; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002401 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002401
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionArmadillo-like helical
Genome locationscaffold30:4615635..4616834
RNA-Seq ExpressionMS002401
SyntenyMS002401
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050093.1 Armadillo-like helical [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-18085.04Show/hide
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KAG6587872.1 hypothetical protein SDJN03_16437, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-18787.72Show/hide
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KAG6589816.1 hypothetical protein SDJN03_15239, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.5e-18587.28Show/hide
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KAG7021757.1 hypothetical protein SDJN02_15484, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.1e-18887.97Show/hide
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XP_022134648.1 uncharacterized protein LOC111006872 [Momordica charantia]2.1e-216100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT75 Uncharacterized protein1.7e-17985.04Show/hide
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A0A5A7U2F9 Armadillo-like helical6.8e-18185.04Show/hide
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A0A5D3C7L4 Armadillo-like helical1.5e-18084.79Show/hide
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A0A6J1C2L5 uncharacterized protein LOC1110068721.0e-216100Show/hide
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A0A6P6FUS8 uncharacterized protein LOC1124901055.3e-14970.27Show/hide
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        MDD SKE+ PRVL+VLEALKQ SHELQAHP    DE +S AIKALLELE ESD ILS DPNLS LS HL +LK+LVET QK RG+  +RSF TRR +T+S
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        +S+VAGSIE+EIQAWIDRES+E L   L+EP  D E E+++LLTQFE+RL +GFNRELQDL+LKSKVFSLLES +C P+ SK IREHSA+AIGA++RFNK
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        DVFVGQVL GPT  AL+ MAS HS+KVLC LIR I+SPLV+ IESNG+IP+II+ LNCQD+Q+RV+AMDCI+EIGYFGRKEA+D ML+EGLI +LVELQR
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        SELGGDLI LGR     +  +E   V+A  VE  ++ RESRE++FLE HPFASCVARF VQLEVGEGLRQRE+RA K +I+ RV +A  SDAEAATI+AE
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Query:  VLWGSSP
        VLWG+SP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGATTCTTCGAAGGAGGATACCCCGCGAGTTCTCAGAGTCCTCGAAGCTCTCAAACAAGTTTCTCATGAGTTGCAGGCACATCCGAGTCCTGGCTCCGACGAGTT
CGATTCGCCCGCCATTAAAGCTCTGCTCGAGCTCGAGGTTGAATCCGACAAAATCCTTTCCAGTGATCCGAATCTCTCCACTCTTTCTCACCACCTCGCGAACCTCAAAT
CATTGGTGGAGACGCTTCAGAAGTCCAGGGGTTACGGCCTCAGGTCCTTCTTCACCCGCCGTTTCGCGACTAATTCGGTGTCTCAAGTCGCCGGTTCAATCGAGTCGGAG
ATTCAAGCCTGGATTGACCGCGAGAGCTTGGAGACTCTGGTTCGAGCTCTTAAAGAGCCCTCAATCGACGAGAACGAATCGATTAAGCTACTGACTCAGTTCGAAAATCG
ACTTGATCAAGGCTTCAACCGCGAGCTACAGGATCTCATGCTCAAATCCAAGGTGTTTTCGCTGCTCGAATCGATCGTTTGCAGCCCTAATTTCTCGAAAACGATCCGAG
AGCACTCAGCGTACGCGATTGGGGCTATGGTCCGTTTCAACAAAGACGTATTCGTCGGTCAAGTACTAACGGGACCCACGATTCACGCTCTAGTTCAAATGGCCTCCTCG
CACTCATTAAAAGTCCTCTGTTCCTTGATCAGATTGATTAGGTCTCCGCTGGTCGAGGAGATCGAGTCAAACGGCGACATACCAAAAATCATAAGCTTATTGAATTGCCA
AGACCTACAAATTAGGGTACTAGCGATGGATTGCATTGTTGAAATCGGTTATTTTGGGCGAAAAGAAGCGGTGGACACTATGCTGGACGAGGGTCTGATAGACAGGCTAG
TGGAGTTGCAGAGGTCGGAATTGGGCGGAGATTTGATCGGATTGGGAAGGCAGACGGCGGAGGAGGGCACAGGGGTGGCCGCCGGCGAGGTGGAGGGAAGGAGAGAAGGC
AGAGAAAGCAGAGAGAAGAAGTTTTTGGAGAGGCATCCATTTGCGAGCTGTGTAGCAAGATTTACAGTGCAATTGGAGGTAGGAGAGGGGCTGAGGCAGAGGGAAAAGAG
GGCCATTAAGCCTGAAATATTGAAGAGAGTTACAAAAGCTTGTGTTTCTGATGCTGAGGCTGCCACTATAATGGCTGAGGTTTTGTGGGGTTCTAGTCCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGATTCGCCCGCCATTAAAGCTCTGCTCGAGCTCGAGGTTGAATCCGACAAAATCCTTTCCAGTGATCCGAATCTCTCCACTCTTTCTCACCACCTCGCGAACCTCAAAT
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GGCCATTAAGCCTGAAATATTGAAGAGAGTTACAAAAGCTTGTGTTTCTGATGCTGAGGCTGCCACTATAATGGCTGAGGTTTTGTGGGGTTCTAGTCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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