; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS001945 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS001945
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationscaffold30:1197911..1198786
RNA-Seq ExpressionMS001945
SyntenyMS001945
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000225 - Armadillo
IPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057894.1 U-box domain-containing protein 38 [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-12182.99Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISE+E+  L+KL+SP+VF+QEEGV+SLRKITKADE IRVSLCTPRILF+L  LI SRY  VQINAVASLVNLSLE+ NK+KI RSGLVP+LIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        H+E+QEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGAL PLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGA TTLLSMVKS NS +RLLLILCN+AVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE
        GRSAMLDA+AV  LV MLR KE+NSESTRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREIV+ GSERAREKAK IL+RM  +GRFD DD+++
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE

TYJ98582.1 U-box domain-containing protein 38 [Cucumis melo var. makuwa]9.2e-12182.65Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISE+E+  L+KL+SP+VF+QEEGV+SLRKITKADE IRVSLCTPRILF+L  LI SRY  VQINAVASLVNLSLE+ NK+KI RSGLVP+LIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        H+E+QEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGAL PLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGA T LLSMVKS NS +RLLLILCN+AVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE
        GRSAMLDA+AV  LV MLR KE+NSESTRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREIV+ GSERAREKAK IL+RM  +GRFD DD+++
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE

XP_008453132.1 PREDICTED: U-box domain-containing protein 38 [Cucumis melo]9.2e-12182.65Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISE+E+  L+KL+SP+VF+QEEGV+SLRKITKADE IRVSLCTPRILF+L  LI SRY  VQINAVASLVNLSLE+ NK+KI RSGLVP+LIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        H+E+QEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGAL PLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGA T LLSMVKS NS +RLLLILCN+AVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE
        GRSAMLDA+AV  LV MLR KE+NSESTRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREIV+ GSERAREKAK IL+RM  +GRFD DD+++
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE

XP_022135520.1 U-box domain-containing protein 38 [Momordica charantia]8.0e-14999.66Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLE+RNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE
        GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE

XP_038879975.1 U-box domain-containing protein 38-like [Benincasa hispida]1.4e-12485.71Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISEEE+  L KL+SP+VF+QEEGVISLRKITK DE IRVSLCTPRILF+L  LITSRY  VQINAVASLVNLSLE+ NK+KI RSGLVP+LIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        HTE+QEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGAL PLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGA TTLLSMVKS NS +RLLLILCNIAVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE
        GRSAMLDADAVG LV MLR KE+NSESTRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREIV+ GSERAREKAK IL+RM  +GRFD DD+EE
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BVH8 RING-type E3 ubiquitin transferase4.4e-12182.65Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISE+E+  L+KL+SP+VF+QEEGV+SLRKITKADE IRVSLCTPRILF+L  LI SRY  VQINAVASLVNLSLE+ NK+KI RSGLVP+LIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        H+E+QEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGAL PLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGA T LLSMVKS NS +RLLLILCN+AVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE
        GRSAMLDA+AV  LV MLR KE+NSESTRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREIV+ GSERAREKAK IL+RM  +GRFD DD+++
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE

A0A5A7URV9 RING-type E3 ubiquitin transferase1.2e-12182.99Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISE+E+  L+KL+SP+VF+QEEGV+SLRKITKADE IRVSLCTPRILF+L  LI SRY  VQINAVASLVNLSLE+ NK+KI RSGLVP+LIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        H+E+QEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGAL PLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGA TTLLSMVKS NS +RLLLILCN+AVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE
        GRSAMLDA+AV  LV MLR KE+NSESTRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREIV+ GSERAREKAK IL+RM  +GRFD DD+++
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE

A0A5D3BFQ0 RING-type E3 ubiquitin transferase4.4e-12182.65Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISE+E+  L+KL+SP+VF+QEEGV+SLRKITKADE IRVSLCTPRILF+L  LI SRY  VQINAVASLVNLSLE+ NK+KI RSGLVP+LIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        H+E+QEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGAL PLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGA T LLSMVKS NS +RLLLILCN+AVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE
        GRSAMLDA+AV  LV MLR KE+NSESTRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREIV+ GSERAREKAK IL+RM  +GRFD DD+++
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRM--KGRFDGDDEEE

A0A6J1C194 RING-type E3 ubiquitin transferase3.9e-14999.66Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLE+RNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE
        GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE

A0A6J1EFK0 RING-type E3 ubiquitin transferase2.1e-11881.97Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        SSIS++E+ELLSKL SP+VFKQEEGVISLRKITK +EKIRVSLCTPRIL +LR LITSRYS VQINA+ASLVNLSLE+ NK KI RSGLVPNLID LKGG
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE
        H E+QEHAAGALFSLALEDENRM IGVLGAL PLLYALRS SE TR DSALCLYNLTMIQSNRVKL+KLGA TTLLSMVKSG+S++ LLLILCNIAVC E
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPE

Query:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMK--GRFDGDDEEE
        GRSAMLDA+AVG LV MLR KE+ S+STRENCVAALYALS+GSMRF+GLAKEA AMEVLREI + GS+RAREKAK IL+RMK  G F+ DD+EE
Subjt:  GRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMK--GRFDGDDEEE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WUF6 U-box domain-containing protein 411.2e-8661.22Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        S +S EEEE+ +KL+  ++F  E+G+I LRK+T++ E +RVSLCT RIL  LR L+ SRY+ VQ NA AS+VNLSLE++NKVKIVRSG VP LIDVLK G
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP
         TE+QEH AGALFSLALEDEN+M IGVLGA++PLL+ALR SESER R D+AL LY+L++I SNR +LV+ GA  TLLSMV+SG+S  R+LL+LCN+A CP
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP

Query:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEV---NSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDE
        +G+ AMLD +AV  LV  LR  EV   +SE+ RENCVA L  L  G++RFRGLA EA A EVL E+ + G+ER +EKA  IL  M+G   G+ E
Subjt:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEV---NSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDE

Q8VZ40 U-box domain-containing protein 142.0e-3334.19Show/hide
Query:  LLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHTESQEHAA
        LL KL +    +Q      LR + K +   RV +     +  L  L++S     Q ++V +L+NLS+   NK  IV +G + ++++VLK G  E++E+AA
Subjt:  LLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHTESQEHAA

Query:  GALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVK--SGNSVDRLLLILCNIAVCPEGRSAMLD
          LFSL++ DEN++AIG  GA+Q L+  L   + R + D+A  ++NL + Q N+ + VK G    L  ++K   G  VD  L IL  ++   EG++A+ +
Subjt:  GALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVK--SGNSVDRLLLILCNIAVCPEGRSAMLD

Query:  ADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQ
        A+++  LVE++RT    S   REN  A L+ L  G++    +A+E  A   L+E+ + G++RA+ KA  +L+
Subjt:  ADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQ

Q9FJP6 U-box domain-containing protein 381.0e-9062Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        S+ +EE+E + +KLKS E+F QE+G+I +RK+T+ +++ RVSLC+PRIL  L+ +I SRYS VQ NA+ASLVNLSL+++NK+ IVR G VP LIDVLK G
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP
          E+QEHAAG +FSL+LED+N+M IGVLGALQPLL+ALR +ES+RTR DSAL LY+LT+ Q+NR KLV+LGA   L SMV+SG S  R LL++CN+A C 
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP

Query:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLR-------TKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE
        EGRSAMLDA+AV  LV  LR       T+  +S S RENCVAAL+ALS  S+RF+GLAKEARA+EVL+E+ + G+ERAREKAK ILQ M+ R   DDEE+
Subjt:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLR-------TKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE

Q9FL17 U-box domain-containing protein 402.2e-8056.4Show/hide
Query:  SISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGH
        +++ EEE LL+KLKS  + + EE +IS+R+IT+ DE  R+SLCT R++ AL+ LI SRY+TVQ+N  A LVNLSLE+ NKVKIVRSG+VP LIDVLK G 
Subjt:  SISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGH

Query:  TESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG
         E+QEH+AG +FSLALEDEN+ AIGVLG L+PLL+ +R  +E TR DSAL LY+L+++QSNR KLVKLGA   LL MV  G  + R+LLILCN+A CP  
Subjt:  TESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG

Query:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSF-GSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDD
        R A+LD+  V C+V +LR     +ESTRE+CVA LY LS  G +RF+GLA  A A+E L ++   G ERA++KA+ +L+ ++ + + DD
Subjt:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSF-GSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDD

Q9STT1 U-box domain-containing protein 394.8e-8059.09Show/hide
Query:  ISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHT
        +S EEEE+ +KL S +    E+G+I LRK T+++E  R+SLCT RIL  LR LI SRY+ VQ NA AS+VNLSLE+ NK+KIVRSG VP LIDVLK G T
Subjt:  ISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHT

Query:  ESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG
        E+QEH  GALFSLA+E+EN+M IGVLGA++PLL+ALR SESER R D+AL LY+L++I +NR +LVK GA   +LSM++SG S  R+LL+LCN+A C EG
Subjt:  ESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG

Query:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTK--EVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIV--DGGSERAREKAKMILQRMKG
        + AMLD +AV  LV  LR      +  + RENCV AL  LS G+MRFRGLA EA A E+L EIV  + GS R +EKA  ILQ ++G
Subjt:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTK--EVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIV--DGGSERAREKAKMILQRMKG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G47820.1 PLANT U-BOX 393.4e-8159.09Show/hide
Query:  ISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHT
        +S EEEE+ +KL S +    E+G+I LRK T+++E  R+SLCT RIL  LR LI SRY+ VQ NA AS+VNLSLE+ NK+KIVRSG VP LIDVLK G T
Subjt:  ISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHT

Query:  ESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG
        E+QEH  GALFSLA+E+EN+M IGVLGA++PLL+ALR SESER R D+AL LY+L++I +NR +LVK GA   +LSM++SG S  R+LL+LCN+A C EG
Subjt:  ESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG

Query:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTK--EVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIV--DGGSERAREKAKMILQRMKG
        + AMLD +AV  LV  LR      +  + RENCV AL  LS G+MRFRGLA EA A E+L EIV  + GS R +EKA  ILQ ++G
Subjt:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTK--EVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIV--DGGSERAREKAKMILQRMKG

AT3G54850.1 plant U-box 141.4e-3434.19Show/hide
Query:  LLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHTESQEHAA
        LL KL +    +Q      LR + K +   RV +     +  L  L++S     Q ++V +L+NLS+   NK  IV +G + ++++VLK G  E++E+AA
Subjt:  LLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHTESQEHAA

Query:  GALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVK--SGNSVDRLLLILCNIAVCPEGRSAMLD
          LFSL++ DEN++AIG  GA+Q L+  L   + R + D+A  ++NL + Q N+ + VK G    L  ++K   G  VD  L IL  ++   EG++A+ +
Subjt:  GALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVK--SGNSVDRLLLILCNIAVCPEGRSAMLD

Query:  ADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQ
        A+++  LVE++RT    S   REN  A L+ L  G++    +A+E  A   L+E+ + G++RA+ KA  +L+
Subjt:  ADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQ

AT5G40140.1 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain1.5e-8156.4Show/hide
Query:  SISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGH
        +++ EEE LL+KLKS  + + EE +IS+R+IT+ DE  R+SLCT R++ AL+ LI SRY+TVQ+N  A LVNLSLE+ NKVKIVRSG+VP LIDVLK G 
Subjt:  SISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGH

Query:  TESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG
         E+QEH+AG +FSLALEDEN+ AIGVLG L+PLL+ +R  +E TR DSAL LY+L+++QSNR KLVKLGA   LL MV  G  + R+LLILCN+A CP  
Subjt:  TESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEG

Query:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSF-GSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDD
        R A+LD+  V C+V +LR     +ESTRE+CVA LY LS  G +RF+GLA  A A+E L ++   G ERA++KA+ +L+ ++ + + DD
Subjt:  RSAMLDADAVGCLVEMLRTKEVNSESTRENCVAALYALSF-GSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDD

AT5G62560.1 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain8.4e-8861.22Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        S +S EEEE+ +KL+  ++F  E+G+I LRK+T++ E +RVSLCT RIL  LR L+ SRY+ VQ NA AS+VNLSLE++NKVKIVRSG VP LIDVLK G
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP
         TE+QEH AGALFSLALEDEN+M IGVLGA++PLL+ALR SESER R D+AL LY+L++I SNR +LV+ GA  TLLSMV+SG+S  R+LL+LCN+A CP
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP

Query:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEV---NSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDE
        +G+ AMLD +AV  LV  LR  EV   +SE+ RENCVA L  L  G++RFRGLA EA A EVL E+ + G+ER +EKA  IL  M+G   G+ E
Subjt:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLRTKEV---NSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDE

AT5G65200.1 plant U-box 387.3e-9262Show/hide
Query:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG
        S+ +EE+E + +KLKS E+F QE+G+I +RK+T+ +++ RVSLC+PRIL  L+ +I SRYS VQ NA+ASLVNLSL+++NK+ IVR G VP LIDVLK G
Subjt:  SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGG

Query:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP
          E+QEHAAG +FSL+LED+N+M IGVLGALQPLL+ALR +ES+RTR DSAL LY+LT+ Q+NR KLV+LGA   L SMV+SG S  R LL++CN+A C 
Subjt:  HTESQEHAAGALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALR-SESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCP

Query:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLR-------TKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE
        EGRSAMLDA+AV  LV  LR       T+  +S S RENCVAAL+ALS  S+RF+GLAKEARA+EVL+E+ + G+ERAREKAK ILQ M+ R   DDEE+
Subjt:  EGRSAMLDADAVGCLVEMLR-------TKEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCATCGATCTCCGAAGAAGAGGAGGAATTATTGTCGAAGCTCAAGAGTCCTGAAGTGTTTAAGCAAGAAGAAGGTGTTATTTCGCTGAGAAAGATTACGAAAGCCGACGA
GAAAATTAGGGTTTCGCTTTGCACGCCTCGGATTCTTTTTGCCCTCCGCCTCTTGATAACATCGAGATACTCCACCGTACAAATCAACGCCGTCGCCTCTCTGGTGAATC
TCTCCCTCGAAAGGCGCAACAAAGTGAAGATCGTGCGGTCAGGATTGGTTCCGAACTTAATCGACGTGCTAAAAGGGGGACATACCGAGTCGCAAGAACACGCCGCCGGC
GCGCTCTTCAGCCTGGCGTTGGAGGACGAAAATCGGATGGCGATCGGAGTCCTCGGCGCGCTTCAGCCGCTCCTCTACGCGCTCCGATCGGAAAGCGAGCGGACTCGAGA
CGATTCCGCTCTGTGTCTGTACAACCTAACAATGATCCAGAGCAACCGAGTGAAGCTCGTGAAACTCGGCGCCGCGACAACTCTACTTTCCATGGTGAAATCGGGAAACT
CGGTGGACCGGCTGCTGCTGATTCTCTGCAACATCGCCGTGTGCCCGGAGGGGAGGTCGGCAATGCTGGACGCCGACGCCGTCGGGTGCTTGGTGGAGATGCTGAGGACG
AAGGAGGTGAACTCCGAGTCGACTCGCGAGAACTGCGTGGCGGCATTGTACGCGCTCAGCTTCGGAAGTATGAGATTCAGAGGACTGGCGAAAGAAGCTAGGGCAATGGA
GGTGCTGCGAGAGATTGTGGACGGAGGAAGCGAGAGGGCGAGGGAGAAGGCGAAGATGATTTTGCAGAGGATGAAGGGAAGATTCGACGGAGACGATGAAGAAGAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCATCGATCTCCGAAGAAGAGGAGGAATTATTGTCGAAGCTCAAGAGTCCTGAAGTGTTTAAGCAAGAAGAAGGTGTTATTTCGCTGAGAAAGATTACGAAAGCCGACGA
GAAAATTAGGGTTTCGCTTTGCACGCCTCGGATTCTTTTTGCCCTCCGCCTCTTGATAACATCGAGATACTCCACCGTACAAATCAACGCCGTCGCCTCTCTGGTGAATC
TCTCCCTCGAAAGGCGCAACAAAGTGAAGATCGTGCGGTCAGGATTGGTTCCGAACTTAATCGACGTGCTAAAAGGGGGACATACCGAGTCGCAAGAACACGCCGCCGGC
GCGCTCTTCAGCCTGGCGTTGGAGGACGAAAATCGGATGGCGATCGGAGTCCTCGGCGCGCTTCAGCCGCTCCTCTACGCGCTCCGATCGGAAAGCGAGCGGACTCGAGA
CGATTCCGCTCTGTGTCTGTACAACCTAACAATGATCCAGAGCAACCGAGTGAAGCTCGTGAAACTCGGCGCCGCGACAACTCTACTTTCCATGGTGAAATCGGGAAACT
CGGTGGACCGGCTGCTGCTGATTCTCTGCAACATCGCCGTGTGCCCGGAGGGGAGGTCGGCAATGCTGGACGCCGACGCCGTCGGGTGCTTGGTGGAGATGCTGAGGACG
AAGGAGGTGAACTCCGAGTCGACTCGCGAGAACTGCGTGGCGGCATTGTACGCGCTCAGCTTCGGAAGTATGAGATTCAGAGGACTGGCGAAAGAAGCTAGGGCAATGGA
GGTGCTGCGAGAGATTGTGGACGGAGGAAGCGAGAGGGCGAGGGAGAAGGCGAAGATGATTTTGCAGAGGATGAAGGGAAGATTCGACGGAGACGATGAAGAAGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SSISEEEEELLSKLKSPEVFKQEEGVISLRKITKADEKIRVSLCTPRILFALRLLITSRYSTVQINAVASLVNLSLERRNKVKIVRSGLVPNLIDVLKGGHTESQEHAAG
ALFSLALEDENRMAIGVLGALQPLLYALRSESERTRDDSALCLYNLTMIQSNRVKLVKLGAATTLLSMVKSGNSVDRLLLILCNIAVCPEGRSAMLDADAVGCLVEMLRT
KEVNSESTRENCVAALYALSFGSMRFRGLAKEARAMEVLREIVDGGSERAREKAKMILQRMKGRFDGDDEEE