembrane protein 2451.6e-1129.09Show/hide
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        V + +VS+L  +   +L++     SG A + NFV   ++F   L+YL++S  E     + V+ + P+        +  + ++ AI GV  A+ ++A + G
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Query:  CLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQL-LLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPGHSE-YLMGLSIIGGMTLFSSAL
          TWL   +F I+ +++ + LA +    P   +++A +PA L L L +G    AI L + HL    +  + I  DI G    YL GL++ GG   +   L
Subjt:  CLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQL-LLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPGHSE-YLMGLSIIGGMTLFSSAL

Query:  EGAIMGPLITTVVIALKDLY
        EGAI+GP++  +++   ++Y
Subjt:  EGAIMGPLITTVVIALKDLY

D3ZXD8 Transmembrane protein 2452.8e-1128.64Show/hide
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        V + +VS+L  +   +L++     SG A + NFV   ++F   L+YL++S  E     + V+ + P+        +  + ++ AI GV  A+ ++A + G
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Query:  CLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQL-LLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPGHSE-YLMGLSIIGGMTLFSSAL
          TWL   +F I+ +++ + LA +    P   +++A +PA L L L +G    A+ L + HL    +  + I  DI G    YL GL++ GG   +   L
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Query:  EGAIMGPLITTVVIALKDLY
        EGAI+GP++  +++   ++Y
Subjt:  EGAIMGPLITTVVIALKDLY

E1BD52 Transmembrane protein 2454.0e-1029.6Show/hide
Query:  VFASSVSVLGRSAKLMLSVGRSIISGAAEVFNFVSQSMVFFWVLYYLITS--ESGGVTEQVMYMLPIED---SARI--RCVEVLDHAISGVLLATAEIAI
        V + +VS+L  +   +L++     SG A + NFV   ++F   L+YL++S  E     + V+ + P+     S+ I  + VE       GV  A+ ++A 
Subjt:  VFASSVSVLGRSAKLMLSVGRSIISGAAEVFNFVSQSMVFFWVLYYLITS--ESGGVTEQVMYMLPIED---SARI--RCVEVLDHAISGVLLATAEIAI

Query:  YQGCLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQL-LLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPGHSE-YLMGLSIIGGMTLFS
        + G  TWL   +F I+ +++ + LA +    P   +++A +PA L L L +G    AI L + HL    +  + I  DI G    YL GL++ GG   + 
Subjt:  YQGCLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQL-LLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPGHSE-YLMGLSIIGGMTLFS

Query:  SALEGAIMGPLITTVVIALKDLY
          LEGAI+GP++  +++   ++Y
Subjt:  SALEGAIMGPLITTVVIALKDLY

Q9H330 Transmembrane protein 2451.3e-1129.55Show/hide
Query:  VFASSVSVLGRSAKLMLSVGRSIISGAAEVFNFVSQSMVFFWVLYYLITS--ESGGVTEQVMYMLPIEDSARIRCV--EVLDHAISGVLLATAEIAIYQG
        V + +VS+L  +   +L++     SG A + NFV   ++F   L+YL++S  E     + V+ + P+        +  + ++ AI GV  A+ ++A + G
Subjt:  VFASSVSVLGRSAKLMLSVGRSIISGAAEVFNFVSQSMVFFWVLYYLITS--ESGGVTEQVMYMLPIEDSARIRCV--EVLDHAISGVLLATAEIAIYQG

Query:  CLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQL-LLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPGHSE-YLMGLSIIGGMTLFSSAL
          TWL   +F I+ +++ + LA +    P   +++A +PA L L L +G    AI L I HL    +  + I  DI G    YL GL++ GG   +   L
Subjt:  CLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQL-LLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPGHSE-YLMGLSIIGGMTLFSSAL

Query:  EGAIMGPLITTVVIALKDLY
        EGAI+GP++  +++   ++Y
Subjt:  EGAIMGPLITTVVIALKDLY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G55960.1 unknown protein1.7e-23767.85Show/hide
Query:  MELVPYSDPSSNSNSNSNSSSPPWQDMFRSGSVRKPSPDPQNHSSKLPQSDSNSSFSG-------DPQVRLALYIAMAHAGLAFTILTLYAVGRILEAYL
        MELVPY D  + S+  +N +   WQ+MFRS S RKP   P + SS  P+  S    S        D Q RLA+YIAMAHAGLAF I  LY VG++L+ YL
Subjt:  MELVPYSDPSSNSNSNSNSSSPPWQDMFRSGSVRKPSPDPQNHSSKLPQSDSNSSFSG-------DPQVRLALYIAMAHAGLAFTILTLYAVGRILEAYL

Query:  RPLQWAVLCSIPLRGIQQTLEGFWSEPLQLGLTETILAIPVAVFQVFVGTLVQFREVCFRVVLRRKKSGHVR-RNQSVFSKLLRWLVSFWIFILAYENFG
        RP+QWA+LCSIPLRGIQ+TL  FWSEPL+LGLTE +LA+PV+VF VF+G++V  + VCFRV LRR K    R +N + FSKL++WLVSF +F++AYE  G
Subjt:  RPLQWAVLCSIPLRGIQQTLEGFWSEPLQLGLTETILAIPVAVFQVFVGTLVQFREVCFRVVLRRKKSGHVR-RNQSVFSKLLRWLVSFWIFILAYENFG

Query:  VIGSVSLLGLGFLFSSKSVDPTKYNVSSFRSLSFRRTAVSAFFTRGLLKRLKTIVAIGLIVAMIVVFLAGLVFFSYKIGVEGKDAMISLKLHVEESNYAE
         IGS+ +L LGFLFSSK+VD +   VSS RS SFRR+  +A+FTRG++ RL TIVAIGLIV MIV  L G++FFSYKIGVEGKDA+ SLK HVEESNYAE
Subjt:  VIGSVSLLGLGFLFSSKSVDPTKYNVSSFRSLSFRRTAVSAFFTRGLLKRLKTIVAIGLIVAMIVVFLAGLVFFSYKIGVEGKDAMISLKLHVEESNYAE

Query:  RIGVKKWMEENDLPGMIDSYTSQFYEAVLEQIDGYAMQYNMTEFVTGIKHLALSSSRANSSGASTSLITPSPYTQKLMSLRNRVSNKEWGQIYTELDAII
        +IG+K+WM+END+PGM+D YT++FYE V EQID  AMQYNMTE VTGIKH  +   + N+S  ST+LITPSPYT+KLMSLR RV N+EW QIY+E+D I 
Subjt:  RIGVKKWMEENDLPGMIDSYTSQFYEAVLEQIDGYAMQYNMTEFVTGIKHLALSSSRANSSGASTSLITPSPYTQKLMSLRNRVSNKEWGQIYTELDAII

Query:  RELIITREDLVEKAKGLAVQGMDISQRVFASSVSVLGRSAKLMLSVGRSIISGAAEVFNFVSQSMVFFWVLYYLITSESGGVTEQVMYMLPIEDSARIRC
        RELIITREDLVEKAKG AV+GMD+SQRVF+SS SV+G  AK + S+G  IISGAAE FNF+SQ M+F WVLY LITSESGGVTEQVM MLPI  SAR RC
Subjt:  RELIITREDLVEKAKGLAVQGMDISQRVFASSVSVLGRSAKLMLSVGRSIISGAAEVFNFVSQSMVFFWVLYYLITSESGGVTEQVMYMLPIEDSARIRC

Query:  VEVLDHAISGVLLATAEIAIYQGCLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQLLLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPG
        VEVLD AISGVLLATAEIA +QGCLTWLL RL+ IHFLY+STVLAF+S L PIFP WFATIPAALQL+LEGRY+VA+ L++ HL LM+YG SEIQ+DIPG
Subjt:  VEVLDHAISGVLLATAEIAIYQGCLTWLLLRLFEIHFLYVSTVLAFLSPLFPIFPSWFATIPAALQLLLEGRYVVAICLAIIHLALMDYGISEIQEDIPG

Query:  HSEYLMGLSIIGGMTLFSSALEGAIMGPLITTVVIALKDLYVEFVLGENK
         + YL GLSIIGG+TLF SALEGAIMGPLITTVVIALKDLY EFVL E K
Subjt:  HSEYLMGLSIIGGMTLFSSALEGAIMGPLITTVVIALKDLYVEFVLGENK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTCGTTCCTTACTCTGACCCATCTTCCAATTCCAATTCCAATTCCAATTCCTCGAGCCCTCCATGGCAGGACATGTTCAGATCCGGTTCTGTTCGAAAACCCAG
CCCCGACCCTCAAAACCATTCTTCCAAACTCCCTCAATCCGATTCCAATTCCTCTTTTTCCGGTGATCCTCAGGTCCGCCTTGCCCTTTACATCGCCATGGCCCACGCCG
GCCTTGCCTTCACCATTCTCACTCTCTACGCCGTCGGTCGCATCCTCGAGGCCTATCTCCGCCCCCTTCAGTGGGCCGTCCTCTGTTCTATCCCTCTTCGTGGTATTCAA
CAAACCCTTGAAGGGTTCTGGTCCGAACCCCTTCAATTGGGCCTTACCGAGACTATTCTCGCCATCCCTGTTGCTGTTTTTCAGGTTTTTGTTGGAACCCTTGTTCAATT
TCGAGAAGTTTGTTTCCGGGTTGTTCTTAGGAGGAAGAAATCTGGGCATGTTAGAAGGAATCAGAGTGTGTTTTCTAAGTTGTTGCGATGGCTTGTGTCGTTCTGGATTT
TTATACTTGCTTATGAGAACTTTGGTGTTATTGGCTCTGTTTCGCTTCTTGGGTTAGGCTTTTTGTTTAGTTCTAAGTCTGTGGATCCTACCAAGTATAATGTTTCTTCC
TTTCGTAGCTTGAGCTTTCGTCGTACCGCTGTTAGTGCGTTTTTTACTAGAGGGCTTTTGAAAAGATTGAAAACTATAGTTGCAATTGGCTTGATTGTTGCTATGATTGT
TGTGTTCTTAGCTGGATTGGTGTTTTTCTCTTACAAAATTGGGGTTGAAGGGAAAGATGCTATGATTTCGTTGAAACTACATGTGGAAGAGAGCAACTATGCGGAGAGGA
TTGGGGTTAAGAAGTGGATGGAAGAGAATGATTTGCCTGGGATGATTGATAGCTACACCAGCCAATTTTATGAAGCAGTGTTGGAACAGATAGATGGTTATGCTATGCAG
TATAATATGACGGAGTTTGTCACTGGGATTAAGCATTTAGCTTTATCATCGTCTCGGGCCAACTCTTCGGGGGCTTCGACTTCTCTAATAACTCCATCGCCGTACACGCA
AAAACTCATGAGTTTGAGAAATCGCGTTAGTAACAAGGAGTGGGGCCAGATTTATACAGAGCTGGATGCAATTATTAGGGAGTTGATAATCACTAGGGAGGATTTAGTTG
AGAAAGCAAAAGGATTAGCCGTTCAAGGGATGGATATTTCGCAGAGAGTCTTTGCTAGCAGTGTATCAGTACTAGGACGCAGTGCAAAGCTAATGCTTTCGGTTGGTAGG
TCTATCATTTCAGGAGCAGCTGAGGTTTTCAACTTTGTCTCTCAGTCGATGGTGTTCTTTTGGGTTCTGTATTATCTCATCACTTCTGAATCTGGAGGTGTGACTGAACA
AGTTATGTATATGCTTCCAATTGAAGACTCGGCCCGAATTCGATGTGTTGAAGTTCTTGACCATGCGATATCGGGTGTTCTTCTGGCTACAGCAGAGATTGCAATCTATC
AAGGATGTCTTACATGGCTGTTGCTTCGACTCTTTGAAATACATTTCTTGTATGTGTCCACTGTTCTTGCATTTCTGAGTCCTCTTTTCCCAATTTTTCCATCTTGGTTT
GCGACAATTCCAGCAGCCTTACAGCTGCTGCTGGAAGGTAGATATGTAGTAGCCATCTGTTTGGCAATTATTCACCTTGCACTCATGGATTATGGTATCTCGGAAATTCA
AGAGGACATACCTGGTCACAGTGAATACCTTATGGGACTTAGCATCATTGGTGGAATGACTTTGTTTTCATCTGCATTGGAGGGTGCGATTATGGGACCGTTGATTACAA
CGGTCGTGATTGCTCTGAAGGATCTGTATGTGGAATTTGTTCTGGGTGAAAATAAAGGAAAGGAGAAGGAGAAGGAAAAGGAAAAGCGCAACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGTTGTTCAGCTCTTCTCTGTCTCTTCACCATAATCCATTTCTCTGTCCCTTCCACCAATGGAGCTCGTTCCTTACTCTGACCCATCTTCCAATTCCAATTCCAATTCC
AATTCCTCGAGCCCTCCATGGCAGGACATGTTCAGATCCGGTTCTGTTCGAAAACCCAGCCCCGACCCTCAAAACCATTCTTCCAAACTCCCTCAATCCGATTCCAATTC
CTCTTTTTCCGGTGATCCTCAGGTCCGCCTTGCCCTTTACATCGCCATGGCCCACGCCGGCCTTGCCTTCACCATTCTCACTCTCTACGCCGTCGGTCGCATCCTCGAGG
CCTATCTCCGCCCCCTTCAGTGGGCCGTCCTCTGTTCTATCCCTCTTCGTGGTATTCAACAAACCCTTGAAGGGTTCTGGTCCGAACCCCTTCAATTGGGCCTTACCGAG
ACTATTCTCGCCATCCCTGTTGCTGTTTTTCAGGTTTTTGTTGGAACCCTTGTTCAATTTCGAGAAGTTTGTTTCCGGGTTGTTCTTAGGAGGAAGAAATCTGGGCATGT
TAGAAGGAATCAGAGTGTGTTTTCTAAGTTGTTGCGATGGCTTGTGTCGTTCTGGATTTTTATACTTGCTTATGAGAACTTTGGTGTTATTGGCTCTGTTTCGCTTCTTG
GGTTAGGCTTTTTGTTTAGTTCTAAGTCTGTGGATCCTACCAAGTATAATGTTTCTTCCTTTCGTAGCTTGAGCTTTCGTCGTACCGCTGTTAGTGCGTTTTTTACTAGA
GGGCTTTTGAAAAGATTGAAAACTATAGTTGCAATTGGCTTGATTGTTGCTATGATTGTTGTGTTCTTAGCTGGATTGGTGTTTTTCTCTTACAAAATTGGGGTTGAAGG
GAAAGATGCTATGATTTCGTTGAAACTACATGTGGAAGAGAGCAACTATGCGGAGAGGATTGGGGTTAAGAAGTGGATGGAAGAGAATGATTTGCCTGGGATGATTGATA
GCTACACCAGCCAATTTTATGAAGCAGTGTTGGAACAGATAGATGGTTATGCTATGCAGTATAATATGACGGAGTTTGTCACTGGGATTAAGCATTTAGCTTTATCATCG
TCTCGGGCCAACTCTTCGGGGGCTTCGACTTCTCTAATAACTCCATCGCCGTACACGCAAAAACTCATGAGTTTGAGAAATCGCGTTAGTAACAAGGAGTGGGGCCAGAT
TTATACAGAGCTGGATGCAATTATTAGGGAGTTGATAATCACTAGGGAGGATTTAGTTGAGAAAGCAAAAGGATTAGCCGTTCAAGGGATGGATATTTCGCAGAGAGTCT
TTGCTAGCAGTGTATCAGTACTAGGACGCAGTGCAAAGCTAATGCTTTCGGTTGGTAGGTCTATCATTTCAGGAGCAGCTGAGGTTTTCAACTTTGTCTCTCAGTCGATG
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AGTTCTTGACCATGCGATATCGGGTGTTCTTCTGGCTACAGCAGAGATTGCAATCTATCAAGGATGTCTTACATGGCTGTTGCTTCGACTCTTTGAAATACATTTCTTGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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