; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003435 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003435
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionras-related protein Rab2BV-like
Genome locationscaffold234:2827250..2828319
RNA-Seq ExpressionMS003435
SyntenyMS003435
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022134462.1 ras-related protein Rab2BV-like [Momordica charantia]7.3e-115100Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VANLSGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_022938534.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita moschata]1.2e-11499.54Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_022962630.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita moschata]4.7e-11498.61Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKR+CCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_022993834.1 ras-related protein Rab2BV-like [Cucurbita maxima]2.1e-11499.07Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

XP_038884346.1 ras-related protein Rab2BV-like [Benincasa hispida]3.6e-11499.07Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQ+LAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA+TPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VANLSGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C222 ras-related protein Rab2BV-like3.5e-115100Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VANLSGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1FEC9 ras-related protein Rab2BV-like6.0e-11599.54Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1HFM9 ras-related protein Rab2BV-like2.3e-11498.61Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKR+CCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1JTM8 ras-related protein Rab2BV-like2.3e-11498.61Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKR+CCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

A0A6J1K193 ras-related protein Rab2BV-like1.0e-11499.07Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPG+PHGTTIN
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VAN+SGNYNKRSCCSN
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39434 Ras-related protein Rab2BV1.4e-10089.35Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA +VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST-PGLPHGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DL HLRAVS ED Q LAEKEGLSFLETSALEA+N+EKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEA+S  PG   GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST-PGLPHGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        NVA+ S N  +RSCCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

Q40193 Ras-related protein Rab11C3.1e-10087.04Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLRAVS +D   L+EKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL +IYHI+SKKALAAQEA +   +P  GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        NVA+ SGN  K+ CCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

Q40523 Ras-related protein Rab11A4.9e-9886.11Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA +VDHEYDYLFK+VLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL YDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI
        DNVQRWLRELRDH DSNIVI++AGNK+DL HLRAVS +D Q L +KEGLSFLETSALEALNV+KAFQTIL DIYHIISKKALAAQEAA++  LP  GTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLP-HGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        NV++ S N  KR CCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

Q96283 Ras-related protein RABA2c4.6e-9685Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        M ++VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED Q LAEKEGLSFLETSALEA NVEKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN
        TTINV + SG   KR+CCS+
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN

Q9FIF9 Ras-related protein RABA2d2.1e-9684.93Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLR+V+ ED Q LAE EGLSFLETSALEA NVEKAFQT+L +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCS
        TTINV + SG   KR CCS
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B4.3e-9784.72Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA ++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI
        +NV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED + LAEKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA + PG   GT I
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAA-STPGLPHGTTI

Query:  NVANLSGNYNKRSCCS
        N+++ S   N++ CCS
Subjt:  NVANLSGNYNKRSCCS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C1.1e-8975.46Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA + D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLRAV+ EDAQ  AEKEGLSF+ETSALEALNVEKAFQTIL ++Y IISKK++++ +  +   +  G TI+
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTIN

Query:  VANLSGNYNKRSCCSN
        VA  S +  K+ CCS+
Subjt:  VANLSGNYNKRSCCSN

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C3.3e-9785Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        M ++VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNK+DLNHLR+V+ ED Q LAEKEGLSFLETSALEA NVEKAFQTIL +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN
        TTINV + SG   KR+CCS+
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCSN

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D1.5e-9784.93Show/hide
Query:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
        MA++V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF
Subjt:  MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG
        DNV RWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLR+V+ ED Q LAE EGLSFLETSALEA NVEKAFQT+L +IYHIISKKALAAQEAA+     PG   G
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAAST----PGLPHG

Query:  TTINVANLSGNYNKRSCCS
        TTINV + SG   KR CCS
Subjt:  TTINVANLSGNYNKRSCCS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F1.2e-7868.2Show/hide
Query:  AYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFD
        AY+ D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEF LESKSTIGVEFATR++ V+ K VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+T+  TF+
Subjt:  AYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFD

Query:  NVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINV
        NV+RWL+ELRDH D+NIVIM  GNKADL HLRAVS EDA+  AE+E   F+ETSALE++NVE AF  +L  IY ++S+KAL   +      LP G TINV
Subjt:  NVQRWLRELRDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINV

Query:  ANLS--GNYNKRSCCSN
         +        K  CCSN
Subjt:  ANLS--GNYNKRSCCSN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTACAAGGTGGATCACGAATACGATTATCTCTTCAAGATTGTGTTGATCGGTGATTCTGGCGTCGGAAAGTCAAATATTCTCTCCAGGTTTACGCGGAACGAGTT
CTGTTTGGAGTCCAAGTCCACAATTGGAGTTGAATTTGCAACGCGGACTTTGCAGGTAGAGGGGAAGACAGTGAAGGCCCAAATATGGGACACAGCTGGTCAAGAGAGAT
ACCGAGCCATTACCAGTGCCTATTACAGGGGAGCAGTGGGCGCTCTTTTGGTGTATGATATTACCAAGAGACAAACCTTTGACAATGTGCAAAGATGGCTACGCGAGCTG
AGAGACCACGCTGACTCCAACATTGTGATCATGATGGCCGGAAACAAGGCCGATCTGAACCACCTCCGGGCAGTGTCCGCCGAAGATGCTCAGGTTTTGGCCGAGAAAGA
AGGGCTGTCATTTCTCGAGACCTCAGCCTTGGAGGCCTTAAATGTTGAGAAGGCATTTCAGACCATTTTGCTCGACATTTACCACATCATTAGTAAGAAAGCTTTGGCCG
CTCAGGAGGCGGCTTCCACCCCCGGCCTCCCCCACGGCACCACCATTAACGTTGCTAATCTCTCCGGCAACTACAACAAGAGAAGTTGTTGCTCTAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTACAAGGTGGATCACGAATACGATTATCTCTTCAAGATTGTGTTGATCGGTGATTCTGGCGTCGGAAAGTCAAATATTCTCTCCAGGTTTACGCGGAACGAGTT
CTGTTTGGAGTCCAAGTCCACAATTGGAGTTGAATTTGCAACGCGGACTTTGCAGGTAGAGGGGAAGACAGTGAAGGCCCAAATATGGGACACAGCTGGTCAAGAGAGAT
ACCGAGCCATTACCAGTGCCTATTACAGGGGAGCAGTGGGCGCTCTTTTGGTGTATGATATTACCAAGAGACAAACCTTTGACAATGTGCAAAGATGGCTACGCGAGCTG
AGAGACCACGCTGACTCCAACATTGTGATCATGATGGCCGGAAACAAGGCCGATCTGAACCACCTCCGGGCAGTGTCCGCCGAAGATGCTCAGGTTTTGGCCGAGAAAGA
AGGGCTGTCATTTCTCGAGACCTCAGCCTTGGAGGCCTTAAATGTTGAGAAGGCATTTCAGACCATTTTGCTCGACATTTACCACATCATTAGTAAGAAAGCTTTGGCCG
CTCAGGAGGCGGCTTCCACCCCCGGCCTCCCCCACGGCACCACCATTAACGTTGCTAATCTCTCCGGCAACTACAACAAGAGAAGTTGTTGCTCTAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDITKRQTFDNVQRWLREL
RDHADSNIVIMMAGNKADLNHLRAVSAEDAQVLAEKEGLSFLETSALEALNVEKAFQTILLDIYHIISKKALAAQEAASTPGLPHGTTINVANLSGNYNKRSCCSN