CuGenDBv2

Gene ID	MS001897
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Kinetochore protein SPC25
Genome location	scaffold30:800809..802942
RNA-Seq Expression	MS001897
Synteny	MS001897
Gene Ontology terms	GO:0007049 - cell cycle (biological process) GO:0007059 - chromosome segregation (biological process) GO:0051301 - cell division (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0031262 - Ndc80 complex (cellular component)
InterPro domains	IPR013255 - Chromosome segregation protein Spc25, C-terminal IPR045143 - Kinetochore protein Spc25

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6589434.1 Kinetochore protein SPC25-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

7.6e-137

84.71

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENK E+S+  +MESLR+VREKEI VQQQKMESFADSFRKSLESIT RSRENA SQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRK+AKRLA+TDSLA SKSR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IEELRN LQDCKA+RDEYST IS+QSLALS  EHKE QE DCR+EIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKIN++ PDKEYSFTIRHA+DTYTLLDCN
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSLQ I++LIHELN TNGLFKFVR+MR+RFQE AAEGVGAQAL LHQ STIIS+SAPGL+SS DRSESST+EID+QV+LEETNK SKK  SGKKPA+ S 
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRR+PRFKV
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

KAG7021439.1 FKBP12-interacting protein of 37 kDa [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.7e-136

84.98

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENKVEDSIR KMESLRMVREKEIP Q +KMESFADSFRKSLESI+ +S+ENA+SQ KLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAAS+SR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IE+LRNTLQDCKAKRD+YS IISQQSLALSSSEHKETQESDCRS++QEAISWYNRVL FHIEGGHGV FSFKKI  + PDKEYSFTIRHA+DTYTLLDC 
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSL+DI++LIHELNKTNGLFKFV+VMR+RFQE AAEGVGA+AL LHQDST+IS+SAPGLSSSTD SESSTQEIDN V+ EETN  SKK L G KP + SP
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFK
        GSAFSLRRSPRF+
Subjt:  GSAFSLRRSPRFK

XP_022134671.1 uncharacterized protein LOC111006883 [Momordica charantia]

1.3e-160

99.04

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENA+SQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGG GVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQAL LHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRRSPRFKV
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

XP_022921533.1 probable kinetochore protein SPC25 isoform X2 [Cucurbita moschata]

5.8e-137

84.71

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENK E+S+  +MESLR+VREKEI V+QQKMESFADSFRKSLESIT RSRENA SQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLA+TDSLA SKSR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IEELRN  QDCKA+RDEYST IS+QSLALS  EHKE QESDCR+EIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGV FSFKKIN++ PDKEYSFTIRHA+DTYTLLDCN
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSLQ I++LIHELN TNGLFKFVR+MR+RFQE AAEGVGAQAL LHQ STIIS+SAPGL+SS DRSESST+EIDNQV+LEETNK SKK  SGKKPA+ S 
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRR+PRFKV
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

XP_023516085.1 probable kinetochore protein SPC25 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.5e-137

85.35

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENK EDS+  +MESLR+VREKEI VQQQKMESFADSFRKSLESIT RSRENA SQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLA+TDSLA SKSR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IEELRN LQDCKA+RDEYST IS+QSLALS  EHKE QESDCR+EIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKIN++ PDKEYSFTIRH +DTYTLLDCN
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSLQ I++LIHELN TNGLFKFVR+MR+RFQE AAEGVGAQAL LHQ STIIS+SAPGL+SS DRSESST+EIDNQV+LEET+K SKK  SGKKPA+ S 
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRR+PRFKV
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1BYG5 Kinetochore protein SPC25

6.2e-161

99.04

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENA+SQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGG GVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQAL LHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRRSPRFKV
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

A0A6J1E0R4 Kinetochore protein SPC25

6.9e-136

84.44

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENK E+S+  +MESLR+VREKEI V+QQKMESFADSFRKSLESIT RSRENA SQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLA+TDSLA SKSR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSL-ALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDC
        IEELRN  QDCKA+RDEYST IS+QSL ALS  EHKE QESDCR+EIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGV FSFKKIN++ PDKEYSFTIRHA+DTYTLLDC
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSL-ALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDC

Query:  NPSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLS
        NPSLQ I++LIHELN TNGLFKFVR+MR+RFQE AAEGVGAQAL LHQ STIIS+SAPGL+SS DRSESST+EIDNQV+LEETNK SKK  SGKKPA+ S
Subjt:  NPSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLS

Query:  PGSAFSLRRSPRFKV
         GSAFSLRR+PRFKV
Subjt:  PGSAFSLRRSPRFKV

A0A6J1E461 Kinetochore protein SPC25

2.8e-137

84.71

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENK E+S+  +MESLR+VREKEI V+QQKMESFADSFRKSLESIT RSRENA SQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLA+TDSLA SKSR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IEELRN  QDCKA+RDEYST IS+QSLALS  EHKE QESDCR+EIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGV FSFKKIN++ PDKEYSFTIRHA+DTYTLLDCN
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSLQ I++LIHELN TNGLFKFVR+MR+RFQE AAEGVGAQAL LHQ STIIS+SAPGL+SS DRSESST+EIDNQV+LEETNK SKK  SGKKPA+ S 
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRR+PRFKV
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

A0A6J1ES93 Kinetochore protein SPC25

5.3e-136

84.71

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENKVEDSIR KMESLRMVREKEIP Q +KMESFA SFRKSLESI+ +S+ENA+SQ KLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAAS+SR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IE+LRNTLQDCKAKRD+YS IISQQSLALSSSEHKETQESDCRS++QEAISWYNRVL FHIEGGHGV FSFKKI  + PDKEYSFTIRHA+DTYTLLDC 
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSL+DI++LIHELNKTNGLFKFV+VMR+RFQE AAEGVGA+AL LHQDST+IS+SAPGLSSSTD SESSTQEIDN V+ EETN  SKK L G KP + SP
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRRSPRF+V
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

A0A6J1L3T3 Kinetochore protein SPC25

1.8e-136

84.71

Show/hide

Query:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR
        MENKVEDSIR KMESLRMVREKEIP Q +KMESFADSFRKSLESI+ +S+ENA+SQ KLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAAS+SR
Subjt:  MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSR

Query:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN
        IE+LRNTLQDCKAKRD+YS IISQQSLALSSSEHKETQESDCRS++QEAISWYNRVL FHIEGGHGV FSFKKI  + PDKEYSFTIRHA+DTYTLLDC 
Subjt:  IEELRNTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCN

Query:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP
        PSL+DI+ LIHELN+TNGLFKFV+VMR+RFQE AAEGVGA+AL LHQDST+IS+SAPGLSSSTD SESSTQEIDN V+ EETN  SKK L G KP + SP
Subjt:  PSLQDIQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSP

Query:  GSAFSLRRSPRFKV
        GSAFSLRRSPRF+V
Subjt:  GSAFSLRRSPRFKV

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q93VK9 Kinetochore protein SPC25 homolog

1.1e-58

45.13

Show/hide

Query:  DSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESF-ADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSRIEELR
        D+ +  M SL ++ EK+I  Q+ K++SF A  FR+S+ S+  R++  A SQ +L  LKA LREAEDELVK LAVKTRKEA+++ I DS++A++SRIE LR
Subjt:  DSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESF-ADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSRIEELR

Query:  NTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCNPSLQD
          LQ  K+K+D+   IISQQ  ALS S+    + ++ +++I EAISWYN  L FH+E GHGVKF+F  I+   P +E+SFT+ + +D YTLLD +  L  
Subjt:  NTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCNPSLQD

Query:  IQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSPGSAFS
        I +++ ELNKTN LF+FVR+MR++F +     +   +  L Q+++ IS SAP +S STD + S+ +   ++V   + N+  K+   G +  +L+P S  +
Subjt:  IQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSPGSAFS

Query:  LRRSPRFK
         RRS RFK
Subjt:  LRRSPRFK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G48210.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25 (InterPro:IPR013255); Has 194 Blast hits to 194 proteins in 72 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 72; Fungi - 39; Plants - 62; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink).

8.0e-60

45.13

Show/hide

Query:  DSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESF-ADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSRIEELR
        D+ +  M SL ++ EK+I  Q+ K++SF A  FR+S+ S+  R++  A SQ +L  LKA LREAEDELVK LAVKTRKEA+++ I DS++A++SRIE LR
Subjt:  DSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESF-ADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSRIEELR

Query:  NTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCNPSLQD
          LQ  K+K+D+   IISQQ  ALS S+    + ++ +++I EAISWYN  L FH+E GHGVKF+F  I+   P +E+SFT+ + +D YTLLD +  L  
Subjt:  NTLQDCKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCNPSLQD

Query:  IQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSPGSAFS
        I +++ ELNKTN LF+FVR+MR++F +     +   +  L Q+++ IS SAP +S STD + S+ +   ++V   + N+  K+   G +  +L+P S  +
Subjt:  IQDLIHELNKTNGLFKFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSPGSAFS

Query:  LRRSPRFK
         RRS RFK
Subjt:  LRRSPRFK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGAACAAGGTGGAGGATTCTATTCGCGTGAAGATGGAGTCGCTGCGAATGGTTCGCGAGAAGGAGATTCCAGTTCAGCAGCAAAAGATGGAGTCATTTGCGGATTC
GTTTCGCAAATCTCTGGAATCGATCACTGTAAGGTCGCGAGAAAATGCCATAAGTCAAGGGAAACTGGGGGAACTGAAAGCGAGGCTGAGGGAGGCGGAAGATGAATTGG
TTAAAGCTCTAGCAGTGAAGACTCGTAAAGAGGCCAAACGGCTGGCAATCACCGATTCCCTTGCAGCTTCAAAATCTAGAATAGAAGAGCTGAGGAATACTTTACAAGAT
TGCAAAGCAAAGAGGGATGAATATTCTACAATTATATCTCAGCAATCCTTAGCTTTATCTTCATCTGAACACAAGGAAACCCAAGAAAGTGATTGCAGAAGTGAAATACA
AGAGGCTATTTCTTGGTACAATAGGGTTCTTGATTTCCATATTGAAGGAGGACATGGGGTAAAATTCTCTTTCAAGAAAATCAATATTAACATTCCTGATAAAGAATATT
CTTTTACCATCCGTCATGCAAGTGATACTTATACGTTGTTAGATTGTAACCCATCCTTGCAAGATATTCAAGACTTGATACATGAACTGAATAAAACAAATGGTTTATTC
AAGTTCGTTAGGGTTATGAGACAGAGGTTTCAGGAGATTGCAGCAGAAGGAGTTGGGGCCCAGGCATTGCCTCTGCATCAAGACTCAACAATAATCTCTGTGTCAGCTCC
AGGTTTGTCATCATCAACTGACAGAAGTGAATCTTCAACTCAAGAAATTGATAACCAGGTTCGACTTGAGGAAACTAACAAGCACTCTAAGAAAATTCTATCTGGAAAGA
AACCAGCTGTCCTATCCCCTGGATCTGCATTTTCTTTGCGCCGGTCTCCTCGTTTTAAGGTGCAC

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MENKVEDSIRVKMESLRMVREKEIPVQQQKMESFADSFRKSLESITVRSRENAISQGKLGELKARLREAEDELVKALAVKTRKEAKRLAITDSLAASKSRIEELRNTLQD
CKAKRDEYSTIISQQSLALSSSEHKETQESDCRSEIQEAISWYNRVLDFHIEGGHGVKFSFKKININIPDKEYSFTIRHASDTYTLLDCNPSLQDIQDLIHELNKTNGLF
KFVRVMRQRFQEIAAEGVGAQALPLHQDSTIISVSAPGLSSSTDRSESSTQEIDNQVRLEETNKHSKKILSGKKPAVLSPGSAFSLRRSPRFKVH

MS001897 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome