; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C035149 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C035149
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
Genome locationchr11:24356017..24356348
RNA-Seq ExpressionMELO3C035149
SyntenyMELO3C035149
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0040895.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-2371.13Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATLDFCLLKEKENED
        MS+ NAPF DAFRGISRRRDTASGN LFN FSSVIY+T+TERE    SREGRRENRR RSVFCRRRSP S    L AVQPPSATL    L+ +++ D
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATLDFCLLKEKENED

KAA0054714.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-3690.32Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATLDFCLLKEKENED
        MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATLD   L+ +++ D
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATLDFCLLKEKENED

KAA0057011.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-2786.25Show/hide
Query:  SVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATL
        S+ NAP+PDAFRGISRRR TASGN LFNRFSSVIY+TETER  +RRSREGRRENRR RSVFCRRRSPSSL AVQPPSATL
Subjt:  SVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATL

TYK10637.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]6.5e-2378.82Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATL
        MS+ NAPF DAFRGISRRRDTASGN LFN FSSVIY+T+TERE    SREGRRENRR RSVFCRRRSP S    L AVQPPSATL
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATL

TYK26661.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.5e-1978.87Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSL
        MSV N PFPDAFRGISRRR TASGNPLFN FSSVIY+TETERENERR+REGRRENR CR +      PSSL
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7THM5 CACTA en-spm transposon protein8.3e-2471.13Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATLDFCLLKEKENED
        MS+ NAPF DAFRGISRRRDTASGN LFN FSSVIY+T+TERE    SREGRRENRR RSVFCRRRSP S    L AVQPPSATL    L+ +++ D
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATLDFCLLKEKENED

A0A5A7UHT7 CACTA en-spm transposon protein5.0e-3790.32Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATLDFCLLKEKENED
        MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATLD   L+ +++ D
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATLDFCLLKEKENED

A0A5A7UU28 CACTA en-spm transposon protein1.6e-2786.25Show/hide
Query:  SVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATL
        S+ NAP+PDAFRGISRRR TASGN LFNRFSSVIY+TETER  +RRSREGRRENRR RSVFCRRRSPSSL AVQPPSATL
Subjt:  SVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATL

A0A5D3CF83 CACTA en-spm transposon protein3.2e-2378.82Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATL
        MS+ NAPF DAFRGISRRRDTASGN LFN FSSVIY+T+TERE    SREGRRENRR RSVFCRRRSP S    L AVQPPSATL
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSS----LVAVQPPSATL

A0A5D3DSC7 CACTA en-spm transposon protein3.6e-1978.87Show/hide
Query:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSL
        MSV N PFPDAFRGISRRR TASGNPLFN FSSVIY+TETERENERR+REGRRENR CR +      PSSL
Subjt:  MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGTCAGGAATGCCCCTTTTCCCGACGCTTTTAGGGGGATTTCCCGACGCCGCGACACTGCGTCGGGAAATCCCCTTTTTAATCGTTTCAGTTCTGTAATTTACAA
AACCGAAACCGAGAGGGAAAACGAGAGGAGAAGCCGAGAGGGGAGAAGAGAGAATCGTCGTTGCCGTTCCGTGTTCTGCCGCCGTCGCTCGCCGTCGTCCCTTGTCGCCG
TTCAGCCGCCGTCTGCCACTTTAGATTTTTGTTTGTTAAAAGAAAAGGAAAATGAAGATAAATTAGGAAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCGTCAGGAATGCCCCTTTTCCCGACGCTTTTAGGGGGATTTCCCGACGCCGCGACACTGCGTCGGGAAATCCCCTTTTTAATCGTTTCAGTTCTGTAATTTACAA
AACCGAAACCGAGAGGGAAAACGAGAGGAGAAGCCGAGAGGGGAGAAGAGAGAATCGTCGTTGCCGTTCCGTGTTCTGCCGCCGTCGCTCGCCGTCGTCCCTTGTCGCCG
TTCAGCCGCCGTCTGCCACTTTAGATTTTTGTTTGTTAAAAGAAAAGGAAAATGAAGATAAATTAGGAAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVRNAPFPDAFRGISRRRDTASGNPLFNRFSSVIYKTETERENERRSREGRRENRRCRSVFCRRRSPSSLVAVQPPSATLDFCLLKEKENEDKLGN