; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C033233 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C033233
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionProtein Ycf2-like
Genome locationchr08:12527365..12530481
RNA-Seq ExpressionMELO3C033233
SyntenyMELO3C033233
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR015410 - Domain of unknown function DUF1985


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0041558.1 protein Ycf2-like [Cucumis melo var. makuwa]3.1e-13360.74Show/hide
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        EEEEGET +GED NSSTSEIP DT+KR K  EKGKKVK +KKE+KAREDRRRK KAPM PEKSE                                    
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        VMFNIST GT+DDRIKM KLYFLESFLI KQECL V+WDHIIMVDDDEVFDGY WGRV FELLV+FMNR +CSKGQT IS+GG   F  + L       L
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        ++ PNFFATRI NEV  IINWAADTQPKWKDLKQKVFDSPTLEVS MLATP +VGMP+F PFI+TEKDILKEAEDELRK KNSD
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KAA0047596.1 protein Ycf2-like [Cucumis melo var. makuwa]4.0e-21386.74Show/hide
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        QLLLHLIQRMCKPKSTSQLQFLIGGRVLRFGLREFALITGLRCHEIPDINHEDI GGGRLK VYFENL+TVT QYLNVMFNISTTGT+DDRIKMAKLYFL
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        ESFLI KQEC SVDWDHIIMVDDDEVFDGYPWGRVAFELLV+FMNR VCSKGQTGISMGG   P           L++PPNFF TRISNEVP IIN A D
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        TQPKWKDLKQKVFDSPTLEVSPMLATPDEVGMPFF PFI+TEKDILKEAEDELRKNKN D
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KAA0051565.1 protein Ycf2-like [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-14465.49Show/hide
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        MAEG  GKRESPGTSKKRVRTETKK+EATVQKKQRIKSLVSRK VYR KGKKQK +EG                                          
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               KVKAVKKE+KAREDRRRKGKAPMNPEKSEDSVYLMC+ERRNEPLKINLHIK+TVIEKIKENLGDRLIN                         
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                                            RC E+P INHEDIKGGGRLK VYFENL+TVT QYLNVMFNIST GT+DD+IKMAKLYFLE FLI
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         KQECLSVDWD+IIMVDDDEVFDGYPWGRVAFELLV+FMNRAVCSKGQTGIS+ G   P           L++PPNFFATRISNEVP IINWAAD QPKW
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TYJ98210.1 protein Ycf2-like [Cucumis melo var. makuwa]5.2e-12059.87Show/hide
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        F  RTEDIMAEGSGGKR+SPGTSKKRVRTETKK+EATVQKKQRIK+L    S K     + ++ KE E  +D E E +  +EE+DEEEEGET VGED NS
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        STSEIPPDTRKRSKAREKGKKVKAVKKEE AREDRRRKGKAPMNPEKSE                                                   
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                             +WDHIIMVDDD+VFDGYPW RVAFELLV+FMNR VCSKGQT                                     A
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TYK09852.1 protein Ycf2-like [Cucumis melo var. makuwa]3.6e-12188.1Show/hide
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        KQKVFDSPTLEVSPMLATPDEVGMPFF PF +TEKDILKEAEDELRKNKN D
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TF74 Protein Ycf2-like1.5e-13360.74Show/hide
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        EEEEGET +GED NSSTSEIP DT+KR K  EKGKKVK +KKE+KAREDRRRK KAPM PEKSE                                    
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A0A5A7U047 Protein Ycf2-like1.9e-21386.74Show/hide
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        QLLLHLIQRMCKPKSTSQLQFLIGGRVLRFGLREFALITGLRCHEIPDINHEDI GGGRLK VYFENL+TVT QYLNVMFNISTTGT+DDRIKMAKLYFL
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        ESFLI KQEC SVDWDHIIMVDDDEVFDGYPWGRVAFELLV+FMNR VCSKGQTGISMGG   P           L++PPNFF TRISNEVP IIN A D
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A0A5A7UD30 Protein Ycf2-like1.5e-14465.49Show/hide
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        MAEG  GKRESPGTSKKRVRTETKK+EATVQKKQRIKSLVSRK VYR KGKKQK +EG                                          
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               KVKAVKKE+KAREDRRRKGKAPMNPEKSEDSVYLMC+ERRNEPLKINLHIK+TVIEKIKENLGDRLIN                         
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Query:  LIQRMCKPKSTSQLQFLIGGRVLRFGLREFALITGLRCHEIPDINHEDIKGGGRLKEVYFENLETVTMQYLNVMFNISTTGTNDDRIKMAKLYFLESFLI
                                            RC E+P INHEDIKGGGRLK VYFENL+TVT QYLNVMFNIST GT+DD+IKMAKLYFLE FLI
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         KQECLSVDWD+IIMVDDDEVFDGYPWGRVAFELLV+FMNRAVCSKGQTGIS+ G   P           L++PPNFFATRISNEVP IINWAAD QPKW
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A0A5D3BEG7 Protein Ycf2-like2.5e-12059.87Show/hide
Query:  FLHRTEDIMAEGSGGKRESPGTSKKRVRTETKKKEATVQKKQRIKSL---VSRKRVYRGKGKKQKEVEGKDDTESESE--KEEKDEEEEGETVVGEDLNS
        F  RTEDIMAEGSGGKR+SPGTSKKRVRTETKK+EATVQKKQRIK+L    S K     + ++ KE E  +D E E +  +EE+DEEEEGET VGED NS
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        STSEIPPDTRKRSKAREKGKKVKAVKKEE AREDRRRKGKAPMNPEKSE                                                   
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A0A5D3CEX9 Protein Ycf2-like1.7e-12188.1Show/hide
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Query:  KQKVFDSPTLEVSPMLATPDEVGMPFFTPFIKTEKDILKEAEDELRKNKNSD
        KQKVFDSPTLEVSPMLATPDEVGMPFF PF +TEKDILKEAEDELRKNKN D
Subjt:  KQKVFDSPTLEVSPMLATPDEVGMPFFTPFIKTEKDILKEAEDELRKNKNSD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31150.1 Domain of unknown function (DUF1985)1.0e-0923.44Show/hide
Query:  NPEKSEDSVYLMCFERRNEPLKINLHIKNTVIEKIKENL-GDRLINRFREGIFGHFLNLSIT--NQSSQLLLHLIQRMCKPKSTSQLQFLIGGRVLRFGL
        NP   E    + C+    +  ++N++ +   +  I   L G     R +   FG      +   + S +L+  L+ R    K   +L F+ GG  +RF +
Subjt:  NPEKSEDSVYLMCFERRNEPLKINLHIKNTVIEKIKENL-GDRLINRFREGIFGHFLNLSIT--NQSSQLLLHLIQRMCKPKSTSQLQFLIGGRVLRFGL

Query:  REFALITGLRCHEIPDIN----HEDIKGGGRLKEVYFENLETVTMQYLNVMFNISTTGTNDDRIKMAKLYFLESFLISKQECLSVDWDHIIMVDDDEVFD
        REF ++TGLRC ++P  +    H+D K       ++ E         L ++     +     ++ +A +  ++  ++   +   V  D + M++D + F 
Subjt:  REFALITGLRCHEIPDIN----HEDIKGGGRLKEVYFENLETVTMQYLNVMFNISTTGTNDDRIKMAKLYFLESFLISKQECLSVDWDHIIMVDDDEVFD

Query:  GYPWGRVAF
         YPWGR AF
Subjt:  GYPWGRVAF

AT4G08430.1 Ulp1 protease family protein1.3e-0430.08Show/hide
Query:  LIGGRVLRFGLREFALITGLRCHEIPDINHEDIKGGGRLKEVYFENLETVTMQYLNVMFNISTTGTNDDRI-KMAKLYFLESFLISKQECLSVDWDHII-
        LI  R +RF L EF  ITGL C    D+  E   G    K+ + E         + V  ++    T  +R+ +++K + LE  ++  + CL     H I 
Subjt:  LIGGRVLRFGLREFALITGLRCHEIPDINHEDIKGGGRLKEVYFENLETVTMQYLNVMFNISTTGTNDDRI-KMAKLYFLESFLISKQECLSVDWDHII-

Query:  -----------MVDDDEVFDGYPWGRVAFELLV
                    V D   F+ YPWGRVAF+ L+
Subjt:  -----------MVDDDEVFDGYPWGRVAFELLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TGCAACCACTCCCCATCTCAAATAAAACCCTGTCTTCCATCGAATTTTCACCCTTGCATCTTCTTCCGTATATTAGCTTCCACAGTCGCTTTTCCATCGCCAGTT
TTTCACCGTCTGCACGCCCTTTGTTTTCCGACCGTATCTTCCTTTCTGGTTTTTTCAGAGTTGATTTATCTTCCACAGTTGTTGTTGCACCGTCGTTTTTCCGCC
GTCTCACGCCTTTCTTCTTTCAATCGATTTGCACCGCGAATTGTGCAAAGTATCGGTGAGTTGTTCCTTCTGATCTTTGGATTCTTGCTCTGTTTTCTGCATAGA
ACAGAAGATATCATGGCAGAAGGTTCCGGGGGCAAAAGAGAGAGTCCAGGAACTTCAAAAAAGAGGGTGAGAACTGAAACGAAAAAAAAGGAAGCCACTGTCCAG
AAAAAACAACGGATTAAGAGTTTGGTCTCGAGGAAGAGAGTTTATAGGGGGAAAGGAAAAAAACAAAAGGAGGTTGAAGGAAAGGATGATACGGAAAGCGAAAGC
GAAAAGGAGGAGAAAGATGAAGAGGAGGAAGGCGAGACCGTCGTGGGTGAAGATTTGAATTCATCAACGAGTGAGATACCCCCAGATACTAGGAAAAGGAGCAAG
GCTCGAGAAAAGGGAAAGAAAGTGAAGGCTGTTAAAAAGGAAGAAAAGGCAAGAGAAGATAGAAGGAGAAAGGGAAAAGCTCCAATGAATCCGGAGAAATCAGAG
GACTCAGTGTACTTAATGTGTTTTGAAAGAAGAAACGAGCCTTTAAAAATCAATCTACACATTAAGAACACAGTAATAGAGAAAATTAAGGAAAATCTTGGAGAT
AGGCTTATTAATAGATTTAGGGAGGGGATATTTGGGCACTTTCTAAACCTCTCCATAACAAACCAATCCTCCCAATTGTTGTTGCACCTTATTCAGCGAATGTGC
AAACCCAAGTCGACTAGTCAGCTTCAATTTCTAATAGGAGGAAGGGTTCTGAGGTTTGGATTGAGAGAATTTGCACTTATAACAGGGTTAAGATGTCATGAGATT
CCTGATATTAACCATGAAGATATAAAGGGTGGTGGGCGGCTAAAAGAGGTATATTTTGAAAATCTTGAAACTGTGACGATGCAGTACTTGAATGTTATGTTCAAT
ATAAGTACCACTGGAACTAATGATGATAGGATAAAAATGGCCAAGCTGTACTTTCTGGAGAGTTTTTTGATCTCCAAACAAGAATGTCTAAGTGTAGATTGGGAT
CATATCATTATGGTAGACGATGATGAAGTATTTGATGGGTACCCGTGGGGTAGAGTTGCTTTTGAACTCTTAGTGGAATTCATGAATAGGGCAGTCTGTAGCAAG
GGGCAAACGGGTATTTCTATGGGGGGTTTATTTTCTCCATTCTCGCTTGGGCTTACAAGTCCGCCCAACTTTTTTGCAACGAGGATCTCCAATGAAGTCCCTGGG
ATTATAAATTGGGCGGCTGACACACAACCCAAATGGAAGGACTTAAAACAGAAAGTGTTCGATTCGCCAACGCTTGAAGTGTCTCCAATGCTGGCAACCCCAGAT
GAAGTGGGAATGCCATTCTTCACACCATTCATCAAGACAGAAAAAGACATACTCAAAGAAGCAGAGGATGAGCTTCGAAAGAACAAGAATTCTGACCAACATAGC
CTCTATTTCGCTGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAACCACTCCCCATCTCAAATAAAACCCTGTCTTCCATCGAATTTTCACCCTTGCATCTTCTTCCGTATATTAGCTTCCACAGTCGCTTTTCCATCGCCAGT
TTTTCACCGTCTGCACGCCCTTTGTTTTCCGACCGTATCTTCCTTTCTGGTTTTTTCAGAGTTGATTTATCTTCCACAGTTGTTGTTGCACCGTCGTTTTTCCGC
CGTCTCACGCCTTTCTTCTTTCAATCGATTTGCACCGCGAATTGTGCAAAGTATCGGTGAGTTGTTCCTTCTGATCTTTGGATTCTTGCTCTGTTTTCTGCATAG
AACAGAAGATATCATGGCAGAAGGTTCCGGGGGCAAAAGAGAGAGTCCAGGAACTTCAAAAAAGAGGGTGAGAACTGAAACGAAAAAAAAGGAAGCCACTGTCCA
GAAAAAACAACGGATTAAGAGTTTGGTCTCGAGGAAGAGAGTTTATAGGGGGAAAGGAAAAAAACAAAAGGAGGTTGAAGGAAAGGATGATACGGAAAGCGAAAG
CGAAAAGGAGGAGAAAGATGAAGAGGAGGAAGGCGAGACCGTCGTGGGTGAAGATTTGAATTCATCAACGAGTGAGATACCCCCAGATACTAGGAAAAGGAGCAA
GGCTCGAGAAAAGGGAAAGAAAGTGAAGGCTGTTAAAAAGGAAGAAAAGGCAAGAGAAGATAGAAGGAGAAAGGGAAAAGCTCCAATGAATCCGGAGAAATCAGA
GGACTCAGTGTACTTAATGTGTTTTGAAAGAAGAAACGAGCCTTTAAAAATCAATCTACACATTAAGAACACAGTAATAGAGAAAATTAAGGAAAATCTTGGAGA
TAGGCTTATTAATAGATTTAGGGAGGGGATATTTGGGCACTTTCTAAACCTCTCCATAACAAACCAATCCTCCCAATTGTTGTTGCACCTTATTCAGCGAATGTG
CAAACCCAAGTCGACTAGTCAGCTTCAATTTCTAATAGGAGGAAGGGTTCTGAGGTTTGGATTGAGAGAATTTGCACTTATAACAGGGTTAAGATGTCATGAGAT
TCCTGATATTAACCATGAAGATATAAAGGGTGGTGGGCGGCTAAAAGAGGTATATTTTGAAAATCTTGAAACTGTGACGATGCAGTACTTGAATGTTATGTTCAA
TATAAGTACCACTGGAACTAATGATGATAGGATAAAAATGGCCAAGCTGTACTTTCTGGAGAGTTTTTTGATCTCCAAACAAGAATGTCTAAGTGTAGATTGGGA
TCATATCATTATGGTAGACGATGATGAAGTATTTGATGGGTACCCGTGGGGTAGAGTTGCTTTTGAACTCTTAGTGGAATTCATGAATAGGGCAGTCTGTAGCAA
GGGGCAAACGGGTATTTCTATGGGGGGTTTATTTTCTCCATTCTCGCTTGGGCTTACAAGTCCGCCCAACTTTTTTGCAACGAGGATCTCCAATGAAGTCCCTGG
GATTATAAATTGGGCGGCTGACACACAACCCAAATGGAAGGACTTAAAACAGAAAGTGTTCGATTCGCCAACGCTTGAAGTGTCTCCAATGCTGGCAACCCCAGA
TGAAGTGGGAATGCCATTCTTCACACCATTCATCAAGACAGAAAAAGACATACTCAAAGAAGCAGAGGATGAGCTTCGAAAGAACAAGAATTCTGACCAACATAG
CCTCTATTTCGCTGAATAGAGGCATACCGTCTACAAGTGAGATTAATGTCCTGAGGAAAATGGTAGAGAAGATTGAGATTAGCCAACAGAGGATGGAGACGAGTG
TGGAAGGTCTTCTTGAGTTTCTTAAATCTGTGGAGTTGAAAATGAATAATCGGTTTGAAGAACTAGTGCAGAAGATGAATGGAATAATGGAAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
CNHSPSQIKPCLPSNFHPCIFFRILASTVAFPSPVFHRLHALCFPTVSSFLVFSELIYLPQLLLHRRFSAVSRLSSFNRFAPRIVQSIGELFLLIFGFLLCFLHR
TEDIMAEGSGGKRESPGTSKKRVRTETKKKEATVQKKQRIKSLVSRKRVYRGKGKKQKEVEGKDDTESESEKEEKDEEEEGETVVGEDLNSSTSEIPPDTRKRSK
AREKGKKVKAVKKEEKAREDRRRKGKAPMNPEKSEDSVYLMCFERRNEPLKINLHIKNTVIEKIKENLGDRLINRFREGIFGHFLNLSITNQSSQLLLHLIQRMC
KPKSTSQLQFLIGGRVLRFGLREFALITGLRCHEIPDINHEDIKGGGRLKEVYFENLETVTMQYLNVMFNISTTGTNDDRIKMAKLYFLESFLISKQECLSVDWD
HIIMVDDDEVFDGYPWGRVAFELLVEFMNRAVCSKGQTGISMGGLFSPFSLGLTSPPNFFATRISNEVPGIINWAADTQPKWKDLKQKVFDSPTLEVSPMLATPD
EVGMPFFTPFIKTEKDILKEAEDELRKNKNSDQHSLYFAE