; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C027143 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C027143
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionDUF4050 family protein
Genome locationchr05:27841786..27844654
RNA-Seq ExpressionMELO3C027143
SyntenyMELO3C027143
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025124 - Domain of unknown function DUF4050


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022999179.1 uncharacterized protein LOC111493640 [Cucurbita maxima]4.6e-7483.23Show/hide
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XP_038889429.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X1 [Benincasa hispida]1.9e-8392.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFZ6 Uncharacterized protein5.5e-8998.76Show/hide
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A0A1S3CQL1 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X21.1e-89100Show/hide
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A0A1S4E5A2 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X11.4e-8795.83Show/hide
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A0A6J1G589 uncharacterized protein LOC1114508505.5e-7382.61Show/hide
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A0A6J1KGB3 uncharacterized protein LOC1114936402.2e-7483.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15350.1 unknown protein2.7e-1942.06Show/hide
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AT1G15350.2 unknown protein2.7e-1942.06Show/hide
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AT4G32342.1 unknown protein1.0e-1841.67Show/hide
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        S+DFWSTSTCD+D  +T+QS+ ++       ++         SN ++FVNHG +LW  TR +W   C+  ++        +SW  T + LL T K + + 
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        IPL EMV FLV+ WEEEGLY
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AT5G25360.1 unknown protein3.8e-2642.68Show/hide
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        WI +L  C+G       KP   ++      G  +  R+   PS+SEDFWSTSTC++D       R  S IS TN+ S       + SN ++FVNHG  LW
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         QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL EMVDFLV+ WE+EGLY
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AT5G25360.2 unknown protein3.8e-2642.68Show/hide
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Query:  TQTRLRWVGNCVPAKRTKKSHITGLSWYMTKELLLETRKPYHRRIPLSEMVDFLVEEWEEEGLY
         QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL EMVDFLV+ WE+EGLY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGACCCGAGAGAGCTGGTTTTCTGTTTGGATCGATCGACTTCTCTCTTGTTTAGGGAGCATTAAACCTGCACCTGCCATCTCTGGGAATAATCTGAACTCTAGGAT
GCCAAGCATGTCAGAAGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTGGACGAGTTGCTTACACTTCAATCTCGACAGAATTCATTTATCAGCACAACGAACCATAACTCTA
ACCATGGTGGTGTCATTGATAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGCCTTCGGTGGGTCGGAAATTGTGTGCCTGCT
AAACGAACTAAAAAAAGTCATATTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAGCCTTACCATCGACGCATACCTTTATCGGAAATGGT
AGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACACGGTTTAGGGTTGTTAAAATTAACTACTAATTAACGGTATGAAATTACTGATTATCAAATGGATCTGTTAAAAGTTTCAATGCAAGTCACAATCACAATAATTTCC
TATCCAATACTGCCTTGTTTATCCGATTCTATCCGAAATTAGGGATTTTGATTCGATTCCCATTTTCCCTTTCGATTTCGGCATGTTTCTGTGTTTTCATGTTTGTAATC
TGATTTTTCGCCGAATATGGTGACCCGAGAGAGCTGGTTTTCTGTTTGGATCGATCGACTTCTCTCTTGTTTAGGGAGCATTAAACCTGCACCTGCCATCTCTGGGAATA
ATCTGAACTCTAGGATGCCAAGCATGTCAGAAGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTGGACGAGTTGCTTACACTTCAATCTCGACAGAATTCATTTATCAGCACA
ACGAACCATAACTCTAACCATGGTGGTGTCATTGATAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGCCTTCGGTGGGTCGG
AAATTGTGTGCCTGCTAAACGAACTAAAAAAAGTCATATTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAGCCTTACCATCGACGCATAC
CTTTATCGGAAATGGTAGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAAGCCGGTCAATTGAAAGAACAATCACCTTGTGCATACACTATCCTTGTG
ACTTTTTTCTTTCGTGTTTTGGAGTTCAATTCCGCGCCTACCACCTTAACTTGGGATCAACTCGATACAAGTTTAACATACAAAATGACACCATTGGTTTGCTAACCTTT
TCGATATTGCTGCTACATTGGAGATCTCTAAGGGGAGGGGCCAATTGTGAAGTAACCCAAAATCAAAGATCTTCCAATTGATCGGCGAGCTAAATGGTAAGCCCCCTCCG
ACCAATATACTTTATACATACATATCAAACTTTCTTCATCATTAGTTTAATATATGATGAAACATCAACTTTGCAGTGTGTTTGATGCAATGTTGTTGATGACCGACTCG
TTGTAATTGATGTAAAAGAATAGATAATAATTAATCTCTCTAAAACAAACTCTTCTTTGTTTTGAATTCCTGATAAAATATCCAGATTGATTTTGTGGTGATATTGCTGT
C
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVTRESWFSVWIDRLLSCLGSIKPAPAISGNNLNSRMPSMSEDFWSTSTCDLDELLTLQSRQNSFISTTNHNSNHGGVIDNLSNHSDFVNHGFVLWTQTRLRWVGNCVPA
KRTKKSHITGLSWYMTKELLLETRKPYHRRIPLSEMVDFLVEEWEEEGLYY