CuGenDBv2

Gene ID	MS003290
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
Genome location	scaffold234:1810000..1810122
RNA-Seq Expression	MS003290
Synteny	MS003290
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022900 - electron transport chain (biological process) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0031966 - mitochondrial membrane (cellular component) GO:0070469 - respirasome (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domains	IPR000440 - NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 IPR038430 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

AUD37866.1 NADH dehydrogenase subunit 3 [Ophiorrhiza mungos]

3.4e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

KAF8738511.1 hypothetical protein HU200_013979 [Digitaria exilis]

3.4e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

QKO27648.1 NADH dehydrogenase subunit 3, partial [Stemona tuberosa]

3.4e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

YP_004237278.1 NADH dehydrogenase subunit 3 [Ricinus communis]

3.4e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

YP_009706781.1 NADH dehydrogenase subunit 3 [Ilex pubescens]

3.4e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A7M1VEF0 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

1.6e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

A0A7T3PES7 NADH dehydrogenase subunit 3

1.6e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

P93334 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

1.6e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

Q2F984 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

1.6e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

Q37035 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

1.6e-13

97.56

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P27062 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

9.9e-16

95.12

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLIPLGVPFPFASNSSTYP+KLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

P60159 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

4.6e-13

90.24

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLI LGVPF FASNSSTYPEKLSAYE GFDP GDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

P68160 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

4.6e-13

90.24

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLI LGVPF FASNSSTYPEKLSAYE GFDP GDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

P92533 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

4.6e-13

90.24

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLI LGVPF FASNSSTYPEKLSAYE GFDP GDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

Q36664 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

3.5e-13

87.8

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        V LIPLGVPF FASN STYPEKLSAYE GFDP GDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G07751.1 NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 protein

4.6e-16

95.12

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLI LGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

ATMG00990.1 NADH dehydrogenase 3

4.6e-16

95.12

Show/hide

Query:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD
        VSLI LGVPFPFASNSSTYPEKLSAYE GFDPSGDARSRFD
Subjt:  VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

GTTTCTTTGATCCCACTCGGTGTTCCTTTTCCATTTGCTTCCAATAGTTCAACCTATCCAGAAAAATTGTCGGCCTATGAATGGGGTTTCGATCCTTCCGGTGATGCCAG
AAGTCGTTTTGAT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GTTTCTTTGATCCCACTCGGTGTTCCTTTTCCATTTGCTTCCAATAGTTCAACCTATCCAGAAAAATTGTCGGCCTATGAATGGGGTTTCGATCCTTCCGGTGATGCCAG
AAGTCGTTTTGAT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

VSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYEWGFDPSGDARSRFD

MS003290 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome