; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C033672 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C033672
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionPlant transposase
Genome locationchr12:10803012..10803964
RNA-Seq ExpressionMELO3C033672
SyntenyMELO3C033672
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0032201.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-87100Show/hide
Query:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
        DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
Subjt:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH

Query:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

KAA0042856.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]5.1e-8598.2Show/hide
Query:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
        DRIEQNR ASSSSIIDDAISRVLGPDQ YVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSS H
Subjt:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH

Query:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

KAA0052811.1 transposase [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-7992.86Show/hide
Query:  NDRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSST
        N+RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQ YV+GLGF VTLSKVSTSIQ DKTITSLE KCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPS  
Subjt:  NDRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSST

Query:  HIRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        HIRT TPTPIINSPPSVTTNTP+KCLLL WIGSGEVIAEGRWS NDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  HIRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

KAA0057491.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]3.9e-8598.2Show/hide
Query:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
        DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQ YVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVAS LKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSS H
Subjt:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH

Query:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

TYK28558.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-8095.78Show/hide
Query:  RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTHI
        RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLG DQ YVRGLGFGVTLSKVSTSI KDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSS HI
Subjt:  RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTHI

Query:  RTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        RTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLD +GSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLG NAVRVWVDTV
Subjt:  RTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SRN7 Plant transposase2.6e-87100Show/hide
Query:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
        DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
Subjt:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH

Query:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

A0A5A7TLJ2 Plant transposase2.5e-8598.2Show/hide
Query:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
        DRIEQNR ASSSSIIDDAISRVLGPDQ YVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSS H
Subjt:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH

Query:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

A0A5A7UH01 Transposase1.2e-7992.86Show/hide
Query:  NDRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSST
        N+RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQ YV+GLGF VTLSKVSTSIQ DKTITSLE KCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPS  
Subjt:  NDRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSST

Query:  HIRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        HIRT TPTPIINSPPSVTTNTP+KCLLL WIGSGEVIAEGRWS NDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  HIRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

A0A5A7UVF2 Plant transposase1.9e-8598.2Show/hide
Query:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH
        DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQ YVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVAS LKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSS H
Subjt:  DRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTH

Query:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
Subjt:  IRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

A0A5D3DYN2 Plant transposase8.2e-8195.78Show/hide
Query:  RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTHI
        RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLG DQ YVRGLGFGVTLSKVSTSI KDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSS HI
Subjt:  RIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKRVPSSTHI

Query:  RTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV
        RTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLD +GSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLG NAVRVWVDTV
Subjt:  RTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCCTCCACCCACCCCCCATCCACCATGACTTTTGCATACTTAATGATCGTATTGAACAAAATCGTGTGGCTTCTTCAAGTAGTATAATTGATGATGCAATTAGTAG
AGTTCTTGGGCCCGATCAAACCTATGTAAGAGGACTAGGATTTGGTGTGACTCTATCGAAGGTGTCTACATCAATTCAGAAAGATAAAACCATTACATCTCTTGAAAAAA
AATGTGACAACCTTACTTCGGATGTAGATGAGTTGAAAAGTGTGGTAGCTTCCTTATTAAAGGACAAGGAAAAAACAAGTGATGACAATTCTAATCATCTTGTTAAAAGA
GTACCATCATCGACACATATTCGTACTCCTACTCCTACTCCAATCATAAATTCTCCACCGAGTGTTACTACCAACACTCCCCATAAGTGCTTGCTACTAGATTGGATTGG
TTCAGGAGAAGTCATTGCTGAAGGTAGATGGTCTTCCAATGATCCATCTGTTCTTGTCCACCATGTACCTCTTGGCCCCAATGCAGTTCGTGTGTGGGTTGATACGGTG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGCTTGTTGTGATTGTCTTATGCCCCTCCACCCACCCCCCATCCACCATGACTTTTGCATACTTAATGATCGTATTGAACAAAATCGTGTGGCTTCTTCAAGTAGTATA
ATTGATGATGCAATTAGTAGAGTTCTTGGGCCCGATCAAACCTATGTAAGAGGACTAGGATTTGGTGTGACTCTATCGAAGGTGTCTACATCAATTCAGAAAGATAAAAC
CATTACATCTCTTGAAAAAAAATGTGACAACCTTACTTCGGATGTAGATGAGTTGAAAAGTGTGGTAGCTTCCTTATTAAAGGACAAGGAAAAAACAAGTGATGACAATT
CTAATCATCTTGTTAAAAGAGTACCATCATCGACACATATTCGTACTCCTACTCCTACTCCAATCATAAATTCTCCACCGAGTGTTACTACCAACACTCCCCATAAGTGC
TTGCTACTAGATTGGATTGGTTCAGGAGAAGTCATTGCTGAAGGTAGATGGTCTTCCAATGATCCATCTGTTCTTGTCCACCATGTACCTCTTGGCCCCAATGCAGTTCG
TGTGTGGGTTGATACGGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPLHPPPIHHDFCILNDRIEQNRVASSSSIIDDAISRVLGPDQTYVRGLGFGVTLSKVSTSIQKDKTITSLEKKCDNLTSDVDELKSVVASLLKDKEKTSDDNSNHLVKR
VPSSTHIRTPTPTPIINSPPSVTTNTPHKCLLLDWIGSGEVIAEGRWSSNDPSVLVHHVPLGPNAVRVWVDTV