; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003125 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003125
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionsirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic
Genome locationscaffold234:573301..574784
RNA-Seq ExpressionMS003125
SyntenyMS003125
Gene Ontology termsGO:0006979 - response to oxidative stress (biological process)
GO:0019354 - siroheme biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051266 - sirohydrochlorin ferrochelatase activity (molecular function)
GO:0051536 - iron-sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002762 - Sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037556.1 sirohydrochlorin ferrochelatase [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-9290.27Show/hide
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KAG7033101.1 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.2e-9189.73Show/hide
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XP_008458790.1 PREDICTED: sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic [Cucumis melo]4.4e-9290.27Show/hide
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XP_022134499.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic [Momordica charantia]8.8e-10197.85Show/hide
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XP_038890885.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]2.7e-9492.43Show/hide
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        Y ICASQKSP+ I R SRFRNF SRFRMSVDNG +NRSG RIGAGDAVIIVDHGSRR+ESNLMLNEFVAMFRDKTGYPIVEPAHMELAEPSIRDSFA CV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KP17 Uncharacterized protein1.3e-8986.49Show/hide
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        + ICASQ+S +P+GR S+FRNF SRFRMS+DNG +N    RIGAGDAVIIVDHGSRR+ESNLMLNEFVAMF+DKTGYPIVEPAHMELAEPSI+DSF  CV
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A0A1S3C8S9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic2.1e-9290.27Show/hide
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A0A5D3BY55 Sirohydrochlorin ferrochelatase2.1e-9290.27Show/hide
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A0A6J1BYW9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic4.3e-10197.85Show/hide
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A0A6J1K384 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like2.2e-8988.24Show/hide
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        Y ICASQKS   + IGRSS  RNF+SRFRMSVDNGG+N    RIGAGDAVIIVDHGSRR+ESNLMLNEFVAMFRDKTGYPIVEPAHMELAEPSIRDSFAS
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        CVEQGAKRI+VSPFFLFPGRHWQQDIPSLTAEAAKDHPGISYI+TAPLGLHE+LVDVVNDRI+HCLSHAAGV +ECEVCAGTGKC+F
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6UWT5 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.4e-1128.99Show/hide
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        +A++++ HGSR   S  ++ +     ++K  Y IVE   ME  EP+I  +    + +GAK+II+ P FL  G H ++DIP +    E  + H        
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                       G+  I   P+G  +++VD+V DR
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P61817 Sirohydrochlorin ferrochelatase4.1e-1635.34Show/hide
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        DAV+ V HGSR +E       F+   +     PI E   +ELA P+I   F +C+EQGA RI + P  L    H + DIP    +  + +P +  +   P
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         G+ E++VD++ +RIN
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P61819 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.1e-1329.08Show/hide
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        +A+++V HGSR   S  ++ E     + +  Y IVE   ME  EP+I  +    ++ GAK++IV+P FL PG H ++DIP +        E    H    
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Query:  ---------------PGISYIVTAPLGLHEKLVDVVNDRIN
                        G+  +   P+G  ++++D+V DR N
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Q58380 Sirohydrochlorin cobaltochelatase4.2e-1331.16Show/hide
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        +A+++V HGSR   S  +L +     +++  +PIVE   ME +EP+I  +    +EQGAKRIIV P FL  G H  +DIP L      +H          
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Query:  --------------PGISYIVTAPLGLHEKLVDVVNDR
                        +  I   P+G  +++VD++ DR
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Q84JH7 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic5.8e-6375.17Show/hide
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        +TAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G ADEC VCAGT KC+ Y
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50170.1 sirohydrochlorin ferrochelatase B4.1e-6475.17Show/hide
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        IG  D +IIVDHGSRR+ESNLML EFV MF++KTGYPIVEPAHMELAEPSI+D+F+ CV+QGAKR++VSPFFLFPGRHW  DIPSLTA+AAK+  GISY+
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        +TAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G ADEC VCAGT KC+ Y
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TACAAAATCTGCGCATCTCAGAAATCTCCTGTTCCGATCGGACGTTCCTCTAGATTCAGGAATTTCGCCTCGCGGTTCCGCATGAGTGTTGATAATGGAGGCGCTAATCG
GAGCGGATCTCGGATTGGTGCTGGAGATGCCGTCATCATCGTCGACCATGGCTCTCGCCGCCAGGAATCTAACCTCATGCTGAATGAGTTTGTTGCTATGTTTAGGGATA
AAACTGGTTACCCTATAGTGGAGCCTGCCCACATGGAGCTGGCCGAACCGTCGATAAGAGACTCATTTGCATCGTGTGTTGAACAGGGGGCGAAACGTATCATTGTAAGC
CCATTCTTCCTCTTTCCTGGCCGACATTGGCAACAGGACATTCCTTCCTTAACAGCTGAAGCAGCAAAGGATCACCCAGGAATATCATATATAGTAACAGCTCCTCTTGG
TCTTCATGAAAAACTTGTGGATGTTGTGAATGATAGAATAAATCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGATGAATGTGAAGTTTGTGCTGGAACAGGCAAATGCA
GATTTTAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TACAAAATCTGCGCATCTCAGAAATCTCCTGTTCCGATCGGACGTTCCTCTAGATTCAGGAATTTCGCCTCGCGGTTCCGCATGAGTGTTGATAATGGAGGCGCTAATCG
GAGCGGATCTCGGATTGGTGCTGGAGATGCCGTCATCATCGTCGACCATGGCTCTCGCCGCCAGGAATCTAACCTCATGCTGAATGAGTTTGTTGCTATGTTTAGGGATA
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GATTTTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
YKICASQKSPVPIGRSSRFRNFASRFRMSVDNGGANRSGSRIGAGDAVIIVDHGSRRQESNLMLNEFVAMFRDKTGYPIVEPAHMELAEPSIRDSFASCVEQGAKRIIVS
PFFLFPGRHWQQDIPSLTAEAAKDHPGISYIVTAPLGLHEKLVDVVNDRINHCLSHAAGVADECEVCAGTGKCRFY