; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002213 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002213
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionbasic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
Genome locationscaffold30:3279493..3282868
RNA-Seq ExpressionMS002213
SyntenyMS002213
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022987353.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita maxima]1.4e-9285.27Show/hide
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XP_023515836.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.2e-9284.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LU95 BHLH domain-containing protein5.3e-9084Show/hide
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A0A1S3BWL7 transcription factor bHLH356.3e-9184Show/hide
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A0A6J1C2W6 transcription factor bHLH35-like1.2e-113100Show/hide
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like1.8e-9385.71Show/hide
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A0A6J1JJ79 transcription factor bHLH35-like6.7e-9385.27Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JEB7 Transcription factor BHLH64.2e-3642.79Show/hide
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        +  A+KNIL ER+RRRKLNE+L+ALRSVVPNITKMDKASIIKDAI YIQ L  +E+++  E+  +ES    +          G G D+E       P   
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          + KK ++  S  S       AA+   P+E+ +L V+ +G+R +VVS+TC KR D+M ++C   E L+L++ITANIT+V+G L+ T+F+E +  +   +
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        K  +E+A+++L +   P S MS
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH352.1e-5960.45Show/hide
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        FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIEA++EE++ 
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        L++KIE+ I   + ++ QSP
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Q700E3 Transcription factor bHLH274.0e-4248.26Show/hide
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        DSW ++EA SG  +SSSP+G  +S A+SKN++SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+K+DKAS+IKD+I+Y+Q+L +QE+ ++AEI E+ES        + 
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         Y  +      Q+       + KK +Q  Y S   +  PIEVL++ VT+MGE+T+VV +TC K+ ++MV+LC+V ESL L I+T N ++ + RL  T+F+
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Query:  E
        +
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Q9LNJ5 Transcription factor bHLH133.3e-1227.93Show/hide
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        D+ G DE+ +              + A  ++ +ER RR KLN+R +ALRSVVPNI+KMDKAS++ DA++YI +LH + + ++AE   +           G
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        +    P+ L S                       D++V   GE  + V + C   +    ++   FE  K+++I +N+      +L T  +++E    + 
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         K K+ SA++R   +  QS  S
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Q9ZVX2 Transcription factor ABORTED MICROSPORES1.1e-1229.21Show/hide
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        +D+     Y   S +G     + +KN+++ER RR+KLN+RL+ALRS+VP ITK+D+ASI+ DAINY+++L  + + +Q E+    E E G  +   G   
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Query:  DQEL-----PLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEV-LDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQ
        +  +     P L  +    + +   D   S     E+   + V  +  R   V + C  +     +L E  +SL L++  AN T     +     +E   
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Query:  EE
         E
Subjt:  EE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.4e-4747.35Show/hide
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        DSW ++EA SG  +SSSP+G  +S A+SKN++SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNI+K+DKAS+IKD+I+Y+Q+L +QE+ ++AEI E+ES        + 
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Query:  GYGFD------QELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFI
         Y  +      Q+       + KK +Q  Y S   +  PIEVL++ VT+MGE+T+VV +TC K+ ++MV+LC+V ESL L I+T N ++ + RL  T+F+
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Query:  EAEQEERDYLKIKIESAIARLSLSDP
        +A++EE   ++ KI+ AIA  + +DP
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AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.0e-6160.63Show/hide
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        DSW L+EAISG YDSSSP+G  +SS ASKNI+SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI+ L  +E++++AEI E+ES    +++   
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Query:  GFDQELPLLLRSKRKKTEQFSYDSAASRTSPIEVLDLSVTYMGERTMVVSLTCCKRADSMVKLCEVFESLKLKIITANITAVSGRLLKTVFIEAEQEERD
         FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIEA++EE++
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         L++KIE+ I   + ++ QSP
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AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.3e-5563.54Show/hide
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        SW L+EAISG YDSSSP+G  +SS ASKNI+SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI+ L  +E++++AEI E+ES    +++    
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        FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIE
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AT5G57150.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.3e-5563.54Show/hide
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        FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIE
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein9.3e-5563.54Show/hide
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        SW L+EAISG YDSSSP+G  +SS ASKNI+SERNRR+KLN+RLFALRSVVPNITKMDKASIIKDAI+YI+ L  +E++++AEI E+ES    +++    
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        FD++L + + SK+ K      DS +S TS IEVL+L VT+MGERTMVVS+TC KR D+MVKLCEVFESL LKI+T+N+T+ SG +  TVFIE
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Sequences Show/hide sequences
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MSI