; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C031976 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C031976
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionDDE Tnp4 domain-containing protein
Genome locationchr06:11503927..11504219
RNA-Seq ExpressionMELO3C031976
SyntenyMELO3C031976
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037135.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-44100Show/hide
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KAG6600319.1 Protein ALP1-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-2470.37Show/hide
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KAG7030976.1 Protein ALP1-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.5e-2470.37Show/hide
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KGN57516.1 hypothetical protein Csa_011580 [Cucumis sativus]1.8e-4195.88Show/hide
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XP_038880641.1 protein ANTAGONIST OF LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1-like [Benincasa hispida]3.1e-4194.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBX6 DDE Tnp4 domain-containing protein8.9e-4295.88Show/hide
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A0A5D3CRB2 Putative nuclease HARBI16.6e-45100Show/hide
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A0A6J1D7F1 protein ALP1-like1.2e-2267.29Show/hide
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A0A6J1FNZ2 protein ALP1-like1.7e-2470.37Show/hide
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        HL RTR+P
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A0A6J1J0M5 protein ALP1-like1.7e-2470.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTCTCCTCGTTTAGCTGCTTTACTCTCTTCTTTGATCTCCCAACTCCTTCTCCTCCTCTTCCTCCTCTTCCCTTCCTCCAACCCACATTCCCTTTTCTCTAATTC
CACTCCCGATTCCAGTTTCTATGCCAATCTCTTCACCCACTTCCTCTTTTCCCAGGATTTTGCCGCCTCCCTTCCCTTTCTCTCTGTTTCCCGCAAGAGGAAGAGAACCA
ATCCCCCCGACCATCTCGAATTGGGGTCATCCCATGGACGAGTTCATCATCTGTTTCGGACTCGGACTCCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTCTCCTCGTTTAGCTGCTTTACTCTCTTCTTTGATCTCCCAACTCCTTCTCCTCCTCTTCCTCCTCTTCCCTTCCTCCAACCCACATTCCCTTTTCTCTAATTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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