; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002413 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002413
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionNuclear pore complex protein
Genome locationscaffold30:4716153..4716503
RNA-Seq ExpressionMS002413
SyntenyMS002413
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EOY31170.1 Uncharacterized protein TCM_047111, partial [Theobroma cacao]8.5e-1758.47Show/hide
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        LRLR+L LRVV RQTAAS+S SP  TGQHS   GSP  MCT+PP RST  PSFSVSIG V+   GG     G  FP      GGTVTGG+  GG + GG+
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         GG + GG  TGG  TGG
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KAB5514652.1 hypothetical protein DKX38_028558 [Salix brachista]1.6e-1562.2Show/hide
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        TG +TGGT  VTG  G  TGG  STGG
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KAF9662862.1 hypothetical protein SADUNF_Sadunf18G0098400 [Salix dunnii]5.5e-1648.73Show/hide
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Query:  -----------------VTGGKPTGGRSTGGLT------GGTVTGGKPTGGRSTGGLT
                          TGG   GG  TGG+T      GG+VTGG+ TGG+  GGLT
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RCV22206.1 hypothetical protein SETIT_4G202300v2 [Setaria italica]1.3e-1450.37Show/hide
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        VVQR TAAS+S SP+STGQH    GSP+P CT PP+RSTH PSFS S G V            GGHG   G       DG P  GGTVTGG         
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Query:  -------PTGGRSTGGLTGGTVTGGKPTGGRSTGG
                TGG +TGG+ GG VTGG+ TGG +TGG
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RXI05695.1 hypothetical protein DVH24_017737 [Malus domestica]4.8e-2061.98Show/hide
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        LRLR+LILRVVQR TAAS+S SP STGQHS   GSP P  T+PP RST  PSF+VS+GHV    GGHG P   GF     P TGG + GG   GGR TGG
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        L GG VTGG  TGG + GG+T
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061GMW5 Uncharacterized protein (Fragment)4.1e-1758.47Show/hide
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         GG + GG  TGG  TGG
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A0A2G9GKY8 Uncharacterized protein6.5e-1558.12Show/hide
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        RLRALILRVV +Q+AAS S SP S GQH L AGSP  M TSPP RSTH PSFSVSIG V    G    P    F   GG  TGG  TGG +TGG+   + 
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        GTV GGK   G  TGG+
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A0A498KIW7 Uncharacterized protein2.3e-2061.98Show/hide
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        LRLR+LILRVVQR TAAS+S SP STGQHS   GSP P  T+PP RST  PSF+VS+GHV    GGHG P   GF     P TGG + GG   GGR TGG
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        L GG VTGG  TGG + GG+T
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A0A5N5J6X5 Uncharacterized protein7.7e-1662.2Show/hide
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Query:  TGGLTGGT--VTG--GKPTGGR-STGG
        TG +TGGT  VTG  G  TGG  STGG
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A0A6N2N0E2 Uncharacterized protein3.7e-1856.94Show/hide
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         STGGTVTGG   TGG   GG +TGGT  TGG   GG  TGGLT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGATTAAGGTTAAGAGCCTTGATCTTAAGGGTAGTGCAAAGGCAGACCGCGGCTTCCACCTCAGCCAGCCCTGCAAGCACAGGGCAGCACTCGTTGGCCGCAGGGTCCCC
TAACCCAATGTGCACCAGCCCTCCCAACAGATCCACGCACCCTCCCAGTTTCAGCGTGTCAATTGGGCACGTCTCTTTCCCCTTCGGCGGGCACGGCTTTCCCGACGGCG
ATGGCTTTCCCAGCACTGGGGGCACCGTCACAGGCGGCAAGCCAACTGGCGGGAGGTCCACGGGCGGCTTGACGGGGGGCACCGTCACGGGTGGCAAGCCAACTGGCGGG
AGGTCCACGGGTGGCTTGACG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGATTAAGGTTAAGAGCCTTGATCTTAAGGGTAGTGCAAAGGCAGACCGCGGCTTCCACCTCAGCCAGCCCTGCAAGCACAGGGCAGCACTCGTTGGCCGCAGGGTCCCC
TAACCCAATGTGCACCAGCCCTCCCAACAGATCCACGCACCCTCCCAGTTTCAGCGTGTCAATTGGGCACGTCTCTTTCCCCTTCGGCGGGCACGGCTTTCCCGACGGCG
ATGGCTTTCCCAGCACTGGGGGCACCGTCACAGGCGGCAAGCCAACTGGCGGGAGGTCCACGGGCGGCTTGACGGGGGGCACCGTCACGGGTGGCAAGCCAACTGGCGGG
AGGTCCACGGGTGGCTTGACG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RSTGGLT