; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002859 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002859
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP62
Genome locationscaffold359:242645..260552
RNA-Seq ExpressionMS002859
SyntenyMS002859
Gene Ontology termsGO:0006405 - RNA export from nucleus (biological process)
GO:0006606 - protein import into nucleus (biological process)
GO:0044613 - nuclear pore central transport channel (cellular component)
GO:0005543 - phospholipid binding (molecular function)
GO:0017056 - structural constituent of nuclear pore (molecular function)
InterPro domainsIPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal
IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022142426.1 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X1 [Momordica charantia]8.2e-25190.76Show/hide
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XP_022142427.1 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X2 [Momordica charantia]5.3e-25898.94Show/hide
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XP_022156652.1 nuclear pore complex protein NUP62, partial [Momordica charantia]2.6e-23692.21Show/hide
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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-20482.96Show/hide
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XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]1.4e-20582.68Show/hide
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        NAAST  S+AP TTATKPTSLS S+SVAPLFSTVTTTS STP A+STTQ SFSVPAFS SSSAATT+S AASS PSA+SSGA SSFTGFGVT+ ASSSSA
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CM51 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X14.0e-25190.76Show/hide
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A0A6J1CMQ9 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X22.6e-25898.94Show/hide
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A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP621.2e-23692.21Show/hide
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        LPTKTLTA+SSSQ PASFGFPSL SA TAATT+SGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTS VSAAVS TTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQER GKFR
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Query:  KQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMT
        KQANAI +WDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLD+EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMT
Subjt:  KQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMT

Query:  EQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS
        EQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFW+S
Subjt:  EQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS

A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X12.0e-20282.26Show/hide
Query:  SASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTPGSALPGASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASL-----STNSLGSNPFGTSS----SG
        SA S+GSS    FGAAPSAG+S+   FG A SA T+ P S   G S+AA+ S +PLFGT++ + S GS++FGAS      S++  GSNPF +SS    S 
Subjt:  SASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTPGSALPGASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASL-----STNSLGSNPFGTSS----SG

Query:  LFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAAS
        LF SS+S AST+PFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA SSSGFSF TTSLSK TTS+TA+SSSS LTSASTSS SFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAST  S
Subjt:  LFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAAS

Query:  AAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPT
        +APGTTA KPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTP A+ST Q SFS+PAFSLSSSAATT+S AASS PS  SSGAASSFTGFGVT+TA+SSSAIVSLSLPT
Subjt:  AAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPT

Query:  KTLTASSSSQAPASFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQA
        K+LTA+SSSQAPASFGF SLA A TAATTTSG +A SQSQTSSTLV+ASSSSGTTS VS  VS  TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQER GKFRKQA
Subjt:  KTLTASSSSQAPASFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQA

Query:  NAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQI
        NAI +WDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLD+EAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQI
Subjt:  NAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQI

Query:  KSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS
        KSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AATQGPAADRELLGQKFW+S
Subjt:  KSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP622.9e-20181.87Show/hide
Query:  SASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGAS-------------SAPTTTPGSALPGASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGT
        +ASS+GSSS   FGAAPS G SAPSLFGG S             SAPT +PGS++ GASAAASGS S LFG+ S + SS   L  +S+ST          
Subjt:  SASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGAS-------------SAPTTTPGSALPGASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGT

Query:  SSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAS
          S LF SS+S AST+PFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAA SSSGFSF TTSLSK TTS+T +SSSS LTSASTSS SFSFGTPASSASQSSFGF+ISNAAS
Subjt:  SSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAAS

Query:  TAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSL
           S+APGTTA KPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTP A+ST Q SFS+PAFSLSSSAATT+S AASS PSA SSGAASSFTGFG+T+TA+SSSAIVSL
Subjt:  TAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSL

Query:  SLPTKTLTASSSSQAPASFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKF
        SLPTK+LTA+SSSQAPASFGF SLASA  AATTTSG +A SQSQTSSTLVVASSSSGTTS VSA VS  TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQER GKF
Subjt:  SLPTKTLTASSSSQAPASFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKF

Query:  RKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQM
        RKQANAI +WDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ ELE+KLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLD+EAASTRDAMYEQAEYIERELEQM
Subjt:  RKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQM

Query:  TEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS
        TEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AATQGPAADRELLGQKFW+S
Subjt:  TEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
G0SBQ3 Nucleoporin NSP19.2e-1128.97Show/hide
Query:  SASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTPGSALPGASAAASGSISP-----LFGTASSSGSSGS------------ALFGASLSTNSLGSN
        S + AG+ + SLFG + S+ +S PSLFG AS       G+     S +A+GS +P     LFG+ +++ S+G+            +LFG++ +T    S 
Subjt:  SASSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTPGSALPGASAAASGSISP-----LFGTASSSGSSGS------------ALFGASLSTNSLGSN

Query:  P-----FG---TSSSGLFASSTSLAS------TSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFS--FG
        P     FG   T+S  LF S+T+ A+      T+P +  F S  S   + + P  A+ ++G      +LSK  T+ T++ +    TSA+T   S +  FG
Subjt:  P-----FG---TSSSGLFASSTSLAS------TSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFS--FG

Query:  TPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT-SASTPTASST---TQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASS
           +  S +    + ++ A+T A++AP +T       +  TS AP  ST T+T +ASTP A+       ++ S P  S +++     ST  ++T +A SS
Subjt:  TPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTT-SASTPTASST---TQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASS

Query:  GAASSFTGF--GVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASFGFPSLASAP---TAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTP
         A S+  G     T  A++SS   + S P+   +  +S+ APAS G P+  +AP   +A  TT+       S T+ST      +  TT+ + A+      
Subjt:  GAASSFTGF--GVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASFGFPSLASAP---TAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTP

Query:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDER
        +LP  +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + +WDR +++N + + +L     +      E+ER+L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + 
Subjt:  KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDER

Query:  GLLLDNEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKIA
        G     +AA     R+  Y+ AE +  +L++M + +  +I+ +N      ++G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A
Subjt:  GLLLDNEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKIA

Query:  ATQG
         + G
Subjt:  ATQG

P17955 Nuclear pore glycoprotein p626.6e-0928.95Show/hide
Query:  GASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPF-----AASSSSGFS--FPTT
        G + A +G  +  FGTA ++ ++ +  F  S S    G   FGT S          A+T+P  + FS ++  + + +  F      AS  +GFS    T 
Subjt:  GASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPF-----AASSSSGFS--FPTT

Query:  SLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFS
         LS ++T+ T +++++      +S+L+ +  + AS++SQ +        +ST ++ + GTT    TS S S   A  F+  +  S + PTA S   S F+
Subjt:  SLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFS

Query:  VPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTL------TASSSSQAPASFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQS
            + +++ AT     A++TP+AA++ A S+         ASSS+ ++SLS P  T       T   S +AP +    S  S  T  TTT+  ++ S S
Subjt:  VPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTL------TASSSSQAPASFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQS

Query:  QTSSTLVVA---------SSSSGTTSPVSA-AVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVE
         T++   ++         SS + T  P S+ AV TTT      +T   +E +I +W+ EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L  EV KV  
Subjt:  QTSSTLVVA---------SSSSGTTSPVSA-AVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVE

Query:  TQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVR
         Q  L+++L+ I + Q+E++  L  +EE      K++ G +    A   R+  Y+ AE I+ +L++M + +K II+ LN   GG  D  D   PL  + +
Subjt:  TQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVR

Query:  ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
        ILN  + SL W+D+ +     R+++
Subjt:  ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK

P37198 Nuclear pore glycoprotein p621.3e-0928.04Show/hide
Query:  GASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATT
        G + A +G  +  FGTA ++ ++ +   G S ST+  G   FG                +PFQ + S+ S+   S ++   A+ ++GF+F T +L+   T
Subjt:  GASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATT

Query:  SVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSF---STSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQ-SSFSV--
          +    +S L  ++T++      TPA  A+ S FG   SN  +  +S    +  T PT   F   +TSVAP     TT+   + T  ST Q S F++  
Subjt:  SVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSF---STSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQ-SSFSV--

Query:  ---------PAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTG---FGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASFGF--PSLASAPTAATTTSG
                 PA    + A    +TA ++ P+A +  A  + TG   F    TA +SSA   LSL T   TA + +     F    P  AS  +  T+T+ 
Subjt:  ---------PAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTG---FGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASFGF--PSLASAPTAATTTSG

Query:  FSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTS---PVSAAVSTTTPKLP---------SEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRL
         +  + + +SST   A +         P + A + T P  P         S +T   +E +I +W+ EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L
Subjt:  FSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTS---PVSAAVSTTTPKLP---------SEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRL

Query:  EIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDG
          EV KV   Q  L+++L+ I + Q+E++  L  +EE    + K++ G +    A   R+  Y+ AE I+ +L++M + +K II+ LN + G   D  D 
Subjt:  EIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDG

Query:  MTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI
          PL  + +ILN  + SL WID+ +     +++++
Subjt:  MTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI

Q63850 Nuclear pore glycoprotein p627.3e-0828.6Show/hide
Query:  GASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPF-----AASSSSGFSF----P
        G + A +G  +  FGTA ++ ++ +  F  S S    G   FGT S          A+T+P  + FS ++    + +  F      AS  +GFS     P
Subjt:  GASAAASGSISPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASSTSLASTSPFQNSFSSSSSQNLSSSSPF-----AASSSSGFSF----P

Query:  TTSLSK-ATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQS
          SLS  A T  TA++ S  L S++ ++   S  T     + + F F     +ST ++ + G+T    TS S S   A  FS  +  S++ PTA S    
Subjt:  TTSLSK-ATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQS

Query:  SFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASFGFPSLASAP--------TAATTTSGFS
        S   PA  ++++A  T   AA+ T +  S+G+    T F     A +SS+   LSLP    TA++ S     F   +  +AP        T  TTT+  +
Subjt:  SFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSAIVSLSLPTKTLTASSSSQAPASFGFPSLASAP--------TAATTTSGFS

Query:  APSQSQTSST--------LVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAK
        A + + T++T        LV A  SS   + + A+ +         +T   +E +I +W+ EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L  EV K
Subjt:  APSQSQTSST--------LVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAK

Query:  VVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDA
        V   Q  L+++L+ I + Q+E++  L  +EE      K++ G +    A   R+  Y+ AE I+ +L++M + +K II+ LN   GG  D  D   PL  
Subjt:  VVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDA

Query:  VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
        + +ILN  + SL W+D+ +     R+++
Subjt:  VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP624.6e-10354.47Show/hide
Query:  SSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTP----GSALPGASAAASGSI--SPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASS
        SSA +S+ SLFGA+ SA  S   LFG  SSA   TP     S+ PG+S++  G+   SP F  ASS+  S  ++FGA+ S+   GS+    S+  LFASS
Subjt:  SSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTP----GSALPGASAAASGSI--SPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASS

Query:  TSLAST---SPF-QNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASA
        +S A+T   SPF  ++F+SSS+ N S++S    S+S+GFSF  ++ S  T+S T    S+P  +AS+SS SFSFGT A+S      GF++    ST +SA
Subjt:  TSLAST---SPF-QNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASA

Query:  APGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSAIVSLSL
        AP +          STS A +FS  TTT+ S+ T ++T+  + S PA +++  +    S+A ++TP  ASS A  S TGFG+   T    S+++    ++
Subjt:  APGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSAIVSLSL

Query:  PTKTLTASSSSQ----APA-SFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERA
        P KT T +SSSQ    +PA SF  PS  S    AT        S + T+ T +V  SSSGT++ V+      +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQER 
Subjt:  PTKTLTASSSSQ----APA-SFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERA

Query:  GKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIEREL
        G+FRKQANAI +WD+RILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LER+LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLD+EAASTRDAMYEQ+E +EREL
Subjt:  GKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIEREL

Query:  EQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS
        E MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI A QG   DREL+  K W+S
Subjt:  EQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore3.3e-10454.47Show/hide
Query:  SSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTP----GSALPGASAAASGSI--SPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASS
        SSA +S+ SLFGA+ SA  S   LFG  SSA   TP     S+ PG+S++  G+   SP F  ASS+  S  ++FGA+ S+   GS+    S+  LFASS
Subjt:  SSAGSSSFSLFGAAPSAGASAPSLFGGASSAPTTTP----GSALPGASAAASGSI--SPLFGTASSSGSSGSALFGASLSTNSLGSNPFGTSSSGLFASS

Query:  TSLAST---SPF-QNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASA
        +S A+T   SPF  ++F+SSS+ N S++S    S+S+GFSF  ++ S  T+S T    S+P  +AS+SS SFSFGT A+S      GF++    ST +SA
Subjt:  TSLAST---SPF-QNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKATTSVTASSSSSPLTSASTSSLSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTAASA

Query:  APGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSAIVSLSL
        AP +          STS A +FS  TTT+ S+ T ++T+  + S PA +++  +    S+A ++TP  ASS A  S TGFG+   T    S+++    ++
Subjt:  APGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPTASSTTQSSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSAIVSLSL

Query:  PTKTLTASSSSQ----APA-SFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERA
        P KT T +SSSQ    +PA SF  PS  S    AT        S + T+ T +V  SSSGT++ V+      +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQER 
Subjt:  PTKTLTASSSSQ----APA-SFGFPSLASAPTAATTTSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERA

Query:  GKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIEREL
        G+FRKQANAI +WD+RILQNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LER+LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLD+EAASTRDAMYEQ+E +EREL
Subjt:  GKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIEREL

Query:  EQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS
        E MTEQI+SIIQ++NANQGGEL+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI A QG   DREL+  K W+S
Subjt:  EQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWVS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCAAGTTCTTCCCAAAATTTAAGTTCGTCTTCACCATTTGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGATTTTCGTTTCCGACCACTTCTTTGTCCAAAGCTACTACTAGTGTCACTGC
ATCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCGTTGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCCTCAGCGTCTCAATCTTCCTTTGGGTTTAGTATTAGCA
ATGCAGCATCAACGGCGGCGTCTGCTGCTCCAGGGACTACTGCTACGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCGACTTCTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACTACTACC
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TGACTGCTTCTTCATCATCGCAAGCACCAGCCTCTTTTGGTTTCCCTTCTTTGGCTTCTGCTCCCACTGCTGCTACCACTACGTCTGGTTTTAGTGCTCCAAGTCAGAGT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TCAAGTTCTTCCCAAAATTTAAGTTCGTCTTCACCATTTGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGATTTTCGTTTCCGACCACTTCTTTGTCCAAAGCTACTACTAGTGTCACTGC
ATCTTCTTCTTCTTCTCCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCGTTGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCCTCAGCGTCTCAATCTTCCTTTGGGTTTAGTATTAGCA
ATGCAGCATCAACGGCGGCGTCTGCTGCTCCAGGGACTACTGCTACGAAGCCTACTTCTCTATCGTTTTCGACTTCTGTGGCACCTTTATTCTCTACGGTTACTACTACC
AGTGCTTCAACTCCAACTGCTAGTAGCACAACTCAGTCATCATTCTCTGTGCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCTGCTACTACGATATCCACAGCAGCATCCTCCAC
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CAGACTTCATCAACTCTTGTTGTCGCATCCAGTAGTAGTGGTACAACTTCACCAGTTAGCGCTGCAGTGTCTACTACTACACCAAAACTACCATCTGAGATAACAGGGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QTSSTLVVASSSSGTTSPVSAAVSTTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERAGKFRKQANAITDWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVD
KALLSVEEDAERIYKDERGLLLDNEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQ
GPAADRELLGQKFWVS