; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C030406 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C030406
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionTranspos_assoc domain-containing protein
Genome locationchr04:13999344..14000206
RNA-Seq ExpressionMELO3C030406
SyntenyMELO3C030406
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR029480 - Transposase-associated domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0040340.1 hypothetical protein E6C27_scaffold460G00450 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-4474.8Show/hide
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TYJ95864.1 uncharacterized protein E5676_scaffold110G001580 [Cucumis melo var. makuwa]9.3e-4575.41Show/hide
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TYJ99928.1 uncharacterized protein E5676_scaffold701G00540 [Cucumis melo var. makuwa]9.3e-4575.41Show/hide
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TYK28867.1 uncharacterized protein E5676_scaffold381G00070 [Cucumis melo var. makuwa]9.3e-4575.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T400 Transpos_assoc domain-containing protein3.9e-5792.62Show/hide
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A0A5A7TAJ7 Uncharacterized protein5.9e-4574.8Show/hide
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A0A5D3BA83 Uncharacterized protein4.5e-4575.41Show/hide
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A0A5D3BP89 Transpos_assoc domain-containing protein4.5e-4575.41Show/hide
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A0A5D3DY98 Transpos_assoc domain-containing protein4.5e-4575.41Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATAAGGGTTGGATGAAACTTAGGAATAAGTTTTCCCTTGAGTATAGAGAGGGAGTCACCCAATTTTTAGAAGTTGCCAAGTTTCTCGTTGATGCCTACAGACGAAT
AAGGTGTCCATGCAAGAGATGTATGAACTCAAATTGGAACTCATTAGAGGGTGTGGAACGACGTCTACTGACTATTGGAACATCTCCCTACTACACAGAATGGGTGTATC
ATGGAGAGTCAGCTAGCTTTAAAGGTACAGAAAACTTTGAGGAAGGAACTAGTAGTAGGCAGCTTGATGAAGAAGATAGTATGTTTGGTATGCTGAATGATTTACAAGCC
CTGATTGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGTTGTTGATTTGGGATGGCTATCCTATAGTTATGGGACTTAAACGATGGATAAGGGTTGGATGAAACTTAGGAATAAGTTTTCCCTTGAGTATAGAGAGGGAGTCACC
CAATTTTTAGAAGTTGCCAAGTTTCTCGTTGATGCCTACAGACGAATAAGGTGTCCATGCAAGAGATGTATGAACTCAAATTGGAACTCATTAGAGGGTGTGGAACGACG
TCTACTGACTATTGGAACATCTCCCTACTACACAGAATGGGTGTATCATGGAGAGTCAGCTAGCTTTAAAGGTACAGAAAACTTTGAGGAAGGAACTAGTAGTAGGCAGC
TTGATGAAGAAGATAGTATGTTTGGTATGCTGAATGATTTACAAGCCCTGATTGAATAGGAAGAGGAAACAGAGGAATGTTGTTTGGAGGATGAAATGTCGAGGAATATT
GAGGTAAATATAGATGAAGATATAACAAACATATTTTAGGACTTATTGAATGAAACACGTAATGAGTTGTACCTCGATTGTTCTGAATTTTCCTCCTTGAATTTTTTGAT
TAAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LIE