; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C029543 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C029543
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionZinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2
Genome locationchr02:9558945..9563643
RNA-Seq ExpressionMELO3C029543
SyntenyMELO3C029543
Gene Ontology termsGO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008906 - HAT, C-terminal dimerisation domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025731.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-14578.12Show/hide
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KAA0026183.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-16173.91Show/hide
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TYJ97768.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-14575.89Show/hide
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TYK06161.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-16073.67Show/hide
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TYK30761.1 putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]5.8e-16274.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SNA3 Putative transposase8.2e-14678.12Show/hide
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A0A5A7SNJ1 Putative transposase6.2e-16273.91Show/hide
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A0A5D3BHV2 Putative transposase8.2e-14675.89Show/hide
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                                          +DAKTEV RYLDE RIDCM DEYLDLLTWWKVNSSRFKI+SQVA+DIYSITISTVPSESAFST GR
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A0A5D3C2L4 Putative transposase5.3e-16173.67Show/hide
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        EE DP                                                                              +DAKTEV RYLDE RID
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        EMEAAFENLNNDSM
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A0A5D3E590 Putative transposase2.8e-16274.15Show/hide
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Query:  CMSDEYLDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTFQTAQALICAHNWIQSKPLNDMIEEIDGAEEIDE-----GK
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        EMEAAFENLNNDSM
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9FJG3 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 14.2e-3032.34Show/hide
Query:  EKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVAN-HKGDTIGRAIEKCLEGWGI-DRLFAITVDN-ASSNDATIAYLV
        ++ L  A      R+ L    WT+ Q + Y+ +   FID +W +H+R+LNF  V++ H  + +  AI   L  W + D+LF IT+DN  SS+D   A L 
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Query:  KKFKGRNELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTF
             +N L+L G+   +RC AHILN +  D +  +H  I  IR  +K++++SP+  + F + A + ++ +     +DV T+WN+T  ML  A+  ++ F
Subjt:  KKFKGRNELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTF

Query:  ERLEERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLL
          LE  D N  +   A    +    C    YL LL
Subjt:  ERLEERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLL

P03010 Putative AC9 transposase3.8e-3134.16Show/hide
Query:  HQIFIFISSPLHRIHPPITASSSFLVTFKIFRFSGEKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQV-ANHKGDTIGR
        H+ F+     L R H PI +  +            ++KL   L     R   T D WTS QN +Y+ +T H+IDDDW L KRI+ F  V   H G  + +
Subjt:  HQIFIFISSPLHRIHPPITASSSFLVTFKIFRFSGEKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQV-ANHKGDTIGR

Query:  AIEKCLEGWGID-RLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFKGR-NELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAK
             +  W I+ +LFA+++DNAS+N+  +  +++  +   + LV DG F H+RC  HILNL+  D L  +  +I +I+ +V  V+SSP + +     A 
Subjt:  AIEKCLEGWGID-RLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFKGR-NELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAK

Query:  EDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLEERDP
        E  +      + DV TRWNST  ML  A+  +    RL+  DP
Subjt:  EDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLEERDP

P03010 Putative AC9 transposase5.1e-1235.29Show/hide
Query:  QKTFERLEERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTFQTAQALICAHN
        Q     L++ D  ++  E+ +Y+ E  +        D+L+WW+   + + I++Q+A+D+ +I +STV SESAFS GGRV+D +R+ L  +  +ALIC  +
Subjt:  QKTFERLEERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTFQTAQALICAHN

Query:  WI
        W+
Subjt:  WI

P08770 Putative AC transposase1.2e-3224.36Show/hide
Query:  HQIFIFISSPLHRIHPPITASSSFLVTFKIFRFSGEKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQV-ANHKGDTIGR
        H+ F+     L R H PI +  +            ++KL   L     R   T D WTS QN +Y+ +T H+IDDDW L KRI+ F  V   H G  + +
Subjt:  HQIFIFISSPLHRIHPPITASSSFLVTFKIFRFSGEKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQV-ANHKGDTIGR

Query:  AIEKCLEGWGID-RLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFKGR-NELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAK
             +  W I+ +LFA+++DNAS+N+  +  +++  +   + LV DG F H+RC  HILNL+  D L  +  +I +I+ +V  V+SSP + +     A 
Subjt:  AIEKCLEGWGID-RLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFKGR-NELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAK

Query:  EDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAI----------------------------------KCQKTFERLEE--------------------------
        E  +      + DV TRWNST  ML  A+                                  KC K F  L E                          
Subjt:  EDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAI----------------------------------KCQKTFERLEE--------------------------

Query:  ------------------------------------RDPNDAKTEVARY--------------------------------------------LDETRID
                                             DP   K  +  Y                                            +D+T ++
Subjt:  ------------------------------------RDPNDAKTEVARY--------------------------------------------LDETRID

Query:  CMSDEY--------------------------------LDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTFQTAQALIC
           DE+                                 D+L+WW+   + + I++Q+A+D+ +I +STV SESAFS GGRV+D +R+ L  +  +ALIC
Subjt:  CMSDEY--------------------------------LDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTFQTAQALIC

Query:  AHNWI
          +W+
Subjt:  AHNWI

Q6AVI0 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 29.9e-3233.19Show/hide
Query:  EKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVAN-HKGDTIGRAIEKCLEGWGI-DRLFAITVDN-ASSNDATIAYLV
        ++ L  A +    R+ LT   WT+ Q + Y+ +   FID +W +H+R+LNF  V++ H  + +  AI   L  W + D+LF IT+DN  SS+D   A L 
Subjt:  EKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVAN-HKGDTIGRAIEKCLEGWGI-DRLFAITVDN-ASSNDATIAYLV

Query:  KKFKGRNELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTF
             +N L+L G+   +RC AHILN +  D +  +H  I  IR  +K++++SP+R + F + A + ++ +     +DV T+WN+T  ML  A+  ++ F
Subjt:  KKFKGRNELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTF

Query:  ERLEERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLL
          LE  D N  +   A    +    C    YL LL
Subjt:  ERLEERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLL

Q75HY5 Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 32.1e-2632.31Show/hide
Query:  RVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVAN-HKGDTIGRAIEKCLEGWGI-DRLFAITVDN-ASSNDATIAYLVKKFKGRNE-LVLD
        R+ LT   W + Q + Y+ + A FID +W +H+R++NF  V++ H  +++  AI   L  W + D+LF IT+DN  SS+D   A ++     + + +++ 
Subjt:  RVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVAN-HKGDTIGRAIEKCLEGWGI-DRLFAITVDN-ASSNDATIAYLVKKFKGRNE-LVLD

Query:  GEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLEERD
        G+   +RC AHILN +  D +  +H  I  IR  +K++++S      F + A + ++ +     +DV T+WN+T  ML  A+  Q+ F  LE  D
Subjt:  GEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLEERD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18560.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain9.6e-1423.11Show/hide
Query:  LKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVANHKGDT-IGRAIEKCLEGWGI-DRLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFK
        +K  L     +V +T   W S +NI Y+ +T  +ID++W+ H+ +L+ C++    G + I  ++ K L+ + I DR+   T DN+ +       L + F 
Subjt:  LKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVANHKGDT-IGRAIEKCLEGWGI-DRLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFK

Query:  GRNELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLE
        G+  L     F +I C A  LN I+ + L  +   I ++R   + + +S      F       +      P +D  +RW+    M++   K  K+ + + 
Subjt:  GRNELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLE

Query:  ERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLLTWWKVNS
         ++ +  +  +     E     +   YLDL ++ K  +
Subjt:  ERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLLTWWKVNS

AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain1.0e-2330.3Show/hide
Query:  RVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVANHKGD-TIGRAIEKCLEGWGID-RLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFKGRNELVLDGE
        R CLT D WTS   + Y+ ITAH+ID DW + K++LN    +  + D  +  A+  C+  WG++ +LF +T ++ +SN A +  +  +   +N  +LDG+
Subjt:  RVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVANHKGD-TIGRAIEKCLEGWGID-RLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFKGRNELVLDGE

Query:  FIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLEERDPNDAK
         +   C A     +  D L+     I  IR+ VK+V++S +  + F +  ++ ++ ++   ++D  T+WN+T  ML  A + ++ F  L+  DP+  K
Subjt:  FIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCPTMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLEERDPNDAK

AT3G42170.1 BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain2.0e-1135.11Show/hide
Query:  ERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTFQTAQALICAHNWI
        E    + K+E+ +YLDET +  + +   D+L WWK N  ++  +S++A+DI SI +S    +  F    R +D +++SL  +T +ALICA  W+
Subjt:  ERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTFQTAQALICAHNWI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ACTCCGTCGACATCTTCTCTTCGTCTGCATCGGCGTCGGCATCAAATCTTCATCTTCATCTCTTCGCCACTCCATCGTATTCATCCTCCGATTACAGCTTCCTCAAGCTT
TCTTGTAACCTTCAAGATCTTCAGATTCTCAGGAGAAAAAAAGTTAAAAAATGCATTAACTCGAAGTGGCCAAAGAGTTTGTTTAACAACGGATACGTGGACTTCTGTGC
AAAATATTAATTATCTGGTTATAACGGCTCATTTCATTGATGATGATTGGAACTTGCACAAAAGAATTTTGAACTTTTGTCAAGTAGCTAATCATAAAGGAGATACCATA
GGTAGAGCCATTGAAAAGTGCTTAGAAGGTTGGGGTATTGATAGGCTCTTTGCTATAACGGTTGATAATGCGAGTTCAAATGATGCAACCATTGCGTACTTGGTTAAAAA
GTTTAAAGGCAGAAATGAGTTGGTGTTGGATGGTGAATTTATTCACATTAGATGTTGTGCCCATATTCTTAATTTAATTGTTAGTGATGCCTTAAAAGATTTGCATGTGT
CTATCATTCGAATCAGAAATGTTGTGAAGTATGTTAGGTCATCTCCTGCTAGATTGCAAATATTTAAAGATTTTGCTAAAGAAGATAAGATGTCAACAAAAAATTGTCCT
ACAATGGATGTTCCGACACGATGGAATTCTACTTTGACTATGTTGGATAGAGCAATTAAGTGTCAAAAGACTTTTGAAAGATTAGAGGAGCGTGACCCTAATGATGCTAA
AACAGAGGTAGCTCGTTATTTGGATGAGACTCGTATAGATTGTATGAGCGATGAATATTTAGATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCGTTA
GCCAAGTAGCTAAGGACATCTACAGTATTACTATATCAACTGTGCCTTCTGAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTTTT
CAAACTGCACAGGCACTCATTTGTGCTCATAATTGGATTCAGTCTAAACCTTTGAATGACATGATTGAAGAAATTGACGGGGCTGAAGAAATTGATGAAGGAAAGGAGAT
GGAAGCTGCATTTGAGAATTTGAATAATGACTCTATGCACAGTGATGGAAGCACTTCTTTAAGAATGACAGAACCAGATCCCAGTGGGATGTTCTCTCGGATGGCAATCC
AGTTCAAGAGGTTGCTCACATATCCAACGAAGAAGGAGGAGGAGGGGGAAAAAGAACGACCCGACCCGATCCATTCGACCCGACCCGAATATGGGTCGGGTCGGGTCGGG
CTCTGTTTCAGATTTAATCCTGCATTTCGGGTTAGGTTGAAGAAAACCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACTCCGTCGACATCTTCTCTTCGTCTGCATCGGCGTCGGCATCAAATCTTCATCTTCATCTCTTCGCCACTCCATCGTATTCATCCTCCGATTACAGCTTCCTCAAGCTT
TCTTGTAACCTTCAAGATCTTCAGATTCTCAGGAGAAAAAAAGTTAAAAAATGCATTAACTCGAAGTGGCCAAAGAGTTTGTTTAACAACGGATACGTGGACTTCTGTGC
AAAATATTAATTATCTGGTTATAACGGCTCATTTCATTGATGATGATTGGAACTTGCACAAAAGAATTTTGAACTTTTGTCAAGTAGCTAATCATAAAGGAGATACCATA
GGTAGAGCCATTGAAAAGTGCTTAGAAGGTTGGGGTATTGATAGGCTCTTTGCTATAACGGTTGATAATGCGAGTTCAAATGATGCAACCATTGCGTACTTGGTTAAAAA
GTTTAAAGGCAGAAATGAGTTGGTGTTGGATGGTGAATTTATTCACATTAGATGTTGTGCCCATATTCTTAATTTAATTGTTAGTGATGCCTTAAAAGATTTGCATGTGT
CTATCATTCGAATCAGAAATGTTGTGAAGTATGTTAGGTCATCTCCTGCTAGATTGCAAATATTTAAAGATTTTGCTAAAGAAGATAAGATGTCAACAAAAAATTGTCCT
ACAATGGATGTTCCGACACGATGGAATTCTACTTTGACTATGTTGGATAGAGCAATTAAGTGTCAAAAGACTTTTGAAAGATTAGAGGAGCGTGACCCTAATGATGCTAA
AACAGAGGTAGCTCGTTATTTGGATGAGACTCGTATAGATTGTATGAGCGATGAATATTTAGATTTGCTAACTTGGTGGAAGGTGAATTCCTCTCGATTTAAGATCGTTA
GCCAAGTAGCTAAGGACATCTACAGTATTACTATATCAACTGTGCCTTCTGAGTCCGCCTTTAGCACTGGAGGACGGGTGTTAGATTCTTTTCGAAGTTCTTTAACTTTT
CAAACTGCACAGGCACTCATTTGTGCTCATAATTGGATTCAGTCTAAACCTTTGAATGACATGATTGAAGAAATTGACGGGGCTGAAGAAATTGATGAAGGAAAGGAGAT
GGAAGCTGCATTTGAGAATTTGAATAATGACTCTATGCACAGTGATGGAAGCACTTCTTTAAGAATGACAGAACCAGATCCCAGTGGGATGTTCTCTCGGATGGCAATCC
AGTTCAAGAGGTTGCTCACATATCCAACGAAGAAGGAGGAGGAGGGGGAAAAAGAACGACCCGACCCGATCCATTCGACCCGACCCGAATATGGGTCGGGTCGGGTCGGG
CTCTGTTTCAGATTTAATCCTGCATTTCGGGTTAGGTTGAAGAAAACCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
TPSTSSLRLHRRRHQIFIFISSPLHRIHPPITASSSFLVTFKIFRFSGEKKLKNALTRSGQRVCLTTDTWTSVQNINYLVITAHFIDDDWNLHKRILNFCQVANHKGDTI
GRAIEKCLEGWGIDRLFAITVDNASSNDATIAYLVKKFKGRNELVLDGEFIHIRCCAHILNLIVSDALKDLHVSIIRIRNVVKYVRSSPARLQIFKDFAKEDKMSTKNCP
TMDVPTRWNSTLTMLDRAIKCQKTFERLEERDPNDAKTEVARYLDETRIDCMSDEYLDLLTWWKVNSSRFKIVSQVAKDIYSITISTVPSESAFSTGGRVLDSFRSSLTF
QTAQALICAHNWIQSKPLNDMIEEIDGAEEIDEGKEMEAAFENLNNDSMHSDGSTSLRMTEPDPSGMFSRMAIQFKRLLTYPTKKEEEGEKERPDPIHSTRPEYGSGRVG
LCFRFNPAFRVRLKKT