; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002055 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002055
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionDirigent protein
Genome locationscaffold30:2081979..2082527
RNA-Seq ExpressionMS002055
SyntenyMS002055
Gene Ontology termsGO:0048046 - apoplast (cellular component)
InterPro domainsIPR004265 - Dirigent protein
IPR044859 - Allene oxide cyclase/Dirigent protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EOY22152.1 Disease resistance response protein, putative [Theobroma cacao]5.0e-6472.16Show/hide
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KAA0058015.1 dirigent protein 22-like [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-8488.52Show/hide
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XP_021286251.1 dirigent protein 22-like [Herrania umbratica]2.9e-6471.59Show/hide
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XP_022135557.1 dirigent protein 22-like [Momordica charantia]4.2e-95100Show/hide
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XP_031742018.1 dirigent protein 22-like [Cucumis sativus]4.8e-8387.91Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061FZ84 Dirigent protein2.4e-6472.16Show/hide
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A0A0A0LPF3 Dirigent protein2.3e-8387.91Show/hide
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A0A5D3BJ74 Dirigent protein5.5e-8588.52Show/hide
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A0A6J1AHG7 Dirigent protein1.4e-6471.59Show/hide
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A0A6J1C315 Dirigent protein2.0e-95100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67YM6 Dirigent protein 112.6e-3144.97Show/hide
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Q84TH6 Dirigent protein 232.1e-3348.34Show/hide
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        +N  M+ +REMP+VGGTG FR+ARGY +ART  F  +  DA++GYNVT++H
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Q9C523 Dirigent protein 196.8e-3243.18Show/hide
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          LLM + FAI  G YNGS+ +V+GRN +  +VREMPV+GG+G FR ARGY  A T  F+ +  +A++ YN  L+H
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Q9FIG7 Dirigent protein 28.9e-3246.98Show/hide
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Q9SS03 Dirigent protein 214.4e-3147.68Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22900.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein1.8e-3244.97Show/hide
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AT1G58170.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein4.8e-3343.18Show/hide
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AT1G65870.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein3.1e-3247.68Show/hide
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AT2G21100.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein1.5e-3448.34Show/hide
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AT5G42500.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein6.3e-3346.98Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGTTTCCAGGAAGAGTCTGCTGATATCCTTGGCGATTCTCGTGGCCGCTCATTCAATCGAGGCGTTAAACCCTAACGTGACTCGTATCCAGTTCTATATGCACGA
TATTGTTAGTGGTCCGAACGCCACCGCCGTTCAAGTCGCCGGAAGGCGAACGAACTACACGGGTTCGGATCCGATTGCTGCAATGTTTGGGTCCGTTTTCATGATGGACA
ACCCGCTCACTGCCACGCCGGAGTTGAACTCGACGTTGATTGGGCGTGCTCAGGGGATTTATGCAATGTCGTCTCAGCAAAATGAGTTCAGCCTTTTGATGACGCTAACC
TTCGCGATTACCGGCGGAACCTACAACGGTAGCTCGTTCAGCGTAGTTGGGCGGAATCCGATCATGAGCGAAGTCCGGGAAATGCCGGTCGTCGGAGGGACGGGAGCTTT
CCGGCTGGCTCGTGGGTATTGCTTAGCTAGGACATTCTCGTTCAGAGAAATGGATGCTGTGATAGGCTACAACGTAACATTGATTCACGATCTGTACGACTACTCCGGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGTTTCCAGGAAGAGTCTGCTGATATCCTTGGCGATTCTCGTGGCCGCTCATTCAATCGAGGCGTTAAACCCTAACGTGACTCGTATCCAGTTCTATATGCACGA
TATTGTTAGTGGTCCGAACGCCACCGCCGTTCAAGTCGCCGGAAGGCGAACGAACTACACGGGTTCGGATCCGATTGCTGCAATGTTTGGGTCCGTTTTCATGATGGACA
ACCCGCTCACTGCCACGCCGGAGTTGAACTCGACGTTGATTGGGCGTGCTCAGGGGATTTATGCAATGTCGTCTCAGCAAAATGAGTTCAGCCTTTTGATGACGCTAACC
TTCGCGATTACCGGCGGAACCTACAACGGTAGCTCGTTCAGCGTAGTTGGGCGGAATCCGATCATGAGCGAAGTCCGGGAAATGCCGGTCGTCGGAGGGACGGGAGCTTT
CCGGCTGGCTCGTGGGTATTGCTTAGCTAGGACATTCTCGTTCAGAGAAATGGATGCTGTGATAGGCTACAACGTAACATTGATTCACGATCTGTACGACTACTCCGGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FAITGGTYNGSSFSVVGRNPIMSEVREMPVVGGTGAFRLARGYCLARTFSFREMDAVIGYNVTLIHDLYDYSG