; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002372 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002372
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold30:4455897..4456181
RNA-Seq ExpressionMS002372
SyntenyMS002372
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB2618837.1 hypothetical protein D8674_014706 [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis]2.5e-1957.14Show/hide
Query:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
        ADGL   VY GCI+ SD  ++RRPYH+NCGCALH++  N++C+H   K   VSYP+RRAWSEG+LA++ASA +S  SSPSS   Q    VG
Subjt:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
KAE8653037.1 hypothetical protein Csa_019637 [Cucumis sativus]1.5e-2773.33Show/hide
Query:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESL
        MAD LL  VY+GCI + DAEIDRRPYHKNC CALHDR N+RCSH+ SKH SVSYPIRRAWSEG LA++A   ASGISSPSSP+ DQ+E +
Subjt:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESL
KAG6587850.1 hypothetical protein SDJN03_16415, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-2974.74Show/hide
Query:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVGSNRR
        MAD L  SVYHGCIA  DAEI RRPYHKNCGCALHDR NRRCSH+ SKH++VSYPIRRAWSEG LA MA+AS SGISSPSS        +GSNRR
Subjt:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVGSNRR
XP_008336929.1 uncharacterized protein LOC103400026 [Malus domestica]2.5e-1957.14Show/hide
Query:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
        ADGL   VY GCI+ SD  ++RRPYH+NCGCALH++  N++C+H   K   VSYP+RRAWSEG+LA++ASA +S  SSPSS   Q    VG
Subjt:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
XP_008443899.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487382 [Cucumis melo]2.4e-3075Show/hide
Query:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESLVGSNRR
        MAD  L  VYHGCIA  DA IDRRPYHKNC CALHDR NRRCSH+ SKH SVSYPIRRAWSEG LA++A+++ASG+SSPSSP+ DQVESL GS +R
Subjt:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESLVGSNRR
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LWK0 Uncharacterized protein6.5e-2975Show/hide
Query:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESLVGSNRR
        MAD LL  VY+GCI + DAEIDRRPYHKNC CALHDR N+RCSH+ SKH SVSYPIRRAWSEG LA++A   ASGISSPSSP+ DQVESL GS +R
Subjt:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESLVGSNRR
A0A1S3B9X6 uncharacterized protein LOC1034873821.2e-3075Show/hide
Query:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESLVGSNRR
        MAD  L  VYHGCIA  DA IDRRPYHKNC CALHDR NRRCSH+ SKH SVSYPIRRAWSEG LA++A+++ASG+SSPSSP+ DQVESL GS +R
Subjt:  MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPT-DQVESLVGSNRR
A0A498HUH9 Uncharacterized protein1.2e-1957.14Show/hide
Query:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
        ADGL   VY GCI+ SD  ++RRPYH+NCGCALH++  N++C+H   K   VSYP+RRAWSEG+LA++ASA +S  SSPSS   Q    VG
Subjt:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
A0A540M4V7 Uncharacterized protein1.2e-1957.14Show/hide
Query:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
        ADGL   VY GCI+ SD  ++RRPYH+NCGCALH++  N++C+H   K   VSYP+RRAWSEG+LA++ASA +S  SSPSS   Q    VG
Subjt:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
A0A5N5GUK0 Uncharacterized protein1.2e-1957.14Show/hide
Query:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
        ADGL   VY GCI+ SD  ++RRPYH+NCGCALH++  N++C+H   K   VSYP+RRAWSEG+LA++ASA +S  SSPSS   Q    VG
Subjt:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-NRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVG
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G46490.1 unknown protein8.1e-1645.74Show/hide
Query:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-------NRRCSHAFSKH---NSVSYPIRRAWSEGSLAIM----ASASASGISSPSS
        ADG+  S++ GCI+  D+ I+RRPYHKNCGCALHD+        N+R   +  +H    S+S+PIRR+WSEG++  M    +S+S+S + S SS
Subjt:  ADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRG-------NRRCSHAFSKH---NSVSYPIRRAWSEGSLAIM----ASASASGISSPSS
AT5G35110.1 unknown protein7.6e-1444.71Show/hide
Query:  DGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNS---VSYPIRRAWSEG---SLAIMASASASGISSPSS
        DG+  +++ GCI++ D+ I RRPYHKNCGCALH+R     S    +H     V +PI+R+WSEG   +L + +S+S+S + S SS
Subjt:  DGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNS---VSYPIRRAWSEG---SLAIMASASASGISSPSS

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGACGGCTTACTCACATCTGTCTACCACGGCTGCATCGCCGCCTCCGACGCCGAGATCGACCGCCGCCCCTACCACAAGAACTGCGGCTGCGCCCTCCACGACCG
GGGAAACAGACGCTGCTCACACGCCTTCTCCAAGCACAACTCTGTCTCGTATCCGATCAGACGGGCCTGGAGTGAAGGCAGCTTGGCCATTATGGCTTCTGCTTCTGCTT
CTGGCATTTCTTCGCCCTCTTCTCCCACGGATCAGGTGGAAAGCCTTGTCGGATCTAACAGGAGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGACGGCTTACTCACATCTGTCTACCACGGCTGCATCGCCGCCTCCGACGCCGAGATCGACCGCCGCCCCTACCACAAGAACTGCGGCTGCGCCCTCCACGACCG
GGGAAACAGACGCTGCTCACACGCCTTCTCCAAGCACAACTCTGTCTCGTATCCGATCAGACGGGCCTGGAGTGAAGGCAGCTTGGCCATTATGGCTTCTGCTTCTGCTT
CTGGCATTTCTTCGCCCTCTTCTCCCACGGATCAGGTGGAAAGCCTTGTCGGATCTAACAGGAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADGLLTSVYHGCIAASDAEIDRRPYHKNCGCALHDRGNRRCSHAFSKHNSVSYPIRRAWSEGSLAIMASASASGISSPSSPTDQVESLVGSNRR