; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS001601 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS001601
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionNET domain-containing protein
Genome locationscaffold879:251295..252065
RNA-Seq ExpressionMS001601
SyntenyMS001601
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022152181.1 uncharacterized protein LOC111019964 [Momordica charantia]1.1e-6696.43Show/hide
Query:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV
        EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLS SSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLK+LLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV
Subjt:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV

Query:  DKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        +KLA NDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRV+
Subjt:  DKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

XP_022989555.1 bromodomain-containing protein 4A-like isoform X1 [Cucurbita maxima]8.8e-4572.34Show/hide
Query:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN
        QDKLGPDYFSYF+REV+DLLSQED L   S  H+S++S +S+SFG+S+GP+LS FKKEKLK LLRQSAVILS+EVNE+LGPALSIQ LKS LRSK N EN
Subjt:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN

Query:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        VDK+  ND EQAP KKLKS   STSLSA ++C  LGSSRV+
Subjt:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

XP_022989556.1 bromodomain-containing protein 4A-like isoform X2 [Cucurbita maxima]8.8e-4572.34Show/hide
Query:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN
        QDKLGPDYFSYF+REV+DLLSQED L   S  H+S++S +S+SFG+S+GP+LS FKKEKLK LLRQSAVILS+EVNE+LGPALSIQ LKS LRSK N EN
Subjt:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN

Query:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        VDK+  ND EQAP KKLKS   STSLSA ++C  LGSSRV+
Subjt:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

XP_023529857.1 bromodomain-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-4572.34Show/hide
Query:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN
        QDKLGPDYFSYF+REV+DLLSQED L   S  H+S++S +S+SFGDS+GP+LS FKKEKLK LLRQSAV+LS+EVNE+LGPALSIQ LKS LRSK N EN
Subjt:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN

Query:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        VDK+  ND EQAP KKLKS   STSLSA ++C +LGSSRV+
Subjt:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

XP_038893520.1 uncharacterized protein LOC120082425 isoform X1 [Benincasa hispida]9.4e-4774.29Show/hide
Query:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV
        +QDKLGPD FSYFKREV+DLLSQED LPSPPH+SQ+SG+S  FGDSIGP LS FKKEKLK LLRQS  ILSKEVNE+L PALS Q LKS LRSK N ENV
Subjt:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV

Query:  DKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        +K+A NDVEQA  KKLKSL  STSL A E C+NLG + V+
Subjt:  DKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DGV0 uncharacterized protein LOC1110199645.2e-6796.43Show/hide
Query:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV
        EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLS SSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLK+LLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV
Subjt:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENV

Query:  DKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        +KLA NDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRV+
Subjt:  DKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

A0A6J1EJL2 bromodomain-containing protein 4-like isoform X29.5e-4572.34Show/hide
Query:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN
        QDKLGPDYFSYF+REV+DLLSQED L   S  H+S++S +S+SFGDS+G +LS FKKEKLK LLRQSAVILS+EVNE+LGPALSIQ LKS LRSK N EN
Subjt:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN

Query:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        VDK+  ND EQAP KKLKS   STSLSA ++C +LGSSRV+
Subjt:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

A0A6J1EK45 bromodomain-containing protein 4-like isoform X19.5e-4572.34Show/hide
Query:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN
        QDKLGPDYFSYF+REV+DLLSQED L   S  H+S++S +S+SFGDS+G +LS FKKEKLK LLRQSAVILS+EVNE+LGPALSIQ LKS LRSK N EN
Subjt:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN

Query:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        VDK+  ND EQAP KKLKS   STSLSA ++C +LGSSRV+
Subjt:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

A0A6J1JG61 bromodomain-containing protein 4A-like isoform X24.3e-4572.34Show/hide
Query:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN
        QDKLGPDYFSYF+REV+DLLSQED L   S  H+S++S +S+SFG+S+GP+LS FKKEKLK LLRQSAVILS+EVNE+LGPALSIQ LKS LRSK N EN
Subjt:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN

Query:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        VDK+  ND EQAP KKLKS   STSLSA ++C  LGSSRV+
Subjt:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

A0A6J1JMP5 bromodomain-containing protein 4A-like isoform X14.3e-4572.34Show/hide
Query:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN
        QDKLGPDYFSYF+REV+DLLSQED L   S  H+S++S +S+SFG+S+GP+LS FKKEKLK LLRQSAVILS+EVNE+LGPALSIQ LKS LRSK N EN
Subjt:  QDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDIL--PSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSEN

Query:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV
        VDK+  ND EQAP KKLKS   STSLSA ++C  LGSSRV+
Subjt:  VDKLATNDVEQAPFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G40600.1 unknown protein6.3e-0938.14Show/hide
Query:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANS
        E ++ GPD+F Y++ +V +LLSQE+ +   PH++ +    +S  + IG  LSD K+EKL  LLRQ  +    EV+E+     S+ +L S L +K  S
Subjt:  EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAACAAGATAAACTTGGACCTGATTACTTCAGTTACTTCAAAAGGGAAGTTCTAGATTTGTTATCTCAAGAGGATATTCTCCCTTCTCCACCCCATAATTCACAGTTATC
TGGGTCTTCGACTTCATTTGGTGATAGCATAGGACCTAGGCTCTCTGATTTTAAAAAGGAAAAACTGAAATTATTGCTGAGGCAGAGTGCAGTTATTCTGTCAAAAGAAG
TAAATGAGATCCTTGGGCCTGCTCTATCTATCCAACACTTGAAGTCATGTTTGAGATCCAAAGCCAACTCGGAAAATGTAGACAAATTAGCTACGAATGATGTAGAGCAA
GCTCCTTTTAAGAAACTCAAATCCTTGCCCTATTCAACTAGCCTATCTGCGCAAGAGGATTGTGCTAATCTTGGATCTAGCAGAGTGGTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAACAAGATAAACTTGGACCTGATTACTTCAGTTACTTCAAAAGGGAAGTTCTAGATTTGTTATCTCAAGAGGATATTCTCCCTTCTCCACCCCATAATTCACAGTTATC
TGGGTCTTCGACTTCATTTGGTGATAGCATAGGACCTAGGCTCTCTGATTTTAAAAAGGAAAAACTGAAATTATTGCTGAGGCAGAGTGCAGTTATTCTGTCAAAAGAAG
TAAATGAGATCCTTGGGCCTGCTCTATCTATCCAACACTTGAAGTCATGTTTGAGATCCAAAGCCAACTCGGAAAATGTAGACAAATTAGCTACGAATGATGTAGAGCAA
GCTCCTTTTAAGAAACTCAAATCCTTGCCCTATTCAACTAGCCTATCTGCGCAAGAGGATTGTGCTAATCTTGGATCTAGCAGAGTGGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
EQDKLGPDYFSYFKREVLDLLSQEDILPSPPHNSQLSGSSTSFGDSIGPRLSDFKKEKLKLLLRQSAVILSKEVNEILGPALSIQHLKSCLRSKANSENVDKLATNDVEQ
APFKKLKSLPYSTSLSAQEDCANLGSSRVV