CuGenDBv2

Gene ID	MELO3C031852
Organism	Cucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
Description	Protein Ycf2
Genome location	chr02:7053234..7053739
RNA-Seq Expression	MELO3C031852
Synteny	MELO3C031852
Gene Ontology terms	GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR008543 - Uncharacterised protein family Ycf2

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

ASY96395.1 Ycf2 [Cucumis melo subsp. agrestis]

1.3e-90

99.4

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

ASY96830.1 Ycf2 [Cucumis melo var. momordica]

3.3e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

QRW36598.1 hypothetical chloroplast RF21 [Cucumis melo]

3.3e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

YP_004841827.1 hypothetical chloroplast RF21 [Cucumis melo subsp. melo]

3.3e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

YP_009317429.1 Ycf2 [Coccinia grandis]

1.3e-90

99.4

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S4EU72 Protein Ycf2

1.6e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

A0A249RYX8 Protein Ycf2

1.6e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

A0A249RZ46 Protein Ycf2

1.6e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

A0A249RZN4 Protein Ycf2

1.6e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

G3ETW1 Protein Ycf2

1.6e-91

100

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A4GYV4 Protein Ycf2

4.4e-86

93.45

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNH LPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELH+GSNP +RSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFK ITYLQNTVSIHPISSDPGCDMV KDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFHDRN  GYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

B1A978 Protein Ycf2

7.5e-86

93.45

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNH LPEEIEEFLGNPTR IRSFFSDRWSELH+GSNP +RSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSD GCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFHDRNR G TLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

Q09MB4 Protein Ycf2

5.7e-86

92.86

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MN H LPEEIEEFLGNP RSIRSFFSDRWSELH+GSNP +RSTRDQKLLKKE+DVSFVPS RSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFHDRNR G TLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

Q14F97 Protein Ycf2

4.4e-86

93.45

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNH LPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELH+GSNP +RSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFK ITYLQNTVSIHPISSDPGCDMV KDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFHDRN  GYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

Q2QD30 Protein Ycf2

1.1e-89

98.17

Show/hide

Query:  PLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMD
        PLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPI+RSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMD
Subjt:  PLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMD

Query:  SSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        SSNKISFL KNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  SSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00860.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core

1.0e-82

90.48

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNH LPEE EEFLGNPTR+IRSFFSDRWSELH+GSNP +RSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSD GCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFH+R R GYTL H  ESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

ATCG01280.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core

1.0e-82

90.48

Show/hide

Query:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE
        MNNH LPEE EEFLGNPTR+IRSFFSDRWSELH+GSNP +RSTRDQKLLKKEQDVSFVPS RSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSD GCDMVPKDE
Subjt:  MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDE

Query:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
        LDMDSSNKISFLNKNPF  LFHLFH+R R GYTL H  ESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF
Subjt:  LDMDSSNKISFLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATAATCATCCGCTTCCGGAAGAAATCGAAGAATTTCTCGGGAATCCTACAAGATCCATTCGTTCTTTTTTCTCTGACAGATGGTCAGAACTTCATATGGGTTCGAA
TCCTATTCAGAGGTCCACTAGAGATCAGAAATTGTTGAAGAAAGAACAAGATGTTTCTTTTGTCCCTTCCAGTCGATCGGAAAATAAAGAAATAGTTAATATATTCAAGA
TAATTACGTATTTACAAAATACCGTCTCAATTCATCCTATTTCATCAGATCCGGGATGTGATATGGTTCCGAAGGATGAACTGGATATGGACAGTTCCAATAAGATTTCA
TTCTTGAACAAAAATCCATTTATTTATTTATTTCATCTATTCCATGACCGGAACAGGAGGGGATACACGTTACACCACGATTTTGAATCAGAAGAGAGATTTCAAGAAAT
GGCAGATCTATTCACTCTATCAATAACCGAGCCGGATCTGGTGTATCATAAGGGATTTGCCTTT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNNHPLPEEIEEFLGNPTRSIRSFFSDRWSELHMGSNPIQRSTRDQKLLKKEQDVSFVPSSRSENKEIVNIFKIITYLQNTVSIHPISSDPGCDMVPKDELDMDSSNKIS
FLNKNPFIYLFHLFHDRNRRGYTLHHDFESEERFQEMADLFTLSITEPDLVYHKGFAF

MELO3C031852 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome