; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003036 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003036
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description40S ribosomal protein S15a
Genome locationscaffold234:100626..101222
RNA-Seq ExpressionMS003036
SyntenyMS003036
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KJB83794.1 hypothetical protein B456_013G265000 [Gossypium raimondii]3.4e-6799.23Show/hide
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KZV45533.1 hypothetical protein F511_37087, partial [Dorcoceras hygrometricum]3.4e-6799.23Show/hide
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MBA0574627.1 hypothetical protein [Gossypium lobatum]3.4e-6799.23Show/hide
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MBA0576079.1 hypothetical protein [Gossypium lobatum]3.4e-6799.23Show/hide
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XP_022134546.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Momordica charantia]1.5e-67100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1U8NNK5 40S ribosomal protein S15a-11.6e-6799.23Show/hide
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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-17.4e-68100Show/hide
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A0A6J1FJB0 40S ribosomal protein S15a-17.4e-68100Show/hide
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A0A6J1I5M1 40S ribosomal protein S15a-1-like1.6e-6798.46Show/hide
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A0A6J1JX40 40S ribosomal protein S15a-17.4e-68100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80646 40S ribosomal protein S15a-32.1e-6490.77Show/hide
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P42798 40S ribosomal protein S15a-19.9e-7097.69Show/hide
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Q00332 40S ribosomal protein S15a2.9e-6996.92Show/hide
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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a2.4e-6896.15Show/hide
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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-41.3e-6997.69Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07770.1 ribosomal protein S15A7.1e-7197.69Show/hide
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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A7.1e-7197.69Show/hide
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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein1.5e-6590.77Show/hide
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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D9.2e-7197.69Show/hide
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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein7.1e-7197.69Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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