; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002721 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002721
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionWinged helix-turn-helix DNA-binding domain containing protein
Genome locationscaffold66:24947..25281
RNA-Seq ExpressionMS002721
SyntenyMS002721
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022142863.1 uncharacterized protein LOC111012874 [Momordica charantia]3.7e-24100Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

XP_022929341.1 uncharacterized protein LOC111435944 [Cucurbita moschata]5.8e-2291.53Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCA+GSA+GLYMVAQERQLQNR RMLAESL DVESGG+GENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

XP_022943152.1 uncharacterized protein LOC111447969 [Cucurbita moschata]5.8e-2291.53Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCA+GSAIGLYMV+QERQLQNR+RMLAESL DVESGG+GENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

XP_023540165.1 uncharacterized protein LOC111800616 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.8e-2293.22Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCA+GSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESL DVESGG GE+V
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

XP_038903238.1 uncharacterized protein LOC120089884 [Benincasa hispida]2.6e-2293.22Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCA+GSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESL D ESGG+GENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L386 Uncharacterized protein7.0e-2186.67Show/hide
Query:  DMGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        DMGGRGVIGDKWS RVLWVCA+GS IG+YMVAQERQLQNRQRML ESL DVESGG  ENV
Subjt:  DMGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

A0A6J1CPB9 uncharacterized protein LOC1110128741.8e-24100Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

A0A6J1EMV3 uncharacterized protein LOC1114359442.8e-2291.53Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCA+GSA+GLYMVAQERQLQNR RMLAESL DVESGG+GENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

A0A6J1FS83 uncharacterized protein LOC1114479692.8e-2291.53Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCA+GSAIGLYMV+QERQLQNR+RMLAESL DVESGG+GENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

A0A6J1J744 uncharacterized protein LOC1114831598.2e-2289.83Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MGGRGVIGDKWSMRVLWVCA+GSA+G YMVAQERQLQNR RMLAESL DVESGG+GENV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G15395.1 unknown protein1.1e-1872.88Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MG RG+I DKWSMR+LW CAIGSAIGLYMVA ERQ QNR R +AESL   ES G G+NV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

AT3G15395.2 unknown protein1.1e-1872.88Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MG RG+I DKWSMR+LW CAIGSAIGLYMVA ERQ QNR R +AESL   ES G G+NV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

AT3G15395.3 unknown protein1.1e-1872.88Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MG RG+I DKWSMR+LW CAIGSAIGLYMVA ERQ QNR R +AESL   ES G G+NV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV

AT3G15395.4 unknown protein1.1e-1872.88Show/hide
Query:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV
        MG RG+I DKWSMR+LW CAIGSAIGLYMVA ERQ QNR R +AESL   ES G G+NV
Subjt:  MGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GATATGGGAGGCAGAGGAGTTATTGGTGATAAATGGTCCATGAGGGTTCTCTGGGTCTGTGCCATAGGGAGTGCAATTGGTTTGTATATGGTTGCTCAAGAAAGACAATT
ACAGAACAGGCAAAGAATGTTGGCTGAGAGTCTGAATGATGTAGAATCAGGAGGTACTGGTGAAAATGTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GATATGGGAGGCAGAGGAGTTATTGGTGATAAATGGTCCATGAGGGTTCTCTGGGTCTGTGCCATAGGGAGTGCAATTGGTTTGTATATGGTTGCTCAAGAAAGACAATT
ACAGAACAGGCAAAGAATGTTGGCTGAGAGTCTGAATGATGTAGAATCAGGAGGTACTGGTGAAAATGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
DMGGRGVIGDKWSMRVLWVCAIGSAIGLYMVAQERQLQNRQRMLAESLNDVESGGTGENV