CuGenDBv2

Gene ID	MS002167
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	scaffold30:2910429..2913983
RNA-Seq Expression	MS002167
Synteny	MS002167
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR021562 - Protein of unknown function DUF3007

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6587693.1 Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.0e-88

81.57

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+  HG PN RIFCEREG+LFLG SAAPVLPQR  VYGHF + RG+S+RLSKKE  DFP KG F  + +V TVPRDSSSSNT  SSS+DDP+NQS+   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVL IGLGVT+LGFGLKSGLEFAG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQ N
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

KAG7021658.1 hypothetical protein SDJN02_15384, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.0e-92

83.41

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+  HG PN RIFCEREG+LFLG SAAPVLPQR  VYGHF + RG+S+RLSKKE  DFP KG F  + +V TVPRDSSSSNT  SSS+DDP+NQS+ARQ
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
        L QTPFGYTRKDVL IG GVT+LGFGLKSGLEFAG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

XP_022134582.1 uncharacterized protein LOC111006814 [Momordica charantia]

1.0e-108

97.24

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSE   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGW+STYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

XP_022925672.1 uncharacterized protein LOC111433018 [Cucurbita moschata]

1.8e-89

82.49

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+ THG PN RIFCEREG+LFLG SAAPVLPQR  VYGHF + RG+S RLSKKE  DFP KG F  + +V TVPRDSSSSNT  SSS+DDP+NQS+   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVL IGLGVT+LGFGLKSGLEFAG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

XP_038880733.1 uncharacterized protein LOC120072335 [Benincasa hispida]

7.4e-91

83.41

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+ THG  N RIFCEREG+LFLGISAAPVLPQR  VYGHF + RGTSRRLSKKE  DFP KG FA R +V TVPRDSSSSNT  S+SK+DP+NQSE   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          +TPFGYTRKDVL IGLGVT+LGFGLK+GLE+AGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAEL+ALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LPZ9 Uncharacterized protein

2.0e-86

81.57

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+ T G  N RIF EREG+LFLGISAAPVLPQ   VYGHF + RGTSRRLSKKE  DFP KG F  R +V TVP+DSSSSNTSSS+  DD +NQ+E   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVL IGLGVT+LGFGLKSGLE+AGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSAS EQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

A0A1S3BX71 uncharacterized protein LOC103494194

4.8e-88

82.49

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+ THG  NFRIF EREG+LFLGISAAPVLPQ   VYG F + RGTSRRLSKKE  DFP KG FA R +V TVP+DSSSSNTSSS+  +DP+NQSE   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVL IGLGVT+LGFGLKSGLE+AGYD MQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVS+KDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSAS EQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

A0A6J1C000 uncharacterized protein LOC111006814

5.0e-109

97.24

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSE   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGW+STYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

A0A6J1EFX7 uncharacterized protein LOC111433018

8.8e-90

82.49

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+ THG PN RIFCEREG+LFLG SAAPVLPQR  VYGHF + RG+S RLSKKE  DFP KG F  + +V TVPRDSSSSNT  SSS+DDP+NQS+   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVL IGLGVT+LGFGLKSGLEFAG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

A0A6J1IDW5 uncharacterized protein LOC111471752

1.7e-88

81.57

Show/hide

Query:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ
        MA+ THG PN RIFCEREG+LFLG SAAPVLPQR  VY HF + RG+S+RLSKKE  DFP KG F  + +V TVPRDSSSSN  +SSS+DDP+NQS+   
Subjt:  MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQ

Query:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL
          QTPFGYTRKDVL IGLGVT+LGFGLKSGLEFAG+DPMQAGNVVQLVLVLGLTL WISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVM+KRLESLTEAELVALL
Subjt:  LSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALL

Query:  EQVEEEKSQSASGEQVN
        EQVEEEKSQSASGEQVN
Subjt:  EQVEEEKSQSASGEQVN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G17930.1 unknown protein

8.8e-42

69.11

Show/hide

Query:  SSKDDPSNQSEARQLSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQK
        SS    +    A +   TPFGYTRKDV+ IG+GVT LG GL+SGLE+ G DP+QAGN VQL+LVLGLTLGWISTY+FRV NK+MTYAQQLRDYE +VMQK
Subjt:  SSKDDPSNQSEARQLSQTPFGYTRKDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQK

Query:  RLESLTEAELVALLEQVEEEKSQ
        RLESL+EAEL AL+ QV+EEK++
Subjt:  RLESLTEAELVALLEQVEEEKSQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGATTTTGACACATGGAAGTCCGAATTTCAGAATTTTCTGTGAAAGGGAGGGGAGCTTGTTTTTAGGTATTTCTGCTGCTCCAGTTTTGCCTCAGAGGGTGGGAGT
TTACGGGCATTTTGTGAAAGGGAGAGGAACTAGTCGAAGGTTGTCGAAGAAGGAACTCTGTGATTTCCCTGGGAAAGGATCCTTTGCCGCAAGGAACATTGTCTTCACTG
TCCCTAGGGACAGTAGCTCTTCAAACACAAGCAGCAGCAGCAGCAAGGACGATCCTTCAAATCAATCCGAGGCAAGGCAACTATCTCAAACACCTTTTGGTTACACGAGG
AAGGATGTTTTATTCATTGGATTGGGCGTCACAATTCTTGGATTTGGGTTGAAAAGTGGATTAGAGTTTGCTGGGTATGATCCCATGCAAGCAGGCAACGTGGTCCAGCT
TGTACTGGTTTTGGGCTTAACGCTTGGATGGATTTCCACGTACATGTTCAGAGTTTCAAACAAGGATATGACATATGCTCAACAACTACGTGATTACGAGGACAAAGTCA
TGCAGAAACGTCTGGAGAGCCTTACAGAAGCCGAGCTAGTAGCGTTGCTTGAACAAGTCGAGGAAGAGAAGAGCCAGTCAGCTAGTGGTGAGCAGGTCAAT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAILTHGSPNFRIFCEREGSLFLGISAAPVLPQRVGVYGHFVKGRGTSRRLSKKELCDFPGKGSFAARNIVFTVPRDSSSSNTSSSSSKDDPSNQSEARQLSQTPFGYTR
KDVLFIGLGVTILGFGLKSGLEFAGYDPMQAGNVVQLVLVLGLTLGWISTYMFRVSNKDMTYAQQLRDYEDKVMQKRLESLTEAELVALLEQVEEEKSQSASGEQVN

MS002167 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome