; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003449 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003449
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationscaffold234:2892514..2894262
RNA-Seq ExpressionMS003449
SyntenyMS003449
Gene Ontology termsGO:0009543 - chloroplast thylakoid lumen (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133545.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]8.8e-93100Show/hide
Query:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG
        VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG
Subjt:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG

Query:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
Subjt:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

XP_022133546.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]2.9e-8897.28Show/hide
Query:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG
        VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT 
Subjt:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG

Query:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
            DADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
Subjt:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

XP_022955559.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita moschata]5.0e-8892.97Show/hide
Query:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
        +V+K Q+EA+RN +LSVGESASKA+FLAL+SASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDL+GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
Subjt:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT

Query:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS I GADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATR+TLLCN
Subjt:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

XP_022991097.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita maxima]3.8e-8892.97Show/hide
Query:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
        +V+K Q+EA+RN +LSVGESASKA+FLAL+SASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDL+GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
Subjt:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT

Query:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS I GADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATR+TLLCN
Subjt:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

XP_023552471.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.0e-8892.97Show/hide
Query:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
        +V+K Q+EA+RN +LSVGESASKA+FLAL+SASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDL+GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
Subjt:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT

Query:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS I GADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATR+TLLCN
Subjt:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BVE7 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X21.4e-8897.28Show/hide
Query:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG
        VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT 
Subjt:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG

Query:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
            DADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
Subjt:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X14.3e-93100Show/hide
Query:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG
        VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG
Subjt:  VLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTG

Query:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
Subjt:  ADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

A0A6J1GWM1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X22.4e-8892.97Show/hide
Query:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
        +V+K Q+EA+RN +LSVGESASKA+FLAL+SASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDL+GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
Subjt:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT

Query:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS I GADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATR+TLLCN
Subjt:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X21.9e-8892.97Show/hide
Query:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
        +V+K Q+EA+RN +LSVGESASKA+FLAL+SASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDL+GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
Subjt:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT

Query:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS I GADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATR+TLLCN
Subjt:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

A0A6J1JPS6 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X15.4e-8892.43Show/hide
Query:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
        + +K Q+EA+RN +LSVGESASKA+FLAL+SASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDL+GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT
Subjt:  KVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLT

Query:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS I GADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATR+TLLCN
Subjt:  GADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr328.5e-1442.86Show/hide
Query:  LSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLRED
        L G+DFSGK+L    F  + L  +NF  A L GA F  + L GADL  ADL      L +   A+L+NA L  A+    T F  + I GADF+   L   
Subjt:  LSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLRED

Query:  QREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC
        + + LC  ADGVNP TG +TR++L C
Subjt:  QREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC

O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic2.4e-7784Show/hide
Query:  RNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLR
        R+++ S+GE  SK +  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSGKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLR
Subjt:  RNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLR

Query:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR YLCKVADGVN TTGNATRDTLLCN
Subjt:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

Q8H1Q1 Thylakoid lumenal protein TL20.3, chloroplastic2.8e-0930.96Show/hide
Query:  QLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGV------TRGQ------------DLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGA
        +++ S N       SA   T+  +LSA+  +A   +A   G P  A +      TRG+            DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+
Subjt:  QLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGV------TRGQ------------DLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGA

Query:  KLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC
           GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+ IEGADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR +L C
Subjt:  KLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC

Q8Z4G9 Secreted effector protein PipB25.0e-0635.51Show/hide
Query:  LFLADPALAFKGGGPYGAGVTR----GQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANL-----
        +  A   +  KG    GA +T       DLSG D  G  L   D        ANFKGA L GAS  D++LT A L D+ + GA    AN+T ANL     
Subjt:  LFLADPALAFKGGGPYGAGVTR----GQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANL-----

Query:  ----------SNANLEGALATGNTSFR----GSTIEGA
                  S AN++ A  +G+T  R    G+T++GA
Subjt:  ----------SNANLEGALATGNTSFR----GSTIEGA

Q9SE95 FH protein interacting protein FIP21.2e-0737.84Show/hide
Query:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTIEGADF
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ ++ A  
Subjt:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTIEGADF

Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
Subjt:  TDVPLREDQRE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.1 Pentapeptide repeat-containing protein2.0e-1030.96Show/hide
Query:  QLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGV------TRGQ------------DLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGA
        +++ S N       SA   T+  +LSA+  +A   +A   G P  A +      TRG+            DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+
Subjt:  QLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGV------TRGQ------------DLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGA

Query:  KLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC
           GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+ IEGADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR +L C
Subjt:  KLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC

AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein3.4e-1032.93Show/hide
Query:  ASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVT
        AS +   A+   + F AD    F  G     G     DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + 
Subjt:  ASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVT

Query:  KANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC
        +ANL+NA L  ++ T  +   G+ IEGADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR +L C
Subjt:  KANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLC

AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.9e-5781.88Show/hide
Query:  RNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLR
        R+++ S+GE  SK +  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSGKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLR
Subjt:  RNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLR

Query:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGA
        GADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA
Subjt:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGA

AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.7e-7884Show/hide
Query:  RNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLR
        R+++ S+GE  SK +  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDLSGKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLR
Subjt:  RNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLR

Query:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN
        GADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR YLCKVADGVN TTGNATRDTLLCN
Subjt:  GADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN

AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein8.4e-0937.84Show/hide
Query:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTIEGADF
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ ++ A  
Subjt:  RGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTIEGADF

Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
Subjt:  TDVPLREDQRE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATTAAGGTTCTAAAGCAGCAATTGGAAGCCTCGCGGAATTTGATACTTTCAGTCGGAGAATCCGCCTCTAAAGCCACCTTCCTCGCTTTGCTTTCCGCCTCTTTGTTCCT
CGCGGATCCTGCGCTTGCTTTCAAGGGCGGAGGTCCTTACGGTGCCGGGGTCACTAGAGGTCAGGATCTCTCCGGGAAAGATTTCAGTGGGAAGACGTTAATCAAGCAAG
ATTTCAAAACGTCTATATTACGGCAAGCTAATTTTAAAGGTGCGAAGTTATTAGGTGCCAGCTTCTTCGATGCTGATTTAACAGGGGCGGATCTATCAGATGCTGATCTC
AGAGGTGCTGACTTTTCCCTGGCCAATGTTACAAAGGCTAATTTAAGCAATGCCAACCTAGAAGGTGCACTCGCCACGGGAAATACTTCGTTTCGTGGATCAACAATAGA
AGGAGCTGACTTCACAGACGTGCCTCTGAGAGAGGATCAGCGAGAATACCTTTGCAAAGTCGCAGATGGGGTGAACCCAACAACTGGAAATGCAACCCGGGATACGTTGC
TCTGCAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTAAGGTTCTAAAGCAGCAATTGGAAGCCTCGCGGAATTTGATACTTTCAGTCGGAGAATCCGCCTCTAAAGCCACCTTCCTCGCTTTGCTTTCCGCCTCTTTGTTCCT
CGCGGATCCTGCGCTTGCTTTCAAGGGCGGAGGTCCTTACGGTGCCGGGGTCACTAGAGGTCAGGATCTCTCCGGGAAAGATTTCAGTGGGAAGACGTTAATCAAGCAAG
ATTTCAAAACGTCTATATTACGGCAAGCTAATTTTAAAGGTGCGAAGTTATTAGGTGCCAGCTTCTTCGATGCTGATTTAACAGGGGCGGATCTATCAGATGCTGATCTC
AGAGGTGCTGACTTTTCCCTGGCCAATGTTACAAAGGCTAATTTAAGCAATGCCAACCTAGAAGGTGCACTCGCCACGGGAAATACTTCGTTTCGTGGATCAACAATAGA
AGGAGCTGACTTCACAGACGTGCCTCTGAGAGAGGATCAGCGAGAATACCTTTGCAAAGTCGCAGATGGGGTGAACCCAACAACTGGAAATGCAACCCGGGATACGTTGC
TCTGCAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
IKVLKQQLEASRNLILSVGESASKATFLALLSASLFLADPALAFKGGGPYGAGVTRGQDLSGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADL
RGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTIEGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRDTLLCN