; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS000269 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS000269
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionTransmembrane protein, putative
Genome locationscaffold44:454332..454598
RNA-Seq ExpressionMS000269
SyntenyMS000269
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044682.1 putative transmembrane protein [Cucumis melo var. makuwa]7.3e-2979.12Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK
        MYRS SWNRFSDEYYS S+P    SSKP Q+LRLSSSF  G NELP NDPV  MVKREKARVKFAE AVHVIP VLL+C IVLWFFSNPGK
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK

XP_011653100.1 uncharacterized protein LOC105435175 [Cucumis sativus]1.1e-2983.15Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRSVSWNRFSDEYYS S+P    SSKP Q+LRLSSSF  G NELPTNDPV+ MVKREKARVKFAETAVHVIP VLL+CAIVLWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

XP_022140815.1 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X1 [Momordica charantia]1.3e-3898.85Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQAL LSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

XP_022140816.1 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X2 [Momordica charantia]4.1e-4098.88Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQAL LSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK

XP_022986879.1 uncharacterized protein LOC111484483 [Cucurbita maxima]4.7e-2878.16Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        M+RSVSWNRFSDEYYS SSP+  LSS P QALRL+SSF  NE PT+ P   MVKREKARVKFA TAVHVIPLVL+LCAI+LWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZ80 Uncharacterized protein5.5e-3083.15Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRSVSWNRFSDEYYS S+P    SSKP Q+LRLSSSF  G NELPTNDPV+ MVKREKARVKFAETAVHVIP VLL+CAIVLWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

A0A5A7TMZ1 Putative transmembrane protein3.5e-2979.12Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK
        MYRS SWNRFSDEYYS S+P    SSKP Q+LRLSSSF  G NELP NDPV  MVKREKARVKFAE AVHVIP VLL+C IVLWFFSNPGK
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSF--GANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK

A0A6J1CG79 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X16.4e-3998.85Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQAL LSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

A0A6J1CH63 uncharacterized protein LOC111011394 isoform X22.0e-4098.88Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK
        MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQAL LSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK

A0A6J1JHB4 uncharacterized protein LOC1114844832.3e-2878.16Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        M+RSVSWNRFSDEYYS SSP+  LSS P QALRL+SSF  NE PT+ P   MVKREKARVKFA TAVHVIPLVL+LCAI+LWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35658.1 unknown protein5.8e-0840.91Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        M RS S +  SD+  + S SP+    S P       S      LP  DP +   K+ K+R + AE A+H IP+VL+LCA++LW FSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

AT2G35658.2 unknown protein9.0e-0941.57Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPG
        M RS S +  SD+  + S SP+    S P       S      LP  DP +   K+ K+R + AE A+H IP+VL+LCA++LW FSNPG
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPG

AT2G35658.3 unknown protein9.0e-0941.11Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK
        M RS S +  SD+  + S SP+    S P       S      LP  DP +   K+ K+R + AE A+H IP+VL+LCA++LW FSNP K
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRS-SPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK

AT5G07490.1 unknown protein3.5e-1348.31Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALR-LSSSFGANELPTNDPVA-VMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRS SWNR +++Y           S P  A + L      +E    DP    M K+EK+R KFAE AVH+IP VLL CA+VLWFFSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALR-LSSSFGANELPTNDPVA-VMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP

AT5G61630.1 unknown protein5.2e-1751.65Show/hide
Query:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFG---ANELPT-NDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP
        MYRS SWNR  ++Y          SS P + L + S  G    NELP+ N+P   MVK+EK+R KFAE A+H+IP VLL CA+VLW FSNP
Subjt:  MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFG---ANELPT-NDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACCGATCGGTGAGCTGGAACCGATTCTCCGACGAATACTACTCGCGGTCGTCCCCGGCGCTGGTGCTGTCCTCCAAGCCCGATCAGGCATTGCGATTGTCGTCGTC
GTTTGGCGCTAATGAGCTGCCGACGAACGATCCCGTCGCTGTGATGGTGAAGCGAGAGAAAGCGCGAGTCAAGTTCGCTGAAACTGCTGTGCATGTGATTCCTCTCGTTT
TGCTTCTCTGCGCCATTGTTCTCTGGTTCTTCTCCAATCCAGGTAAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACCGATCGGTGAGCTGGAACCGATTCTCCGACGAATACTACTCGCGGTCGTCCCCGGCGCTGGTGCTGTCCTCCAAGCCCGATCAGGCATTGCGATTGTCGTCGTC
GTTTGGCGCTAATGAGCTGCCGACGAACGATCCCGTCGCTGTGATGGTGAAGCGAGAGAAAGCGCGAGTCAAGTTCGCTGAAACTGCTGTGCATGTGATTCCTCTCGTTT
TGCTTCTCTGCGCCATTGTTCTCTGGTTCTTCTCCAATCCAGGTAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYRSVSWNRFSDEYYSRSSPALVLSSKPDQALRLSSSFGANELPTNDPVAVMVKREKARVKFAETAVHVIPLVLLLCAIVLWFFSNPGK