; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002128 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002128
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiontranscription factor JAMYB-like
Genome locationscaffold30:2554233..2555171
RNA-Seq ExpressionMS002128
SyntenyMS002128
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0003824 - catalytic activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain
IPR044676 - MYB-like transcription factor EOBI/EOBII-like, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587655.1 Transcription factor MYB2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-9169.45Show/hide
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         T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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XP_022135411.1 transcription factor JAMYB-like [Momordica charantia]1.8e-14199.2Show/hide
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        FSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
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XP_022926469.1 transcription factor JAMYB-like [Cucurbita moschata]1.0e-9169.45Show/hide
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        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IINRFWIPRLVQQI+E  S++SPSSS SS  P           QLSD+D       KR  F
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         T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG+     T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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XP_023531056.1 transcription factor JAMYB-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-9169.34Show/hide
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        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IINRFWIPRLVQQI+E  S++SPSSS SS  P          QLSD+D       KR  F 
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        T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG+     T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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XP_038901337.1 transcription factor MYB62-like [Benincasa hispida]1.4e-8867.42Show/hide
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        ++SQ+SS  SS V+EDDQ  +RRGPW+ DEDSLLI SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSP EQLLILDLH RWGNRWSK
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        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAK+LNI+ NSPEFKDII+R WIPRL+ QI+E SS+S   P+++++S +PQLSDSD            +K     ++
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Query:  EEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGGG-GDMGDFDYPIG----EFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
        E  +    SDPL  SD VPSWNHGGG     +FDYPIG    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BWZ6 transcription factor MYB24-like1.8e-8666.28Show/hide
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        SS  SS+ +EDDQ  +RRGPW+ DEDSLLI SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKP+V+RGNLSP EQLLILDLH RWGNRWSKIAQ+L
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Query:  PGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSPQLSDSDE------KRPRF----VTAEEDEKVTGS
        PGRTDNEIKNYWRT+VQ+QAK+LNI TNSPEFKDIINR WIPRL+ QI++ SS   P ++++  +PQ SDSD        R  F     ++E  E    S
Subjt:  PGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSPQLSDSDE------KRPRF----VTAEEDEKVTGS

Query:  DPLLFSDVVPSWNHGGGGD-MGDFDYPIG----EFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
        DP  FSD VPSWNHGGG     +F+Y  G    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
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A0A5D3DYB4 Transcription factor MYB24-like1.8e-8666.28Show/hide
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        SS  SS+ +EDDQ  +RRGPW+ DEDSLLI SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKP+V+RGNLSP EQLLILDLH RWGNRWSKIAQ+L
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Query:  PGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSPQLSDSDE------KRPRF----VTAEEDEKVTGS
        PGRTDNEIKNYWRT+VQ+QAK+LNI TNSPEFKDIINR WIPRL+ QI++ SS   P ++++  +PQ SDSD        R  F     ++E  E    S
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Query:  DPLLFSDVVPSWNHGGGGD-MGDFDYPIG----EFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
        DP  FSD VPSWNHGGG     +F+Y  G    + T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
Subjt:  DPLLFSDVVPSWNHGGGGD-MGDFDYPIG----EFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF

A0A6J1C0P4 transcription factor JAMYB-like8.9e-14299.2Show/hide
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Query:  KIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLL
        KIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSP SSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLL
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        FSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
Subjt:  FSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF

A0A6J1EF71 transcription factor JAMYB-like4.9e-9269.45Show/hide
Query:  AKSQTSSCSSSTVVEDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSK
        ++SQ+SSCSSS VVED Q GLRRGPWT DEDSLL+ SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSP EQLLILDLH RWGNRWSK
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Query:  IAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSP-----------QLSDSDE------KRPRF
        IAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IINRFWIPRLVQQI+E  S++SPSSS SS  P           QLSD+D       KR  F
Subjt:  IAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSP-----------QLSDSDE------KRPRF

Query:  VTAEEDEKVTG------SDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGE----FTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
         T +             SDP  FSD VPSWNHG      DF YPIG+     T W+++DDS  G LWNF+GLWQF
Subjt:  VTAEEDEKVTG------SDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGE----FTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF

A0A6J1I942 transcription factor MYB62-like1.1e-8665.84Show/hide
Query:  SLMA---KSQTSSCS-SSTVVEDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCR
        SLMA   K+Q+ S S SS+VVED+Q GLRRGPWT DEDSLL+ SISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSP EQLLILDLH R
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Query:  WGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSP----------QLSDSD------
        WGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTRVQ+QAKLLNIDTNS EFK+IIN FWIPRLV QI+E  S++SPSSS SS  P          QLSD+D      
Subjt:  WGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSP----------QLSDSD------

Query:  ------EKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGE----FTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF
              +      ++E  +    SDP  FSD VPSWNH        F+YPIG      T W+++DD+  G LWNF+GLWQF
Subjt:  ------EKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGGGGDMGDFDYPIGE----FTSWMEEDDSDCGGLWNFEGLWQF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10MB4 Transcription factor MYB22.5e-5661.73Show/hide
Query:  EDDQIG--LRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNE
        E++ +G  LRRGPWT +ED LL+  I+ HGEGRWN LA  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PD++RGN++P EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNE
Subjt:  EDDQIG--LRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNE

Query:  IKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSPQLS
        IKNYWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD++   W+PRLV++I   ++         + +P LS
Subjt:  IKNYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSSPQLS

Q2QZJ8 Transcription factor JAMYB2.7e-5551.29Show/hide
Query:  LRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTR
        LRRGPWT DED  LI  IS HGEGRWN LA  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PDVKRGN +  EQLLILDLH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYWRTR
Subjt:  LRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTR

Query:  VQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES---------SNSSPSSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGG
        VQ+ AK LN D NS  FKD +   W+PRL ++IH  +         SN+  S  S  +   +++  +  P  VT+   +  T     L    +    HG 
Subjt:  VQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES---------SNSSPSSSSSSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHGG

Query:  GGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFE
           M   D        WM+E D +    W+ E
Subjt:  GGDMGDFDYPIGEFTSWMEEDDSDCGGLWNFE

Q9C9G7 Transcription factor MYB627.9e-5561.64Show/hide
Query:  EDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIK
        E +   LRRGPWT +ED+LL   I  +GEGRWN +A  +GL+RTGKSCRLRWLNYLKPD++RGNL+P EQLLIL+LH +WGNRWSKIAQ LPGRTDNEIK
Subjt:  EDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIK

Query:  NYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSS----PSSSSSSS
        NYWRTRVQ+QA+ LNI++NS +F D +  FW+PRL++++ + SS ++    P +++++S
Subjt:  NYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSS----PSSSSSSS

Q9FGY3 Transcription factor MYB789.7e-5363.92Show/hide
Query:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN
        ++++ +RRGPWT +ED  LI  I+ HGEGRWN LA  + L+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RGN++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
Subjt:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN

Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNS-SPSSSSSSSSPQ
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S  S S SS  ++SS Q
Subjt:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNS-SPSSSSSSSSPQ

Q9LDE1 Transcription factor MYB1085.1e-5461.29Show/hide
Query:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN
        +D++ L+RGPWTA+ED  L+  I+ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RGN++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
Subjt:  DDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKN

Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSS
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S++S+ ++++++++
Subjt:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G25340.1 myb domain protein 1161.6e-5562.66Show/hide
Query:  RRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRV
        R+GPWT +ED+LL   IS +GEGRWNLLA  SGL+R GKSCRLRWLNYLKPD+KRGNL+P EQLLIL+LH +WGNRWSKI++ LPGRTDN+IKNYWRTRV
Subjt:  RRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYWRTRV

Query:  QRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES-SNSSPSSSSSSSSPQLSDSDE
        Q+QA+ LNID+NS +F +++  FW PRL+ +I + S +N+  +++     P L DS +
Subjt:  QRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEES-SNSSPSSSSSSSSPQLSDSDE

AT1G48000.1 myb domain protein 1123.6e-5550Show/hide
Query:  QIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYW
        +I +RRGPWT +ED  L+  IS+HGEGRWN L+  +GL RTGKSCRLRWLNYL+PD++RG++S  EQ +IL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKNYW
Subjt:  QIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIKNYW

Query:  RTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLV------QQIHEESSNSSPSSSS-SSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHG
        RTRVQ+ AKLL  D NS +FKD I   W+PRL+      Q +   S++ SP +SS ++++   S S+  R  F          G D + F  +    N G
Subjt:  RTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLV------QQIHEESSNSSPSSSS-SSSSPQLSDSDEKRPRFVTAEEDEKVTGSDPLLFSDVVPSWNHG

Query:  ---GGGDMGDFDYPIGEFTSWM
            GGD  +      E   W+
Subjt:  ---GGGDMGDFDYPIGEFTSWM

AT1G68320.1 myb domain protein 625.6e-5661.64Show/hide
Query:  EDDQIGLRRGPWTADEDSLLIRSISVHGEGRWNLLAIRSGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLSPHEQLLILDLHCRWGNRWSKIAQELPGRTDNEIK
        E +   LRRGPWT +ED+LL   I  +GEGRWN +A  +GL+RTGKSCRLRWLNYLKPD++RGNL+P EQLLIL+LH +WGNRWSKIAQ LPGRTDNEIK
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Query:  NYWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSS----PSSSSSSS
        NYWRTRVQ+QA+ LNI++NS +F D +  FW+PRL++++ + SS ++    P +++++S
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AT3G06490.1 myb domain protein 1083.6e-5561.29Show/hide
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        +D++ L+RGPWTA+ED  L+  I+ +GEGRWN L+  +GL+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RGN++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
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Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNSSPSSSSSSSS
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S++S+ ++++++++
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AT5G49620.1 myb domain protein 786.9e-5463.92Show/hide
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        ++++ +RRGPWT +ED  LI  I+ HGEGRWN LA  + L+RTGKSCRLRWLNYL+PDV+RGN++  EQLLIL+LH RWGNRWSKIAQ LPGRTDNEIKN
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Query:  YWRTRVQRQAKLLNIDTNSPEFKDIINRFWIPRLVQQIHEESSNS-SPSSSSSSSSPQ
        YWRTRVQ+ AK L  D NS +FKD +   W+PRLV++I   S  S S SS  ++SS Q
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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