; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003363 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003363
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationscaffold234:2363603..2364271
RNA-Seq ExpressionMS003363
SyntenyMS003363
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]1.9e-7374.03Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]7.0e-11399.1Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]2.2e-7475.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein4.8e-7573.93Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein2.2e-7574.47Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein2.2e-7574.47Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein3.4e-11399.1Show/hide
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A0A6J1K022 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like2.0e-6073.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein9.4e-0737.72Show/hide
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        SS   +S  S       RRRS+           F+ G   + G SNS  S+ C+  AS  +   R C
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AT2G40475.1 unknown protein2.2e-1642.41Show/hide
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        S    SSS  SSSS P     + R+  S + S   E      D +E   S+SPTSTLC+    SS         + S+K A  S++ HGS+
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AT3G56260.2 unknown protein1.7e-1146.01Show/hide
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        YYGGAS  IPF WESRPGTPK H  S++S+P PLTPPPSYYSS       + SK  SK +   S       RRS +     S  + SSSF SWSS+ SSS
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Query:  --SSSPKLNFFKRRRSISDTPSLPFEYSFDDGDGDEPGSSNSPTSTLCFG-----GASSSRAS
          SSSP  +  KR      +P L   Y  D+         +SPTSTLC       G SSS  S
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AT5G01790.1 unknown protein3.7e-1141.41Show/hide
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        L +K Q+   F+   P   +  +  SAA  SFR+ YY GA+GA+PF WES PGTPKH  SE  ++PPLTPPPS++S S    +  SK +   +L+ I  R
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Query:  L----------APRRSRNSPSSFSSASL
        L          A + S +SP S S   L
Subjt:  L----------APRRSRNSPSSFSSASL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAACTGCAAACTACGACCAAATCTCTCAAAAACCTCTCCAAATCAAACACCAAAATGATAGATTCTTCACAAGGCCGGCGCCGGTTCTGTCCAAAGAAGCAAACTC
CGCCGCCAACTCGTCTTTTCGGGTCTACTATGGCGGTGCCTCCGGTGCAATTCCGTTCAGATGGGAGTCCCGACCGGGCACTCCAAAGCACAGCTATTCAGAAACTTCAA
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AGATCCCGAAACTCCCCGTCCTCGTTCTCCTCCGCCTCTCTGTCGTCCTCGTTCTCGTCGTGGTCGTCCTCTCGCTCGTCGTCCTCCTCCTCGCCCAAACTGAACTTCTT
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ACTGTTAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ACTGTTAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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RSRNSPSSFSSASLSSSFSSWSSSRSSSSSSPKLNFFKRRRSISDTPSLPFEYSFDDGDGDEPGSSNSPTSTLCFGGASSSRASFRGCYQLVSVKNAFLSMVGHGSAGRG
TVN