; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS002984 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS002984
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionPollen Ole e 1 allergen and extensin family protein
Genome locationscaffold595_1:758526..759748
RNA-Seq ExpressionMS002984
SyntenyMS002984
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039837.1 extensin [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-17182.35Show/hide
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XP_004140544.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Cucumis sativus]3.5e-17381.61Show/hide
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                            PPLPPLPPLPP P+FP PTCPNPPSLPFPFPPLPPL PSPPSP  PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP P  P
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XP_008459888.1 PREDICTED: extensin [Cucumis melo]3.3e-17182.35Show/hide
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                      PPLPPLPPLPP P+FPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPL PSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP P  PPPFSLS
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.3e-16978.02Show/hide
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        P        PLPPLPPLPP PYFPLP+CPNPPSLPFPFPPLPP  PSP SPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP                       
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         PPSPP G Q+QKP
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XP_038906532.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 5 [Benincasa hispida]2.1e-17384.02Show/hide
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        DP ISLLLL  LTS F+ +FGLT     SVTRITVVGAVYCDTCLSN+ SK SYFLPGVDVHLQCKFRA+APKMAEQM+FSVNRTTDKYG YRLEIPSVD
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                   PPLPPLPPLPP  YFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSP SPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP P  PPPFSLSDPR
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        TWIPH+P FSPPPPP FD RDPRTWIPHIPPFSP PPPAFDPRDPRTWIP+IPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPH+PPSPP  PQ+QKP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein1.7e-17381.61Show/hide
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                            PPLPPLPPLPP P+FP PTCPNPPSLPFPFPPLPPL PSPPSP  PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP P  P
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A0A1S3CB81 extensin1.6e-17182.35Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin1.6e-17182.35Show/hide
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                      PPLPPLPPLPP P+FPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPL PSPPSPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP P  PPPFSLS
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        DPRTWIPH+P FSPPPPP FD RDPRTWIP+IPPFSP PPPAF+PRDPR+WIP IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH+PPSPP GPQ+QKP
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A0A6J1GPH0 formin-2-like2.2e-16877.54Show/hide
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        FLMDP ISLLL   L S F+ +FGLT ET  SV RI+VVGAVYCDTCLSN+ SK SYFLPGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMSFSVNRTTDKYG YRLEIP
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Query:  P--------PLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISP-----------------------
        P        PLPPLPPLPP PYFPLP+CPNPPSLPFPFPPLPP  PSP SPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP                       
Subjt:  P--------PLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISP-----------------------

Query:  ------LSPPPPSPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPH
              +SPPPP P PPPPFSLSDPRTWIPHVP FSPPPPP FD RDPRTWIPHIPPF+ PPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPH
Subjt:  ------LSPPPPSPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPH

Query:  IPPSPPHGPQDQKP
         PPSPP G Q+QKP
Subjt:  IPPSPPHGPQDQKP

A0A6J1JLM5 extensin-like1.4e-16477.43Show/hide
Query:  FLMDPAISLLLLLSLTSVFSEVFGLTPETSVSVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIP
        FLMDP ISLLL   L S F+ +FGLT ET  SVTRI+VVGAVYCDTCLSN+ SK SYFLPGVDVHLQCKFRA+APKMAEQMSFSVNRTTDKYG YRLEIP
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Query:  SVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNKKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPF
        SVDG NCVDGMTMQSFCQA+LIG+S EVCNVPGL T +EEIS+KSKQDNLCIFSLNALSYRPLKK+ SLCG++K+++PDPLTSSKFFLPFFPPY+FPFPF
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Query:  P--------PLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP----SPYPPPPFSLSDP
        P        PLPPLPPLPP PY P P+CP PPSLPFPFPPLPP  PS  SPP PS PPPPPPFSLSDPRTWIPY+SP SPPPP    SP PPPPFSLSDP
Subjt:  P--------PLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP----SPYPPPPFSLSDP

Query:  RTWIPHVPSFSP-----------------------PPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIP
        RTWIPHVP FSP                       PPPP FD RDPRTWIPHIPPF+ PPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFF PPPPAFDLRDPRTWIPH P
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Query:  PSPPHGPQDQKP
        PSPP G Q+QKP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FPQ6 Vegetative cell wall protein gp11.5e-0442.57Show/hide
Query:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLP-PLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP
        SP P + S    P  P  + P P PPLPP  P PP P  P+P  P+PP  P P PP P P  PSPP PP+P+PP P PP   S         SP  P PP
Subjt:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLP-PLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPP

Query:  SPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIPPSPPHGPQDQ
        SP PP P S + P    P  PS SPP PP             +PP   PP PA  P  P+   P  PP  PPPPP        T +P  PPSPP  P   
Subjt:  SPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIPPSPPHGPQDQ

Query:  KP
         P
Subjt:  KP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 32.5e-0441.01Show/hide
Query:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y
        +P  LTS     P  P Y+ P P PP PP+  PP PP P  P P    PP  P P PP P   P PPSPP P PP   PPPPP     P  + P     Y
Subjt:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y

Query:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF
         SP  PPPPSP P P +      P    P  P FSPPPP P+    P       PP SPPPP        P   P  P T +   PP      PPPPP  
Subjt:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF

Query:  DLRDPRTWIPHIPPSPP
        +   P   I + PP PP
Subjt:  DLRDPRTWIPHIPPSPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein9.0e-3442.86Show/hide
Query:  LLLLLSLTSVFSEVFGLTPETSVSVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCV
        LL  L + S+ S+     P+       IT++G VYCD C  N+FSK SYF+ GV+V + C+F+A +    E ++FS NRTT+++G Y++ I S+D   C 
Subjt:  LLLLLSLTSVFSEVFGLTPETSVSVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCV

Query:  DGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNK
        D  ++ S CQASLIG    S   CN+PG  TT +++  KS+Q N C++  NAL++RP K+D +LCG K
Subjt:  DGMTMQSFCQASLIGS---SSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNK

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.8e-0541.01Show/hide
Query:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y
        +P  LTS     P  P Y+ P P PP PP+  PP PP P  P P    PP  P P PP P   P PPSPP P PP   PPPPP     P  + P     Y
Subjt:  SPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPL--PPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPP---PPPPPFSLSDPRTWIP-----Y

Query:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF
         SP  PPPPSP P P +      P    P  P FSPPPP P+    P       PP SPPPP        P   P  P T +   PP      PPPPP  
Subjt:  ISPLSPPPPSPYPPPPFSL--SDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPP--------PAFDPRDPRTWIPHIPP----FFPPPPPAF

Query:  DLRDPRTWIPHIPPSPP
        +   P   I + PP PP
Subjt:  DLRDPRTWIPHIPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.3e-5348.29Show/hide
Query:  TPETSVS-VTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS
        +PE S+   +RITVVG VYCDTC  NTFS+QSYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE+++ SVNRTT++ G Y+LEIP VDGI+CVDG+ + S C A ++ +
Subjt:  TPETSVS-VTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGS

Query:  SSE---VCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGN-------KKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPY
        SS+    C++P   T   E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  K+TSLCGN       K ++       SKFF P+  PY FP+P+P LPPLP LPPFP 
Subjt:  SSE---VCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGN-------KKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPY

Query:  FPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPPSP
        FP       PSLPF  P L                   P F   +P TWIPY+    P   +P
Subjt:  FPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPPSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.5e-3645.24Show/hide
Query:  ISLLLLLSLTSVFSEVFGLTPETSVSVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGIN
        I LLLLL L S+ S    L   ++    +ITV+G VYCD C +N+FS  SYF+PGV+V + C+F + + +  E ++FS NRTT++ G Y+L+I S++G+ 
Subjt:  ISLLLLLSLTSVFSEVFGLTPETSVSVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGIN

Query:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCG
        C       ++ + CQASLIG S + CNVPG  TT E++  KSK  NLC++   AL++RPL+K+  LCG
Subjt:  CVDGM---TMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGTTTTCTTATGGATCCAGCAATCTCTCTCCTTCTCCTACTTTCTCTAACATCTGTCTTCTCTGAAGTCTTTGGCCTAACACCCGAAACCTCAGTTTCGGTCACTCGAAT
CACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGATACATGTTTAAGCAACACTTTCTCCAAACAGAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTGCAGTGCAAATTCAGAGCAA
TTGCTCCAAAAATGGCAGAGCAGATGAGCTTCTCAGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGCGTATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATTAATTGTGTTGAT
GGTATGACAATGCAGTCGTTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGGAGCTCATCTGAGGTCTGCAATGTCCCAGGCTTGACGACTACAGCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTAAGTTACAGGCCATTGAAGAAGGATACAAGTCTATGTGGGAATAAGAAACAGGAATCTCCAGATCCCTTGACCT
CCTCAAAGTTCTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATGCCTTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCTTTTCCATATTTTCCTCTCCCTACT
TGTCCAAACCCACCATCTCTACCATTTCCTTTTCCACCTTTACCTCCTCTACTTCCTTCACCTCCAAGCCCGCCCGCACCCTCTCCTCCGCCTCCACCGCCTCCATTTAG
TCTCAGTGATCCTAGAACCTGGATACCCTATATTTCTCCACTTTCGCCTCCCCCACCTTCGCCATATCCCCCACCTCCATTTAGTCTCAGCGATCCAAGGACCTGGATAC
CCCATGTTCCTTCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTCCTTTCGATCTCCGGGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTT
GATCCTAGAGATCCAAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCCTTTTTCCCTCCCCCACCTCCAGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATCCCCCC
ATCCCCTCCGCATGGCCCTCAAGACCAGAAGCCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGTTTTCTTATGGATCCAGCAATCTCTCTCCTTCTCCTACTTTCTCTAACATCTGTCTTCTCTGAAGTCTTTGGCCTAACACCCGAAACCTCAGTTTCGGTCACTCGAAT
CACGGTAGTGGGTGCAGTTTATTGTGATACATGTTTAAGCAACACTTTCTCCAAACAGAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTGCAGTGCAAATTCAGAGCAA
TTGCTCCAAAAATGGCAGAGCAGATGAGCTTCTCAGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGCGTATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATTAATTGTGTTGAT
GGTATGACAATGCAGTCGTTTTGCCAGGCAAGCTTAATAGGGAGCTCATCTGAGGTCTGCAATGTCCCAGGCTTGACGACTACAGCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAA
GCAAGATAATCTCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTAAGTTACAGGCCATTGAAGAAGGATACAAGTCTATGTGGGAATAAGAAACAGGAATCTCCAGATCCCTTGACCT
CCTCAAAGTTCTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATGCCTTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCTTTTCCATATTTTCCTCTCCCTACT
TGTCCAAACCCACCATCTCTACCATTTCCTTTTCCACCTTTACCTCCTCTACTTCCTTCACCTCCAAGCCCGCCCGCACCCTCTCCTCCGCCTCCACCGCCTCCATTTAG
TCTCAGTGATCCTAGAACCTGGATACCCTATATTTCTCCACTTTCGCCTCCCCCACCTTCGCCATATCCCCCACCTCCATTTAGTCTCAGCGATCCAAGGACCTGGATAC
CCCATGTTCCTTCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTCCTTTCGATCTCCGGGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTT
GATCCTAGAGATCCAAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCCTTTTTCCCTCCCCCACCTCCAGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCCATATCCCCCC
ATCCCCTCCGCATGGCCCTCAAGACCAGAAGCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SFLMDPAISLLLLLSLTSVFSEVFGLTPETSVSVTRITVVGAVYCDTCLSNTFSKQSYFLPGVDVHLQCKFRAIAPKMAEQMSFSVNRTTDKYGAYRLEIPSVDGINCVD
GMTMQSFCQASLIGSSSEVCNVPGLTTTAEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKDTSLCGNKKQESPDPLTSSKFFLPFFPPYAFPFPFPPLPPLPPLPPFPYFPLPT
CPNPPSLPFPFPPLPPLLPSPPSPPAPSPPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPLSPPPPSPYPPPPFSLSDPRTWIPHVPSFSPPPPPPFDLRDPRTWIPHIPPFSPPPPPAF
DPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHIPPSPPHGPQDQKP