; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002125 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002125
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationscaffold30:2531247..2531984
RNA-Seq ExpressionMS002125
SyntenyMS002125
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0006952 - defense response (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039607 - VQ motif-containing protein 8/17/18/20/21/25
IPR039832 - VQ motif-containing protein 20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587652.1 VQ motif-containing protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-8675.98Show/hide
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KAG7021613.1 VQ motif-containing protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-8677.17Show/hide
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XP_022135386.1 VQ motif-containing protein 20 [Momordica charantia]1.5e-13299.59Show/hide
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XP_022933476.1 VQ motif-containing protein 20-like [Cucurbita moschata]2.8e-8677.17Show/hide
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XP_023007145.1 VQ motif-containing protein 20-like [Cucurbita maxima]4.3e-8778.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKA6 VQ domain-containing protein3.8e-7370.08Show/hide
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        NIPVY PNST+FLC N QP FNY+D SLLFG+ NI SLSS     NG++DF ++
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A0A1S3BXM8 VQ motif-containing protein 206.7e-7064.5Show/hide
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        MSP QQ+HGKRDN      N NGN   LCPPPLKINKDSH IRK+SSSS    SSPSSSSSST+SLVNGV    A  AKP QRHPVIIYTHSPK+IHTHP
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        A+SYLTNIP+Y PNS +FLC+N QP FNY+D SLLFG   +            +NDFC+YSE
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A0A6J1C0L6 VQ motif-containing protein 207.3e-13399.59Show/hide
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A0A6J1EZ55 VQ motif-containing protein 20-like1.3e-8677.17Show/hide
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A0A6J1L266 VQ motif-containing protein 20-like2.1e-8778.35Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HWF9 Nuclear speckle RNA-binding protein B6.2e-0432.38Show/hide
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Query:  KIISS
         ++ +
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Q9CA36 VQ motif-containing protein 8, chloroplastic2.3e-0635.83Show/hide
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        NG  P  LK+  +SH I+K+SS  S P     ++                   PVIIY HSPK+IHT   DFMALVQ+LTGL   D+    N+  ++ S 
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Query:  EENKIISSKVVVTSDDNESS
             + ++ V   DDN ++
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Q9LS54 VQ motif-containing protein 202.3e-2739.33Show/hide
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        PP LK+NKDSH I+K      SPSS SS+             AKP  RHPVIIYTH+P+IIHT+P+DFMALVQKLTG++ SD++ G  +    P   KS 
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          N+ +S   V                                 + S+D+ESSSV+TT+EN    G V   +  ++   PP     PPPPPPPP +    
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             +YL   P++ P N  D FLC N QPF N++D   LF APN+ S   SS++S  +G+ +F D+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21320.1 nucleotide binding;nucleic acid binding4.4e-0532.38Show/hide
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        P PLK+  DSH  I+K   +   P      T            ++PP   PV IYT +P+IIHTHP +FM LVQ+LTG + +   + ++S + ++  + +
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         ++ +
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AT1G21326.1 VQ motif-containing protein2.0e-0534.29Show/hide
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        P PLK+  DSH  I+K   +   P      T            ++PP   PVIIYT SP+IIHTHP +FM LVQ+LTG + +   + + S + +   + +
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AT1G68450.1 VQ motif-containing protein1.6e-0735.83Show/hide
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        NG  P  LK+  +SH I+K+SS  S P     ++                   PVIIY HSPK+IHT   DFMALVQ+LTGL   D+    N+  ++ S 
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Subjt:  EENKIISSKVVVTSDDNESS

AT3G18360.1 VQ motif-containing protein1.7e-2839.33Show/hide
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        PP LK+NKDSH I+K      SPSS SS+             AKP  RHPVIIYTH+P+IIHT+P+DFMALVQKLTG++ SD++ G  +    P   KS 
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Query:  EENKIISSKVV---------------------------------VTSDDNESSSVVTTDENCCGSGVVEGQV--NSCFAPPM--FEPPPPPPPPQV----
          N+ +S   V                                 + S+D+ESSSV+TT+EN    G V   +  ++   PP     PPPPPPPP +    
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             +YL   P++ P N  D FLC N QPF N++D   LF APN+ S   SS++S  +G+ +F D+
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AT3G18690.1 MAP kinase substrate 11.3e-0433.33Show/hide
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        P PL ++KDSH I+K     + P +                   PP   R PV+IY  SPK++H    +FM +VQ+LTG+S          G  SP A  
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Query:  SGEEN
        +  EN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCCCTCAACAGCTCCATGGGAAGAGGGATAATGGCAGTACCACCGCCAATAATGGCAACGGCAATGGCAATGGATTGTGTCCGCCTCCGTTGAAGATCAATAAGGA
TTCTCATTTCATCAGAAAATCCTCGTCGTCTTCCTCTTCTCCTTCCTCGTCTTCCTCTTCCACCTCGTCGCTCGTCAATGGCGTCGTAGGCGCCGGCTGCGCCAAGCCGC
CGCAGCGGCATCCGGTGATTATATACACGCATTCTCCCAAAATCATCCACACGCATCCTCGAGATTTTATGGCATTGGTTCAGAAGCTCACCGGATTGTCTCGCTCGGAT
GACGAAGCGGGAGCTAATTCTCCGAACGCGACGAAATCTGGCGAGGAGAATAAAATCATTAGCTCCAAAGTCGTGGTGACGAGTGACGATAATGAGTCGTCGTCCGTTGT
GACGACGGATGAAAATTGCTGCGGCAGCGGCGTGGTGGAAGGTCAGGTTAATTCGTGTTTCGCTCCGCCGATGTTCGAGCCACCGCCGCCGCCACCGCCACCGCAAGTAG
CGAGTTCGTACCTAACGAACATCCCTGTTTACAGGCCGAATTCGACGGACTTTTTGTGCTCTAATCATCAACCGTTTTTTAACTACAACGATTCTTCTTTGCTTTTTGGT
GCTCCAAATATCCATTCTCTTTCGTCCGCTAATTCAACATTGAATGGAATTAATGATTTCTGCGACTATAGCGAATAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCCCTCAACAGCTCCATGGGAAGAGGGATAATGGCAGTACCACCGCCAATAATGGCAACGGCAATGGCAATGGATTGTGTCCGCCTCCGTTGAAGATCAATAAGGA
TTCTCATTTCATCAGAAAATCCTCGTCGTCTTCCTCTTCTCCTTCCTCGTCTTCCTCTTCCACCTCGTCGCTCGTCAATGGCGTCGTAGGCGCCGGCTGCGCCAAGCCGC
CGCAGCGGCATCCGGTGATTATATACACGCATTCTCCCAAAATCATCCACACGCATCCTCGAGATTTTATGGCATTGGTTCAGAAGCTCACCGGATTGTCTCGCTCGGAT
GACGAAGCGGGAGCTAATTCTCCGAACGCGACGAAATCTGGCGAGGAGAATAAAATCATTAGCTCCAAAGTCGTGGTGACGAGTGACGATAATGAGTCGTCGTCCGTTGT
GACGACGGATGAAAATTGCTGCGGCAGCGGCGTGGTGGAAGGTCAGGTTAATTCGTGTTTCGCTCCGCCGATGTTCGAGCCACCGCCGCCGCCACCGCCACCGCAAGTAG
CGAGTTCGTACCTAACGAACATCCCTGTTTACAGGCCGAATTCGACGGACTTTTTGTGCTCTAATCATCAACCGTTTTTTAACTACAACGATTCTTCTTTGCTTTTTGGT
GCTCCAAATATCCATTCTCTTTCGTCCGCTAATTCAACATTGAATGGAATTAATGATTTCTGCGACTATAGCGAATAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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