; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C032198 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C032198
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
Genome locationchr06:26240300..26242818
RNA-Seq ExpressionMELO3C032198
SyntenyMELO3C032198
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005488 - binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TYK18447.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]4.2e-4660.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SSV3 CACTA en-spm transposon protein2.5e-4477.42Show/hide
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A0A5A7TBG7 CACTA en-spm transposon protein4.5e-5466.85Show/hide
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A0A5A7TCP3 CACTA en-spm transposon protein9.5e-5264.43Show/hide
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A0A5D3D4H5 CACTA en-spm transposon protein2.0e-4660.82Show/hide
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A0A5D3DFK0 CACTA en-spm transposon protein6.1e-5170.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGATTGACACTTCCTCTACGACCAGTATATCAGCCGTGCATTCCAGGAGCAATCATGGACGAACAAGGTTGCTAGACAGAAGTAGCCTTACAATCATAGTAGCGGG
TCCAAATCGTTTCTACAACGACAGTACGAGCTCGCTGAGAGAAAAGAGGAGCCAGTCGATCGTGTGGAGTTGTTCCAAGAAACACACGTTCAAGTTGGAACGTTCGTGTC
GCAGGCCGCGGAGGATGCGCTTACGACCAGGCTACTCAAAAGGTCTTGGTTGGGGACTCAAGCCGAAGGCCCGTAGAACGGCAAGTGCAAGCAGTTCGTCGACATCTTGT
TCGCAGTCCATAGAAAAAGAGATTGAATTACAAGCTAAATTTCATGAAGCTTTGGAACGGATTGAAGTACAAGATAGAAATCACCAAGCGTTAGCTTCACAAGTGGAAAA
CATGAAAAAGATAATAAAAGAAATAACTCGTGCACAACAGGGACCACCACATGATCCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCGTCAGGAATTTCCTTTTTCCCGACGCCTTTTTGGGGATTTCCCGACGCAGTCGCGCGACGTCGGAAAATCCCCTTTATAATCGTTTCAGTTCTGTAAAATACAG
AACTGAAACCGAGAGGGGAAAAGAAAGGAGATCGAAGCGCTTCGTCCGTCGCCGCTGTTCAGCCGTCGTCTGCTACTTTAGGGGTGGTAGTAGGATAGCCTGAAGGTCTT
CTTCTCAACAACATACGACTCCGACTCTTAGGAGCCGTGCACAGTCTCGACTCTTGGAGTTAGAGCGCCACGTTGGAATAAATGGGTGCATTCCGATGACGATCGCCTCT
AGAGCAGAGAAGCTTATTTCCCCACACGCCGTTCGCTTCAGCCAGGCGATAGGCACGGACGTTGGGAGAGAATACATTGAGGTCGTGAAGGGCGACCTCCAGCGATTGTT
TGTGCTTGATTTTAATGATCAAGCAATGAATGCTCACGACCTTTAAAGAGTTCTGGGCTCACTGTCACAAACATTTCAGAAAGTACAGCAACTTGGAGGAGGCTCGTGCC
AACCCACCAAACACATTGGTTGGACGTGATGAGGATTGACACTTCCTCTACGACCAGTATATCAGCCGTGCATTCCAGGAGCAATCATGGACGAACAAGGTTGCTAGACA
GAAGTAGCCTTACAATCATAGTAGCGGGTCCAAATCGTTTCTACAACGACAGTACGAGCTCGCTGAGAGAAAAGAGGAGCCAGTCGATCGTGTGGAGTTGTTCCAAGAAA
CACACGTTCAAGTTGGAACGTTCGTGTCGCAGGCCGCGGAGGATGCGCTTACGACCAGGCTACTCAAAAGGTCTTGGTTGGGGACTCAAGCCGAAGGCCCGTAGAACGGC
AAGTGCAAGCAGTTCGTCGACATCTTGTTCGCAGTCCATAGAAAAAGAGATTGAATTACAAGCTAAATTTCATGAAGCTTTGGAACGGATTGAAGTACAAGATAGAAATC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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