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MELO3C028457 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C028457
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Description7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase, chloroplastic
Genome locationchr07:13072098..13072912
RNA-Seq ExpressionMELO3C028457
SyntenyMELO3C028457
Gene Ontology termsGO:0033354 - chlorophyll cycle (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0090415 - 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007516 - Coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GAY66842.1 hypothetical protein CUMW_252020 [Citrus unshiu]1.3e-0869.57Show/hide
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KAB5537727.1 hypothetical protein DKX38_015260 [Salix brachista]3.8e-0866.1Show/hide
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KAG0484930.1 hypothetical protein HPP92_009009 [Vanilla planifolia]1.9e-0777.5Show/hide
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KAG0486765.1 hypothetical protein HPP92_008860 [Vanilla planifolia]1.9e-0777.5Show/hide
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        DPEDR  PRPILART +EVFA  GVKPTL+PNLNTLA++E
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PKU66603.1 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase, chloroplastic [Dendrobium catenatum]1.4e-0776.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0D6R0M3 Uncharacterized protein9.1e-0875.61Show/hide
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A0A0V0ISM0 Putative ovule protein4.1e-0876.74Show/hide
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A0A2H5QQE0 Uncharacterized protein6.3e-0969.57Show/hide
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        +G+ F DP+DR  PRP+LART +EV A  GVKPTL+PNLNTLALVE
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A0A2I0VT69 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase, chloroplastic7.0e-0876.19Show/hide
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A0A5N5L4Q0 Uncharacterized protein1.8e-0866.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q7XTG7 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase, chloroplastic1.0e-0872.5Show/hide
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Q8GS60 7-hydroxymethyl chlorophyll a reductase, chloroplastic2.7e-0972.5Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04620.1 coenzyme F420 hydrogenase family / dehydrogenase, beta subunit family1.9e-1072.5Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGTAAAGCCAACGTTGACTCCTAACTTGAATACCCTAGCTCTAGTTGAGGTGCTTTTCTTTTTTCATTATATATTGCTTCTGTTTCCTTGTTCATTTCATGAAGAAAAAG
CCCAAATTCTTTCTCATTGTGGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTATTAGTATTGAACAAGATGGTCTTCATTTCATTGATCCAGAGGATAGACCAAGACCAAGGCCAATTTTAGCAAGGACACAAAAAGAAGTCTTTGCAGACACAGG
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TTTATAATGTTTGTTGTTTCTTTGTATGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSISIEQDGLHFIDPEDRPRPRPILARTQKEVFADTGVKPTLTPNLNTLALVEVLFFFHYILLLFPCSFHEEKAQILSHCG