; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS000651 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS000651
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
Genome locationscaffold93:1007192..1007311
RNA-Seq ExpressionMS000651
SyntenyMS000651
Gene Ontology termsGO:0022900 - electron transport chain (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001694 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H
IPR018086 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AVI15740.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Nymphaea colorata]1.4e-1197.44Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADG KLILKEPLSPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

BCT42655.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Musa acuminata var. zebrina]1.4e-1194.87Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADG KLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

CAG1865722.1 unnamed protein product, partial [Musa acuminata subsp. malaccensis]1.4e-1194.87Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADG KLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

YP_003587243.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Citrullus lanatus]1.4e-1197.44Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

YP_009477620.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Nymphaea colorata]2.8e-12100Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2P1AEZ9 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 16.7e-1297.44Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADG KLILKEPLSPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

A0A2R2YTB2 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.4e-12100Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

A0A7D6C5G1 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 16.7e-1297.44Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

D5I3B3 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 16.7e-1297.44Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

M0U5X2 Uncharacterized protein6.7e-1294.87Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADG KLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P26845 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 17.2e-1176.92Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        A +QRRKGP+VVG+ GLLQPLADGLKL++KEP+ PSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

P31839 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.1e-1494.87Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADGLKLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

P92558 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.1e-1494.87Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADGLKLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

Q01148 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.1e-1494.87Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADGLKLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

Q01300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.1e-1494.87Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADGLKLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07785.1 NADH dehydrogenase family protein1.1e-1492.31Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADG KLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

ATCG01100.1 NADH dehydrogenase family protein1.2e-0553.85Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG KL+ KE L PS  N
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

ATMG00516.1 NADH dehydrogenase 1C1.1e-1492.31Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADG KLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

ATMG01120.1 NADH dehydrogenase 1B1.1e-1492.31Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADG KLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN

ATMG01275.1 NADH dehydrogenase 1A1.1e-1492.31Show/hide
Query:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN
        AFVQRRKGPDVVG FGLLQPLADG KLILKEP+SPSSAN
Subjt:  AFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TGGGCTTTTGTACAACGTCGAAAGGGTCCTGATGTAGTGGGATTGTTCGGATTGTTACAACCTCTAGCAGATGGTTTGAAATTGATTCTAAAAGAACCTCTTTCACCAAG
TAGTGCAAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGGGCTTTTGTACAACGTCGAAAGGGTCCTGATGTAGTGGGATTGTTCGGATTGTTACAACCTCTAGCAGATGGTTTGAAATTGATTCTAAAAGAACCTCTTTCACCAAG
TAGTGCAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
WAFVQRRKGPDVVGLFGLLQPLADGLKLILKEPLSPSSAN