; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C030705 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C030705
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
Genome locationchr12:19752639..19753360
RNA-Seq ExpressionMELO3C030705
SyntenyMELO3C030705
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR029480 - Transposase-associated domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TYJ99928.1 uncharacterized protein E5676_scaffold701G00540 [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-4886.24Show/hide
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TYK16353.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]5.3e-4887.04Show/hide
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TYK23363.1 hypothetical protein E5676_scaffold142G004270 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-4785.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UMP4 Uncharacterized protein6.8e-4987.96Show/hide
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A0A5D3BA83 Uncharacterized protein2.0e-4886.24Show/hide
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A0A5D3BP89 Transpos_assoc domain-containing protein2.0e-4886.24Show/hide
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A0A5D3CWU5 CACTA en-spm transposon protein2.6e-4887.04Show/hide
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A0A5D3DIE6 Uncharacterized protein7.5e-4885.19Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAGACAAGGGTTGGATGAAAATTAGAAATAAGTTCTCCCTTGAGTATAGACAAGGAGTGACCCAATTTTTAGAATTTGTCAAGTTTCACGTTGATGCTTAC
GTACGATTAAGGTGTCCATGCAAGAGATGTTTGAATTTAAATTGGAGCTCATTAGAGGGTGTGGAACGACATCTTTTGACTATTGGAATATCCCCCTACTACATA
GAATGGGTGTATCATGAAGAGTCATTAAGCTTTAGAGGTATAGAAAACTTTGAGAAAGTAACTAGTAGTAATAATCCTTTTAATGAAGGAACTAGTAGTACGCAA
TTTAATGAGAAGATGATATGTTTGGTATGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTGTGTTGGCTATCCTGCAATTATAGGACTTAAATGATAGACAAGGGTTGGATGAAAATTAGAAATAAGTTCTCCCTTGAGTATAGACAAGGAGTGACCCAATT
TTTAGAATTTGTCAAGTTTCACGTTGATGCTTACGTACGATTAAGGTGTCCATGCAAGAGATGTTTGAATTTAAATTGGAGCTCATTAGAGGGTGTGGAACGACA
TCTTTTGACTATTGGAATATCCCCCTACTACATAGAATGGGTGTATCATGAAGAGTCATTAAGCTTTAGAGGTATAGAAAACTTTGAGAAAGTAACTAGTAGTAA
TAATCCTTTTAATGAAGGAACTAGTAGTACGCAATTTAATGAGAAGATGATATGTTTGGTATGCTAAATGATTTACAAGCCCCGATTGAATAGGAAGAGGAAATA
GAGGAACGTCGTTTGGAAGATGAAATACGGATGAATGTTGGGGTAAATATAGATGAAGATAGAACAAACATATTTTAGGACTTACTGAATGAAGCAAGTAATGAG
TTGTACCCCGGTTGTTCTAAATTTTCGTCGTTGAATTTGTTGGCTAAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FNEKMICLVC