; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MELO3C035737 (gene) of Melon (DHL92) v4 genome

Gene IDMELO3C035737
OrganismCucumis melo DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionCentromere protein S-like
Genome locationchr12:23010534..23012754
RNA-Seq ExpressionMELO3C035737
SyntenyMELO3C035737
Gene Ontology termsGO:0000712 - resolution of meiotic recombination intermediates (biological process)
GO:0006312 - mitotic recombination (biological process)
GO:0007129 - synapsis (biological process)
GO:0031297 - replication fork processing (biological process)
GO:0036297 - interstrand cross-link repair (biological process)
GO:0043240 - Fanconi anaemia nuclear complex (cellular component)
GO:0071821 - FANCM-MHF complex (cellular component)
GO:0003682 - chromatin binding (molecular function)
GO:0046982 - protein heterodimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009072 - Histone-fold
IPR029003 - CENP-S/Mhf1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004154006.1 protein MHF1 homolog isoform X2 [Cucumis sativus]9.8e-5996.12Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        MET MEEDDSASELLRDRFRLS+ISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFK+TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
         KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_008440142.1 PREDICTED: centromere protein S isoform X1 [Cucumis melo]2.6e-5998.46Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF T+QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_008440159.1 PREDICTED: centromere protein S isoform X2 [Cucumis melo]3.6e-61100Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_011652290.1 protein MHF1 homolog isoform X1 [Cucumis sativus]7.1e-5794.62Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        MET MEEDDSASELLRDRFRLS+ISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFK+ T+QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        K KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

XP_038894699.1 protein MHF1 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]8.6e-5589.92Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        M+T +EED SASELLRDRFRLSTISIAEAEAN+SGMEISEPVMTCVADLAFK+TKQLAKDLELF QHAGRKSVNTEDVIL+AHRNEHL+AILTSICNDLK
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
         KEPQSERKRKKAPKK+DRDRGAVHI +A
Subjt:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LR97 Uncharacterized protein4.8e-5996.12Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        MET MEEDDSASELLRDRFRLS+ISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFK+TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
         KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIA+A
Subjt:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A1S3B159 centromere protein S isoform X11.3e-5998.46Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF T+QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A1S3B173 centromere protein S isoform X21.8e-61100Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A5A7UM53 Centromere protein S isoform X11.3e-5998.46Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF T+QLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKF-TKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDL

Query:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  KAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

A0A5D3BHQ8 Centromere protein S isoform X21.8e-61100Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
        AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
Subjt:  AKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
E1BSW7 Centromere protein S2.6e-0627.1Show/hide
Query:  EEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQ
        E+ +   + LR     +T  + +  A   G+  S+  +  ++++ F+  +  A+DLE+FA+HA R ++ +EDV L A R+  L   +T   ++L +   +
Subjt:  EEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQ

Query:  SERKRKK
         + K+KK
Subjt:  SERKRKK

Q2TBR7 Centromere protein S4.4e-0935.58Show/hide
Query:  IAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVH
        + E  A+   M+ S+  +  ++++ F   +  AKDLE+FA+HA R ++NTEDV L A R+  L   +T    D+   +   E+K KK  K +D +R +V 
Subjt:  IAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVH

Query:  IAEA
         AEA
Subjt:  IAEA

Q6NRI8 Centromere protein S9.1e-0727.68Show/hide
Query:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK
        M    EE  S ++ L+        S+ +  A+   ++ S+  +  ++++ F+  +  AKDLE+FA+HA R ++N +DV L A R+  L A ++   +++ 
Subjt:  METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLK

Query:  AKEPQSERKRKK
        A   + + K+KK
Subjt:  AKEPQSERKRKK

Q8N2Z9 Centromere protein S1.4e-0730.47Show/hide
Query:  ETRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKA
        ET  ++  S  + L+     +   + E  A    M+ S+  +  +++L F+  +  AKDLE+FA+HA R ++NTEDV L A R+  L   +T    ++  
Subjt:  ETRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKA

Query:  KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA
         +   ERK +K  K +D  + +   AEA
Subjt:  KEPQSERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA

Q9FI55 Protein MHF1 homolog5.5e-3669.3Show/hide
Query:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQS
        E+ S  +L+RDRFRLS ISIAEAEA K+GMEI  PV+ CVADLAFK+ + +AKDLELFA HAGRK VN +DV+L+AHRN++LAA L S+CN+LKAKEPQS
Subjt:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQS

Query:  ERKRKK-APKKDDR
        ERKRKK + KK+D+
Subjt:  ERKRKK-APKKDDR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G50930.1 Histone superfamily protein3.9e-3769.3Show/hide
Query:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQS
        E+ S  +L+RDRFRLS ISIAEAEA K+GMEI  PV+ CVADLAFK+ + +AKDLELFA HAGRK VN +DV+L+AHRN++LAA L S+CN+LKAKEPQS
Subjt:  EDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQS

Query:  ERKRKK-APKKDDR
        ERKRKK + KK+D+
Subjt:  ERKRKK-APKKDDR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACTAGAATGGAAGAAGACGACTCCGCTTCCGAACTATTGAGGGACAGGTTCCGGCTCTCCACCATTTCTATTGCTGAAGCTGAAGCGAATAAAAGCGGC
ATGGAAATTTCTGAACCCGTGATGACTTGTGTTGCGGATTTAGCATTCAAATTTACAAAACAGTTGGCGAAGGACCTTGAGTTATTTGCTCAACATGCTGGTCGG
AAATCGGTAAATACAGAAGATGTAATACTAACAGCCCATAGAAACGAGCATTTAGCTGCCATATTAACATCCATCTGCAATGATCTAAAGGCAAAAGAGCCTCAA
AGTGAAAGAAAGCGTAAAAAGGCACCAAAAAAGGATGATAGAGATAGAGGTGCCGTGCATATTGCTGAAGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAGAGAGAGAGAGAAACAAATGAAAAGAAAATAGCGAAACGATTCGTTTAAGGCCATCCCATTCCCCGTCACGTCGTCAGAGGCATTCGTGGAGGGAAATAAA
TGCGAAATGGAAAAAGGTAAAGCCTCTGCTCTGCAATGGAAACTAGAATGGAAGAAGACGACTCCGCTTCCGAACTATTGAGGGACAGGTTCCGGCTCTCCACCA
TTTCTATTGCTGAAGCTGAAGCGAATAAAAGCGGCATGGAAATTTCTGAACCCGTGATGACTTGTGTTGCGGATTTAGCATTCAAATTTACAAAACAGTTGGCGA
AGGACCTTGAGTTATTTGCTCAACATGCTGGTCGGAAATCGGTAAATACAGAAGATGTAATACTAACAGCCCATAGAAACGAGCATTTAGCTGCCATATTAACAT
CCATCTGCAATGATCTAAAGGCAAAAGAGCCTCAAAGTGAAAGAAAGCGTAAAAAGGCACCAAAAAAGGATGATAGAGATAGAGGTGCCGTGCATATTGCTGAAG
CCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METRMEEDDSASELLRDRFRLSTISIAEAEANKSGMEISEPVMTCVADLAFKFTKQLAKDLELFAQHAGRKSVNTEDVILTAHRNEHLAAILTSICNDLKAKEPQ
SERKRKKAPKKDDRDRGAVHIAEA