; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS000615 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS000615
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionvesicle transport protein GOT1
Genome locationscaffold93:420575..422098
RNA-Seq ExpressionMS000615
SyntenyMS000615
Gene Ontology termsGO:0016192 - vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0000139 - Golgi membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007305 - Vesicle transport protein, Got1/SFT2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038886555.1 vesicle transport protein GOT1 [Benincasa hispida]7.5e-5494.83Show/hide
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A0A1S3BD64 vesicle transport protein GOT1B isoform X21.4e-5393.97Show/hide
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A0A1S4DVY8 vesicle transport protein GOT1B isoform X12.3e-5393.97Show/hide
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A0A6J1DA27 vesicle transport protein GOT15.4e-5898.29Show/hide
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A0A6J1ENZ4 vesicle transport protein GOT1 isoform X11.1e-5392.31Show/hide
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A0A6J1JPU2 vesicle transport protein GOT1 isoform X12.3e-5393.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDE3 Vesicle transport protein GOT1B1.9e-2345.61Show/hide
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Q6NMM1 Vesicle transport protein GOT13.6e-2753.51Show/hide
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Q9CR60 Vesicle transport protein GOT1B8.4e-2446.49Show/hide
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Q9DCQ3 Vesicle transport protein GOT1A2.4e-1843.64Show/hide
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Q9Y3E0 Vesicle transport protein GOT1B1.9e-2345.61Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05785.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family1.4e-4270.09Show/hide
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AT1G05785.2 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family1.4e-4270.09Show/hide
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AT3G49420.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family8.6e-3252.1Show/hide
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AT5G01430.1 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family8.6e-3252.1Show/hide
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AT5G01430.2 Got1/Sft2-like vescicle transport protein family8.6e-3252.1Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATATTTTGGTTAACTGGAGTAGCACTTTTACTTGGTTGGCGTTCTACGTGGAATCTTTTTACCAGTCGAGCAAATTACAAGGGTTCTGCATCTTTTCTTCTTGGGCTCT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCATCTTTTTCAAACGCAGAAGTTGGACTTGGGCTGATTGGTTTTGGCTTCTTTTTCACATTTTTGGGTGTAATCCTGTTCTTTGACAGGGGATTGCTTGCTTTAGGAAA
TATATTTTGGTTAACTGGAGTAGCACTTTTACTTGGTTGGCGTTCTACGTGGAATCTTTTTACCAGTCGAGCAAATTACAAGGGTTCTGCATCTTTTCTTCTTGGGCTCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
ASFSNAEVGLGLIGFGFFFTFLGVILFFDRGLLALGNIFWLTGVALLLGWRSTWNLFTSRANYKGSASFLLGLFFIFVRWPIIGILFEIFGCFVLFGGFWPSIKGFLYQI
PVLGWILPYPIMVRFSYIVSYA