; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS001442 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS001442
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUPF0587 protein C1orf123
Genome locationscaffold36:4168711..4171086
RNA-Seq ExpressionMS001442
SyntenyMS001442
Gene Ontology termsGO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008584 - CXXC motif containing zinc binding protein, eukaryotic


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585732.1 CXXC motif containing zinc binding protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.1e-8488.55Show/hide
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XP_022952030.1 UPF0587 protein C1orf123 homolog [Cucurbita moschata]5.1e-8488.55Show/hide
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XP_038884333.1 CXXC motif containing zinc binding protein isoform X1 [Benincasa hispida]4.2e-8689.76Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAF1 UPF0587 protein C1orf123 homolog4.4e-8184.94Show/hide
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A0A5A7V299 UPF0587 protein C1orf123-like protein4.4e-8184.94Show/hide
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A0A6J1BTL8 UPF0587 protein C1orf1234.5e-94100Show/hide
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A0A6J1GKL1 UPF0587 protein C1orf123 homolog2.5e-8488.55Show/hide
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A0A6J1KKK0 UPF0587 protein C1orf123 homolog2.5e-8488.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q32P66 CXXC motif containing zinc binding protein2.7e-2739.24Show/hide
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        L++ A LEN+TNL+P       +F +  K+KCG CGE+S+K   + L ++VAL GG+G+ ++VQKCK C R+ ++ ++    K    E +E  K+  ++ 
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        F+CRG EP+DF    G+ AE +E GT F DI+L + ++ +YDEK +  V I ++   F
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Q3B8G0 CXXC motif containing zinc binding protein1.1e-2840.49Show/hide
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        MV F L+  A LENLT L+P       +F +  KLKCG CGEVS K   +TL ++V L GG+G+ ++VQ+CK C R+ ++ ++     P   E SE+ K+
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          ++ F+CRG EP+DF    G+ AE  E GT F +I+L + ++ +YDEK +  V I +++  F
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Q498R7 CXXC motif containing zinc binding protein4.6e-2738.65Show/hide
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        M    L++ A LEN+TNL+P       +F +  K+KCG CGE+S+K   + L ++VAL GG+G+ ++VQKCK C R+ ++ ++    K    E +E  K+
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Q8BHG2 CXXC motif containing zinc binding protein6.0e-2738.04Show/hide
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        M    L++ A LEN+TNL+P       +F +  K+KCG CGE+S+K   + L ++VAL GG+G+ ++VQKCK C R+ ++ ++    K    E +E  K+
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Q9NWV4 CXXC motif containing zinc binding protein2.4e-2839.26Show/hide
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          ++ F+CRG EP+DF    G+ AE +E GT F DI+L + ++ +YDEK +  V I ++   F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G32930.1 unknown protein8.4e-6970.06Show/hide
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        MVN++LKI A+LENLTNLQP  GCDD NF YLFKLKC RCGEV+ KETC+TLNET    GG+GT +LVQKCKFCGR+G VTMIPG+G+PLT E SE+G+ 
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        +PLM+FDCRGYEP+DF FG  WKA++  GTKF++IDLS G EF EYDEKGECPVMIS  +A+F + K
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AT4G32930.2 unknown protein1.3e-6666.86Show/hide
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        E SE+G+ +PLM+FDCRGYEP+DF FG  WKA++  GTKF++IDLS G EF EYDEKGECPVMIS  +A+F + K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTGGGAGGGATGGAACTGTTACAATGATTCCGGGGCGAGGTAAACCATTGACTCAGGAAACAAGTGAATCAGGGAAGTCATCTCCCTTGATGTTATTTGACTGCAGAGGT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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