CuGenDBv2

Gene ID	MS000363
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	RAB6-interacting golgin
Genome location	scaffold44:1203996..1206664
RNA-Seq Expression	MS000363
Synteny	MS000363
Gene Ontology terms	GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0033596.1 hypothetical protein E6C27_scaffold239G00290 [Cucumis melo var. makuwa]

2.4e-96

79.69

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+PSLLPEIGPDGLA E+PVIAYTEK   +    +   + I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TER+RAAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        + WEAASKVVQDEE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS+D K +GGAQNSRVS+SS   T+TETG  A+ NE+ PNQ  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR
        T+  A PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR

XP_011651127.1 uncharacterized protein LOC101210795 [Cucumis sativus]

1.6e-95

79.31

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+PSLLP IGPDGLA E+PVIAYTEK   +    +   + I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TER+RAAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        + WEAASKVVQ+EE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS+D  T+GGAQNSRVS+SSG  T+TETG  A+ NE+ PNQ  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR
        T+  A PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR

XP_022141274.1 uncharacterized protein LOC111011714 [Momordica charantia]

1.5e-122

94.27

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEK   +    +   +YIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVS+SSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV
        TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQ HGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV

XP_022945967.1 uncharacterized protein LOC111450054 [Cucurbita moschata]

7.3e-93

78.11

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+P LLPEIGPDGLA E+PVIAYTEK   +    +   +YI+ENYSKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TERI AAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVS---YDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPN
        +AWEAASKVVQDEE IKQKLC+DLNHLVQES+NSQLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS    +G+T+G AQNSRV++SSG  TSTET   A+ANESA  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVS---YDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPN

Query:  QGTTSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV
        Q  +  G  PV+NGQNQKP SE E RGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGRV
Subjt:  QGTTSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV

XP_038898541.1 uncharacterized protein LOC120086143 [Benincasa hispida]

1.3e-94

78.54

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+PSLLPEIGPDGLA E+PVIAYTEK   +    +   + I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIE++TER+RAAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        + WEAASKVVQDEE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTRLEELKRRMEALN  RVSTS+S+D KT+GGAQNSR ++SSG  TSTETG  A+A+E+ PN   
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR
          G   PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L8J1 RAB6-interacting golgin

1.2e-85

73.95

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+PSLLP I    L +                      + I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TER+RAAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        + WEAASKVVQ+EE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS+D  T+GGAQNSRVS+SSG  T+TETG  A+ NE+ PNQ  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR
        T+  A PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR

A0A5D3DFA0 RAB6-interacting golgin

1.2e-96

79.69

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+PSLLPEIGPDGLA E+PVIAYTEK   +    +   + I+EN SKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TER+RAAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        + WEAASKVVQDEE  KQKLCEDLNHLVQESSN QLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS+D K +GGAQNSRVS+SS   T+TETG  A+ NE+ PNQ  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR
        T+  A PV+NGQNQKPPSE EGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGR
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR

A0A6J1CI49 uncharacterized protein LOC111011714

7.3e-123

94.27

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEK   +    +   +YIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVS+SSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV
        TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQ HGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV

A0A6J1G2D4 uncharacterized protein LOC111450054

3.5e-93

78.11

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+P LLPEIGPDGLA E+PVIAYTEK   +    +   +YI+ENYSKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TERI AAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVS---YDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPN
        +AWEAASKVVQDEE IKQKLC+DLNHLVQES+NSQLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS    +G+T+G AQNSRV++SSG  TSTET   A+ANESA  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVS---YDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPN

Query:  QGTTSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV
        Q  +  G  PV+NGQNQKP SE E RGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGRV
Subjt:  QGTTSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV

A0A6J1HV58 uncharacterized protein LOC111467736

3.0e-92

77.74

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        M S+P LLPEIGPDGLA E+PVIAYTEK   +    +   +YI+ENYSKIRDVERELA LTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEM+TERI AAKLKEEQAK
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVS---YDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPN
        +AWEAASKVVQDEE IKQKLC+DLNHLVQES+NSQLTRLEELKRRMEALN  RVSTSVS    +G+T+  AQNSRV++SSG  TSTET   A+ANESA  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVS---YDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPN

Query:  QGTTSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV
        Q  +  G  PV+NGQNQKP SE E RGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSS DSGWTGSGFDVDGRV
Subjt:  QGTTSGGAPPVMNGQNQKPPSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G51840.1 unknown protein

1.1e-59

56.49

Show/hide

Query:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK
        MAS+P L  EIG DGLA E+PVIAYTEK   +    V   +YIEENY+KIRDVERE  NL+ME+KLT+GPKKAA+E LRKKIE++TERI AAKLKEE+A+
Subjt:  MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAK

Query:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT
        +A+EAASKVV+DEE  KQ LCEDLN LVQ+SSN+Q  RLEELKRR+EALNP R STS+    + V   +   V +S+           A AN++ P +  
Subjt:  QAWEAASKVVQDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGT

Query:  TSGGAPPVMNGQNQKP-PSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR
         + G         Q+P  +EGE + KKK Q  GRG+GIG + KGR     GWTG+GFDVDGR
Subjt:  TSGGAPPVMNGQNQKP-PSEGEGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTCTAATCCCTCTCTTTTGCCCGAAATTGGTCCTGATGGCCTTGCAATGGAATCCCCTGTAATTGCCTACACTGAAAAGGAAATGTTCTTAATGGCTTGGTTTGT
TATTTCATCCAGATATATTGAAGAGAATTATTCTAAAATTCGAGATGTTGAACGGGAGTTGGCAAATCTTACAATGGAGATGAAACTCACATCTGGGCCCAAAAAAGCAG
CACTTGAACTTTTGCGGAAGAAAATAGAAATGGCAACAGAGAGAATACGTGCAGCCAAGTTGAAAGAAGAACAAGCAAAGCAGGCTTGGGAAGCAGCATCAAAAGTAGTG
CAGGACGAGGAACAGATTAAGCAAAAGCTGTGTGAAGACTTGAATCATCTGGTTCAAGAAAGCAGTAATTCGCAATTGACGAGGCTGGAAGAACTTAAACGGCGTATGGA
AGCTTTGAATCCAGGTCGAGTATCGACCTCTGTTTCTTATGATGGGAAAACAGTGGGAGGAGCACAGAATAGCAGAGTTTCAGAGTCTTCTGGAGGTCCTACATCAACAG
AAACAGGTGTAAGAGCAAGAGCAAATGAAAGTGCCCCTAATCAGGGAACAACCAGTGGTGGTGCTCCTCCAGTGATGAATGGGCAAAATCAAAAGCCCCCTTCTGAGGGA
GAAGGGAGAGGGAAAAAGAAAAATCAGTTCCATGGAAGAGGGAAGGGAATTGGGGCAGTGCCTAAAGGAAGAAGCTCTACTGACTCTGGTTGGACTGGCTCTGGGTTTGA
TGTGGATGGTAGAGTG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASNPSLLPEIGPDGLAMESPVIAYTEKEMFLMAWFVISSRYIEENYSKIRDVERELANLTMEMKLTSGPKKAALELLRKKIEMATERIRAAKLKEEQAKQAWEAASKVV
QDEEQIKQKLCEDLNHLVQESSNSQLTRLEELKRRMEALNPGRVSTSVSYDGKTVGGAQNSRVSESSGGPTSTETGVRARANESAPNQGTTSGGAPPVMNGQNQKPPSEG
EGRGKKKNQFHGRGKGIGAVPKGRSSTDSGWTGSGFDVDGRV

MS000363 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome