; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS000271 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS000271
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog 1A
Genome locationscaffold44:463844..465656
RNA-Seq ExpressionMS000271
SyntenyMS000271
Gene Ontology termsGO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044679.1 Ras-related protein RABD2c [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-10598.48Show/hide
Query:  SDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
        +DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
Subjt:  SDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN

Query:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

XP_004146899.1 ras-related protein RABD2a [Cucumis sativus]6.4e-10598.98Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

XP_022141232.1 ras-related protein RABD2c-like [Momordica charantia]9.8e-106100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

XP_022943181.1 ras-related protein RABD2c-like [Cucurbita moschata]1.8e-10499.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

XP_038906428.1 ras-related protein RABD2c-like [Benincasa hispida]2.2e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+VVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUE5 Uncharacterized protein3.1e-10598.98Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

A0A1S3BWQ8 ras-related protein RABD2a-like3.1e-10598.98Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

A0A5D3CYB3 Ras-related protein RABD2c2.4e-10598.48Show/hide
Query:  SDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
        +DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
Subjt:  SDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN

Query:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

A0A6J1CJB0 ras-related protein RABD2c-like4.7e-106100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

A0A6J1JJU9 ras-related protein RABD2c-like9.0e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a3.1e-9487.37Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTD+ESF NVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DL  N+ + YE+AKAFADE+GIPFMETSAKDATNVEQAFMAM+A IK RMASQPA NNARPPTVQ++GQPV QK GCCS+
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

P40392 Ras-related protein RIC14.4e-9386.8Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYL+SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTDQESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNA-RPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDL  N+VVSYE+ KA ADE+GIPF+ETSAKDATNVE+AFM M  +IKNRMASQPA NA +P TVQ++GQPV Q+  CCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNA-RPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

Q05737 GTP-binding protein YPTM28.9e-9489.39Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQP-ANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DL  NKVV+ E+AKAFADE+GIPFMETSAK+ATNV+QAFMAM A IK+RMASQP A NARP TVQ++GQPVNQK  CCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQP-ANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b4.0e-9488.32Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK DL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMASQPA  A+PPTVQ++GQPVNQ+ GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c3.6e-9588.32Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMASQPA  ++PPTVQ++GQPVNQ+ GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 52.2e-9587.37Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTD+ESF NVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DL  N+ + YE+AKAFADE+GIPFMETSAKDATNVEQAFMAM+A IK RMASQPA NNARPPTVQ++GQPV QK GCCS+
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E2.4e-6257.21Show/hide
Query:  SDSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQW
        SD DYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVE DGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVTD+ SF N++ W
Subjt:  SDSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQW

Query:  LNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL--PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQ--------PV
        +  I+++AS++VNK+LVGNK D+    + V     +A ADE GI F ETSAK   NVEQ F+++  DIK R+ ++    A P  +++  Q          
Subjt:  LNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL--PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQ--------PV

Query:  NQKGGCCS
        N+K  CCS
Subjt:  NQKGGCCS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.3e-7973.63Show/hide
Query:  SDSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQW
        ++ DYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+EQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYD T+ ESF NVKQW
Subjt:  SDSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQW

Query:  LNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANN--ARPPTVQLQGQPVNQ-KGGC
        L+EIDRYA+E+V KLL+GNK D+  +KVVS E+ +A ADE+GIPF+ETSAKD+ NVEQAF+ +  +IK +M SQ   N  + P TVQ++GQP+ Q  GGC
Subjt:  LNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANN--ARPPTVQLQGQPVNQ-KGGC

Query:  C
        C
Subjt:  C

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C2.6e-9688.32Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMASQPA  ++PPTVQ++GQPVNQ+ GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A2.9e-9588.32Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK DL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMASQPA  A+PPTVQ++GQPVNQ+ GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GTTTTCTCTGATAGTGACTACTTGTTCAAGCTCTTGCTTATTGGAGACTCTGGAGTTGGCAAATCATGTCTTCTATTGAGGTTTGCTGACGACTCATACCTGGATAGTTA
TATTAGCACCATTGGAGTTGATTTTAAAATACGCACGGTCGAGCAAGATGGAAAGACAATTAAACTTCAAATTTGGGACACTGCAGGACAGGAGCGTTTTAGGACCATCA
CTAGTAGCTACTACCGTGGAGCACATGGCATAATAATTGTTTATGATGTAACAGACCAGGAGAGTTTCGAGAATGTTAAGCAATGGTTAAACGAAATTGACCGTTATGCA
AGCGAAAATGTAAACAAGCTTCTAGTTGGCAATAAGTGTGACCTCCCTAATAAAGTAGTGTCATATGAATCAGCAAAGGCATTTGCTGATGAGGTTGGGATTCCATTTAT
GGAGACGAGTGCAAAAGATGCAACCAATGTCGAGCAGGCATTCATGGCCATGACTGCCGACATTAAGAACAGGATGGCAAGTCAGCCAGCAAACAATGCGAGGCCTCCGA
CGGTGCAGCTACAAGGGCAACCCGTTAACCAGAAGGGTGGATGCTGCTCCTCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTTCTCTGATAGTGACTACTTGTTCAAGCTCTTGCTTATTGGAGACTCTGGAGTTGGCAAATCATGTCTTCTATTGAGGTTTGCTGACGACTCATACCTGGATAGTTA
TATTAGCACCATTGGAGTTGATTTTAAAATACGCACGGTCGAGCAAGATGGAAAGACAATTAAACTTCAAATTTGGGACACTGCAGGACAGGAGCGTTTTAGGACCATCA
CTAGTAGCTACTACCGTGGAGCACATGGCATAATAATTGTTTATGATGTAACAGACCAGGAGAGTTTCGAGAATGTTAAGCAATGGTTAAACGAAATTGACCGTTATGCA
AGCGAAAATGTAAACAAGCTTCTAGTTGGCAATAAGTGTGACCTCCCTAATAAAGTAGTGTCATATGAATCAGCAAAGGCATTTGCTGATGAGGTTGGGATTCCATTTAT
GGAGACGAGTGCAAAAGATGCAACCAATGTCGAGCAGGCATTCATGGCCATGACTGCCGACATTAAGAACAGGATGGCAAGTCAGCCAGCAAACAATGCGAGGCCTCCGA
CGGTGCAGCTACAAGGGCAACCCGTTAACCAGAAGGGTGGATGCTGCTCCTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
VFSDSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNEIDRYA
SENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASQPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCSS