; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003727 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003727
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionWD repeat-containing protein 11-like
Genome locationscaffold127:30580..33455
RNA-Seq ExpressionMS003727
SyntenyMS003727
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR015943 - WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
IPR039694 - WD repeat-containing protein 11


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587891.1 WD repeat-containing protein 11, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.1e-11491.32Show/hide
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XP_022144884.1 WD repeat-containing protein 11-like, partial [Momordica charantia]9.7e-12499.17Show/hide
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XP_022931575.1 WD repeat-containing protein 11-like [Cucurbita moschata]4.8e-11591.74Show/hide
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XP_023004047.1 WD repeat-containing protein 11-like [Cucurbita maxima]4.8e-11591.74Show/hide
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XP_023530451.1 WD repeat-containing protein 11-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.8e-11591.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U9D7 WD repeat-containing protein 11 isoform X12.4e-11290.5Show/hide
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A0A6J1CTK0 WD repeat-containing protein 11-like4.7e-12499.17Show/hide
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A0A6J1EZS8 WD repeat-containing protein 11-like2.3e-11591.74Show/hide
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A0A6J1JAR1 WD repeat-containing protein 11-like1.1e-11291.32Show/hide
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A0A6J1KPB4 WD repeat-containing protein 11-like2.3e-11591.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F1QEB7 WD repeat-containing protein 111.6e-1227.19Show/hide
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         +G +    V G  ++D
Subjt:  VNGALGVFEVHGRRIRD

Q8K1X1 WD repeat-containing protein 111.0e-1125.81Show/hide
Query:  PLVALGTQSGTIDVIDVSANSVASSFSVHNSVVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVNEKTGGFVNRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGRYLL
        PL+A+GT +G++ V  +++  +    SVH+  V+G+ W   +  +SF+ S  N   G   N L +  L +G +  FR  +  + +PI  ++ S   +YL 
Subjt:  PLVALGTQSGTIDVIDVSANSVASSFSVHNSVVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVNEKTGGFVNRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGRYLL

Query:  ILFRDAPVEVWAMTKTPIMLRSLALPF---TVLEWTLPTVPRPIKDRTAITQD-------------GASSPTTASLSDSKAPNSEVNQD-ETSESFAFAL
        ++F+D P+E+W + +T  +LR ++  F   T LEW+     + ++ +   T++             GA   +  SL       +E++Q+    E F F  
Subjt:  ILFRDAPVEVWAMTKTPIMLRSLALPF---TVLEWTLPTVPRPIKDRTAITQD-------------GASSPTTASLSDSKAPNSEVNQD-ETSESFAFAL

Query:  VNGALGVFEVHGRRIRD
         +G +    V G  ++D
Subjt:  VNGALGVFEVHGRRIRD

Q9BZH6 WD repeat-containing protein 112.3e-1125.35Show/hide
Query:  PLVALGTQSGTIDVIDVSANSVASSFSVHNSVVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVNEKTGGFVNRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGRYLL
        PL+A+GT +G++ V  +++  +    S+H+  V+G+ W   +  +SF+ S  N   G   N L +  L +G +  FR  +  + + I  ++ S   +YL 
Subjt:  PLVALGTQSGTIDVIDVSANSVASSFSVHNSVVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVNEKTGGFVNRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGRYLL

Query:  ILFRDAPVEVWAMTKTPIMLRSLALPF---TVLEWTLPTVPRPIKDRTAITQDGASSPTTA-------------SLSDSKAPNSEVNQD-ETSESFAFAL
        ++FRD P+E+W + +T  +LR ++  F   T LEW+     + ++ +   T++  +  T               SL       SE++Q+    E F F  
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Query:  VNGALGVFEVHGRRIRD
        ++G +    V G  ++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G26610.1 Transducin family protein / WD-40 repeat family protein2.7e-9270.92Show/hide
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        +I+LVGQLQLLSSAVT+LA+P+PS+ ATLARGGN PAV VPLVALGT++GTIDV+DVSAN+VA+SFS H S +RGL WLGNSRLVS+S S+V+++TGG+V
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Query:  NRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGRYLLILFRDAPVEVWAMTKTPIMLRSLALPFTVLEWTLPTVP----RPIKDRTAITQDGASSPT
        N+LVVTCLRSG ++ FRVLQKPERAPIRALRASSSGRYLLILFRDAPVEVWAMTK+P+MLRSLALPFTVLEWTLPT+P    + +  + +++ +   + T
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Query:  -----TASLSDSKAPNSEVNQDETSESFAFALVNGALGVFEVHGRRIRDFR
             T + SDSKA  ++  QD+ SESFAFALVNG+LGVFEV+GRRIRDFR
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AT3G33530.1 Transducin family protein / WD-40 repeat family protein3.2e-9375.2Show/hide
Query:  MQISLVGQLQLLSSAVTMLAVPSPSLIATLARGGNHPAVAVPLVALGTQSGTIDVIDVSANSVASSFSVHNSVVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVNEKTGGF
        MQISL GQLQLLSS V+ LAVPSPSL ATLARGGN PA AVPLVALGTQSGTIDV+DVS N+VA+S SVH  VVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVN+K+ G+
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Query:  VNRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGRYLLILFRDAPVEVWAMTKTPIMLRSLALPFTVLEWTLPTVPRPIKDRTAITQDGASSPTTAS
        +NRLVVTCLRSG NK FR LQKPER PIRALR SSSGRYLLILFRDAPVEVWAMTK P+MLRSLALPFTV+EWTLP VPRP +   +     AS   TAS
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Query:  LSD-------SKAPNSEVNQDETSESFAFALVNGALGVFEVHGRRIRDFR
                  S +  S+ +Q+ET ESFAFALVNGALGVFEV GRRIRDFR
Subjt:  LSD-------SKAPNSEVNQDETSESFAFALVNGALGVFEVHGRRIRDFR

AT3G33530.2 Transducin family protein / WD-40 repeat family protein3.3e-9070.94Show/hide
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        MQISL GQLQLLSS V+ LAVPSPSL ATLARGGN PA AVPLVALGTQSGTIDV+DVS N+VA+S SVH  VVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVN+K+ G+
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Query:  VNRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGR---------------YLLILFRDAPVEVWAMTKTPIMLRSLALPFTVLEWTLPTVPRPIKDR
        +NRLVVTCLRSG NK FR LQKPER PIRALR SSSGR               YLLILFRDAPVEVWAMTK P+MLRSLALPFTV+EWTLP VPRP +  
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Query:  TAITQDGASSPTTASLSD-------SKAPNSEVNQDETSESFAFALVNGALGVFEVHGRRIRDFR
         +     AS   TAS          S +  S+ +Q+ET ESFAFALVNGALGVFEV GRRIRDFR
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AT3G33530.3 Transducin family protein / WD-40 repeat family protein3.6e-9273.26Show/hide
Query:  MQISLVGQLQLLSSAVTMLAVPSPSLIATLARGGNHPAVAVPLVALGTQSGTIDVIDVSANSVASSFSVHNSVVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVNEKTGGF
        MQISL GQLQLLSS V+ LAVPSPSL ATLARGGN PA AVPLVALGTQSGTIDV+DVS N+VA+S SVH  VVRGLRWLGNSRLVSFSYSQVN+K+ G+
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Query:  VNRLVVTCLRSGYNKTFRVLQKPERAPIRALRASSSGR---------------YLLILFRDAPVEVWAMTKTPIMLRSLALPFTVLEWTLPTVPRPIKDR
        +NRLVVTCLRSG NK FR LQKPER PIRALR SSSGR               YLLILFRDAPVEVWAMTK P+MLRSLALPFTV+EWTLP VPRP +  
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Query:  TAITQDGASSPTTASLSDSKAPNSEVNQDETSESFAFALVNGALGVFEVHGRRIRDFR
         +     AS   TAS  DS +  S+ +Q+ET ESFAFALVNGALGVFEV GRRIRDFR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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