; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C025340 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C025340
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionFlocculation protein FLO11-like
Genome locationchr02:19550515..19551353
RNA-Seq ExpressionMELO3C025340
SyntenyMELO3C025340
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049940.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-1654.74Show/hide
Query:  DVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRV
        +V +HTTD ED +K DE ES ED DDDY+  P+ET+VPEET VP      SP NKT EP L +V RD TT + P G+VGSSS+ P++PL K + +
Subjt:  DVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRV

KAA0054111.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-2243.17Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPY---------------------------------HTTDHEDLYK
        MASSPPKNAS  KGK Y+ I + CLFKKV   DATD+SNLHIP   L +   Q +P                                       ++  +
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPY---------------------------------HTTDHEDLYK

Query:  IDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVIS
         D+DES  DT +DYVL  ++T++P+ET V  DD   S  N+T EPQ T+VPRDSTT LS  GHVGSS + P RP V+ +R+ S
Subjt:  IDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVIS

KAA0058484.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-1740.53Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED
        M +SP K  +  KGK YK I  R  FKK    V   DAT  S L  P                   S + V   ++DVP  TTDH             + 
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED

Query:  LYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG
            D+DE+ +D D+DYV V +ET+  EET    +DL SSP N+T EPQ TK P +S+  +SP  HVGSSS+ P R LV+ QRV+STK G
Subjt:  LYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG

TYK00112.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-4050.22Show/hide
Query:  MAVDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL
        MA+DSSSMASSPPKNASLAKG   ++                                                                    I+L  L
Subjt:  MAVDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL

Query:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
         ++    D +D     +P A+ +       P      EDLYK DEDESGEDTDDDYVLVPEETYVP+ETTVP+DDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
Subjt:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL

Query:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTK
        SPQGHVGSSSKEPRRPLVK QRVISTK
Subjt:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTK

XP_008464024.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103502008 [Cucumis melo]7.6e-1642.6Show/hide
Query:  KGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIPSANLVQCA----------QQDVPYHTTDH-------------EDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVP
        KGK YK I  R  FKK    V   DAT  S L  P    V+              DVP  TTDH             +     D+DE+ +D D+DYV V 
Subjt:  KGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIPSANLVQCA----------QQDVPYHTTDH-------------EDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVP

Query:  EETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG
        +ET+  EET    +DL SSP N+T EPQ TK P +S+  +SP  HVGSSS+ P R LV+ QRV+STK G
Subjt:  EETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CL10 uncharacterized protein LOC1035020083.7e-1642.6Show/hide
Query:  KGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIPSANLVQCA----------QQDVPYHTTDH-------------EDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVP
        KGK YK I  R  FKK    V   DAT  S L  P    V+              DVP  TTDH             +     D+DE+ +D D+DYV V 
Subjt:  KGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIPSANLVQCA----------QQDVPYHTTDH-------------EDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVP

Query:  EETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG
        +ET+  EET    +DL SSP N+T EPQ TK P +S+  +SP  HVGSSS+ P R LV+ QRV+STK G
Subjt:  EETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG

A0A5A7U3T5 Flocculation protein FLO11-like1.6e-1654.74Show/hide
Query:  DVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRV
        +V +HTTD ED +K DE ES ED DDDY+  P+ET+VPEET VP      SP NKT EP L +V RD TT + P G+VGSSS+ P++PL K + +
Subjt:  DVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRV

A0A5D3BN12 Flocculation protein FLO11-like2.1e-4050.22Show/hide
Query:  MAVDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL
        MA+DSSSMASSPPKNASLAKG   ++                                                                    I+L  L
Subjt:  MAVDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL

Query:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
         ++    D +D     +P A+ +       P      EDLYK DEDESGEDTDDDYVLVPEETYVP+ETTVP+DDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
Subjt:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL

Query:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTK
        SPQGHVGSSSKEPRRPLVK QRVISTK
Subjt:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTK

A0A5D3C7L1 Flocculation protein FLO11-like5.1e-1840.53Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED
        M +SP K  +  KGK YK I  R  FKK    V   DAT  S L  P                   S + V   ++DVP  TTDH             + 
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED

Query:  LYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG
            D+DE+ +D D+DYV V +ET+  EET    +DL SSP N+T EPQ TK P +S+  +SP  HVGSSS+ P R LV+ QRV+STK G
Subjt:  LYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAG

A0A5D3E1D9 Flocculation protein FLO11-like2.6e-2243.17Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPY---------------------------------HTTDHEDLYK
        MASSPPKNAS  KGK Y+ I + CLFKKV   DATD+SNLHIP   L +   Q +P                                       ++  +
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPY---------------------------------HTTDHEDLYK

Query:  IDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVIS
         D+DES  DT +DYVL  ++T++P+ET V  DD   S  N+T EPQ T+VPRDSTT LS  GHVGSS + P RP V+ +R+ S
Subjt:  IDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPEDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVIS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGTTGATTCCTCTTCCATGGCTTCATCTCCTCCCAAGAATGCATCTCTTGCTAAGGGTAAACATTACAAGATTATTCTGCTGCGTTGTCTATTCAAGAAA
GTTTGTCATCCTGATGCAACTGATGAATCAAATCTCCACATTCCCTCAGCCAATCTTGTTCAGTGTGCACAACAGGATGTTCCTTATCATACTACAGACCATGAA
GATTTATATAAAATTGATGAAGATGAGTCAGGTGAAGATACTGATGATGACTACGTTCTTGTCCCTGAGGAAACATATGTTCCAGAAGAAACCACTGTTCCAGAA
GATGACCTAGCTTCGTCTCCTGTCAACAAAACGTCTGAGCCTCAGTTGACTAAGGTTCCTAGAGACTCTACCACTCCTCTGTCGCCTCAGGGTCATGTTGGTTCT
TCCTCCAAAGAACCTAGAAGACCACTTGTTAAAAGTCAACGAGTTATTTCCACTAAGGCTGGTCGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGTTGATTCCTCTTCCATGGCTTCATCTCCTCCCAAGAATGCATCTCTTGCTAAGGGTAAACATTACAAGATTATTCTGCTGCGTTGTCTATTCAAGAAA
GTTTGTCATCCTGATGCAACTGATGAATCAAATCTCCACATTCCCTCAGCCAATCTTGTTCAGTGTGCACAACAGGATGTTCCTTATCATACTACAGACCATGAA
GATTTATATAAAATTGATGAAGATGAGTCAGGTGAAGATACTGATGATGACTACGTTCTTGTCCCTGAGGAAACATATGTTCCAGAAGAAACCACTGTTCCAGAA
GATGACCTAGCTTCGTCTCCTGTCAACAAAACGTCTGAGCCTCAGTTGACTAAGGTTCCTAGAGACTCTACCACTCCTCTGTCGCCTCAGGGTCATGTTGGTTCT
TCCTCCAAAGAACCTAGAAGACCACTTGTTAAAAGTCAACGAGTTATTTCCACTAAGGCTGGTCGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKIDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPEETTVPE
DDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKSQRVISTKAGR