; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003920 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003920
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionGATA transcription factor 21-like
Genome locationscaffold127:1562021..1563343
RNA-Seq ExpressionMS003920
SyntenyMS003920
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004135818.1 putative GATA transcription factor 22 [Cucumis sativus]1.8e-5558.58Show/hide
Query:  GGRIVGCNSDDGV--------ETGLRFTIWKQIDK----------SGSSIDDDLALKWDSSSSN--IRMVINSNPTET--PAPINGGRNFQDLNPS---L
        GG I+GCN+D  +        ETGLRFTIWKQIDK          +  S  +D ++KW SSSS+  I+ +INSN TET     I  GRN QDLN S    
Subjt:  GGRIVGCNSDDGV--------ETGLRFTIWKQIDK----------SGSSIDDDLALKWDSSSSN--IRMVINSNPTET--PAPINGGRNFQDLNPS---L

Query:  SFDQTNKR-RTLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKI-I
        SF+QTNKR  T  + D  ++ RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA AA  AAAANG          AVV+K NK  VQHKI  
Subjt:  SFDQTNKR-RTLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKI-I

Query:  KPAATLKRKCKD----VAAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        KPA TLKRK KD    V   + GGGRKKL FE+           SSYQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  KPAATLKRKCKD----VAAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

XP_022147681.1 GATA transcription factor 21-like [Momordica charantia]2.8e-125100Show/hide
Query:  GGRIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSD
        GGRIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSD
Subjt:  GGRIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSD

Query:  CNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAAGRGGGGRKKLHF
        CNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAAGRGGGGRKKLHF
Subjt:  CNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAAGRGGGGRKKLHF

Query:  EDSSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYGWPSS
        EDSSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYGWPSS
Subjt:  EDSSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYGWPSS

XP_022967871.1 GATA transcription factor 21-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.0e-5056.37Show/hide
Query:  GRIVGCNSD------DGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRR
        G  +GC +D        VETGL FTIWK    S     +D ++KW SSSS+    IR+VIN N TET A  I+  RNFQDLNP          DQTNKR 
Subjt:  GRIVGCNSD------DGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRR

Query:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCK
         LN D   ++ RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA        A AAN     GG P  AVVLK NK      IIKPAAT+KRK K
Subjt:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCK

Query:  DVAA------GRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        +V A        GGGGR+KL  ED           S+YQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  DVAA------GRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

XP_023530322.1 GATA transcription factor 21-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-5057.72Show/hide
Query:  SDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP----SLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCS
        S+  VETGL FTIWK    S     +D ++KW SSSS+    IR+VIN N TETP   I+  RNFQDLNP        DQTNKR TLN D   ++ RTCS
Subjt:  SDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP----SLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCS

Query:  DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDV--------AAGRG
        DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR    A AE A   N T         AVVLK NK      IIKPAAT+KRK K+V        A+  G
Subjt:  DCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDV--------AAGRG

Query:  GGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        GGGR+KL  ED           S+YQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  GGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

XP_038878562.1 GATA transcription factor 21 [Benincasa hispida]1.0e-5860.53Show/hide
Query:  RIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSS----------IDDDLALKWDSSSSN--IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLN-----PS-LSFDQTNKR
        +I+G N +D VETGLRFTIWKQIDK  SS            +DL +KW SSSS+  I+ +INSN TET    I+ GRNFQDLN     PS  SFDQTNKR
Subjt:  RIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSS----------IDDDLALKWDSSSSN--IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLN-----PS-LSFDQTNKR

Query:  RTLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAA------
         +  + D  ++ RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA AA  AAAANG  P      AAVVLK NK AVQHKI+  +A      
Subjt:  RTLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAA------

Query:  TLKRKCKDV------AAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        TLKRKCKD         G  GGGRK L FE+           SSYQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  TLKRKCKDV------AAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZE4 GATA-type domain-containing protein8.8e-5658.58Show/hide
Query:  GGRIVGCNSDDGV--------ETGLRFTIWKQIDK----------SGSSIDDDLALKWDSSSSN--IRMVINSNPTET--PAPINGGRNFQDLNPS---L
        GG I+GCN+D  +        ETGLRFTIWKQIDK          +  S  +D ++KW SSSS+  I+ +INSN TET     I  GRN QDLN S    
Subjt:  GGRIVGCNSDDGV--------ETGLRFTIWKQIDK----------SGSSIDDDLALKWDSSSSN--IRMVINSNPTET--PAPINGGRNFQDLNPS---L

Query:  SFDQTNKR-RTLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKI-I
        SF+QTNKR  T  + D  ++ RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR AMA AA  AAAANG          AVV+K NK  VQHKI  
Subjt:  SFDQTNKR-RTLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKI-I

Query:  KPAATLKRKCKD----VAAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        KPA TLKRK KD    V   + GGGRKKL FE+           SSYQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  KPAATLKRKCKD----VAAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

A0A6J1D336 GATA transcription factor 21-like1.4e-125100Show/hide
Query:  GGRIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSD
        GGRIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSD
Subjt:  GGRIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSD

Query:  CNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAAGRGGGGRKKLHF
        CNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAAGRGGGGRKKLHF
Subjt:  CNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAAGRGGGGRKKLHF

Query:  EDSSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYGWPSS
        EDSSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYGWPSS
Subjt:  EDSSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYGWPSS

A0A6J1ELP1 GATA transcription factor 21-like1.1e-5056.35Show/hide
Query:  SDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRT
        S+  VETGL FTIWK    S     +D ++KW SSSS+    IR+VIN N TETP   I+  RNFQDLNP          DQTNKR TLN D   ++ RT
Subjt:  SDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRT

Query:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDV-----------
        CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARR    A AE A   N T         AVVLK NK      IIKPAAT+KRK K+V           
Subjt:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDV-----------

Query:  -AAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
         A+  GGGGR+KL  ED           S+YQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  -AAGRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

A0A6J1HT96 GATA transcription factor 21-like isoform X15.0e-5156.37Show/hide
Query:  GRIVGCNSD------DGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRR
        G  +GC +D        VETGL FTIWK    S     +D ++KW SSSS+    IR+VIN N TET A  I+  RNFQDLNP          DQTNKR 
Subjt:  GRIVGCNSD------DGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRR

Query:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCK
         LN D   ++ RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA        A AAN     GG P  AVVLK NK      IIKPAAT+KRK K
Subjt:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCK

Query:  DVAA------GRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        +V A        GGGGR+KL  ED           S+YQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  DVAA------GRGGGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

A0A6J1HXZ7 GATA transcription factor 21-like isoform X22.5e-5058.13Show/hide
Query:  SDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRT
        S+  VETGL FTIWK    S     +D ++KW SSSS+    IR+VIN N TET A  I+  RNFQDLNP          DQTNKR  LN D   ++ RT
Subjt:  SDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSN----IRMVINSNPTETPA-PINGGRNFQDLNP------SLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRT

Query:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAA------GRG
        CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRA        A AAN     GG P  AVVLK NK      IIKPAAT+KRK K+V A        G
Subjt:  CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAA------GRG

Query:  GGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        GGGR+KL  ED           S+YQRVFP DEREAAILLMTLSYG
Subjt:  GGGRKKLHFED-----------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5HZ36 GATA transcription factor 212.7e-2540.18Show/hide
Query:  NSNPTETPAPINGGRNF-QDLNPSLSFDQT-----------NKRRTLN---VDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA
        N++      P+N   NF +D +  L+F              N+  T+N     +NN V R CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA
Subjt:  NSNPTETPAPINGGRNF-QDLNPSLSFDQT-----------NKRRTLN---VDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA

Query:  AAA----EEAAAA-------------------NGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATL---KRKCKDVAAGRGGGGRKKLHFED--------
        AAA    +E A A                   NG   Y   P      K  K   + +    A T+       K   +        K  F+D        
Subjt:  AAA----EEAAAA-------------------NGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATL---KRKCKDVAAGRGGGGRKKLHFED--------

Query:  SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        S+YQ+VFP DE+EAA+LLM LSYG
Subjt:  SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

Q6YW48 Protein CYTOKININ-RESPONSIVE GATA TRANSCRIPTION FACTOR 16.6e-1656.7Show/hide
Query:  VTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAAN----GTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDV
        V R CSDCNTTKTPLWRSGP GPKSLCNACGIRQRKARRA  AAA   AA A        P   KPAA    K  K A     +  +   K++CK V
Subjt:  VTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAAN----GTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDV

Q8LC59 GATA transcription factor 231.1e-1056.86Show/hide
Query:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAM
        ++ + +     R CS+C TTKTP+WR GP GPKSLCNACGIR RK RR+ +
Subjt:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAM

Q9LIB5 GATA transcription factor 174.9e-1167.39Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEE
        RTC DC T +TPLWR GP GPKSLCNACGI+ RK R+AA+   +EE
Subjt:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEE

Q9SZI6 Putative GATA transcription factor 221.3e-2439.52Show/hide
Query:  ETGLRFTIWK------QIDKSGSSIDD---DLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSDCNTT
        ET L+ TI K      Q D   S I D     +LKW   SS +R++       T +  +      D + +LS    N  R  N  +N+ V R CSDCNTT
Subjt:  ETGLRFTIWK------QIDKSGSSIDD---DLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSDCNTT

Query:  KTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQ---HKIIKPAATLKRKCK------------DVAAG
        KTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA A   A +       G  P        NK  +    +KI+ P       CK            D+   
Subjt:  KTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQ---HKIIKPAATLKRKCK------------DVAAG

Query:  RGG---GGRKKLHFED--------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
                   ++F+D        S+YQ+VFP DE+EAAILLM LS+G
Subjt:  RGG---GGRKKLHFED--------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18380.1 GATA transcription factor 201.3e-1154.41Show/hide
Query:  NSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAV
        +S+ R C+ C+TT TPLWR+GP+GPKSLCNACGIR +K  R         A A N TI  GG  AA V
Subjt:  NSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAV

AT3G16870.1 GATA transcription factor 173.5e-1267.39Show/hide
Query:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEE
        RTC DC T +TPLWR GP GPKSLCNACGI+ RK R+AA+   +EE
Subjt:  RTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEE

AT4G26150.1 cytokinin-responsive gata factor 19.4e-2639.52Show/hide
Query:  ETGLRFTIWK------QIDKSGSSIDD---DLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSDCNTT
        ET L+ TI K      Q D   S I D     +LKW   SS +R++       T +  +      D + +LS    N  R  N  +N+ V R CSDCNTT
Subjt:  ETGLRFTIWK------QIDKSGSSIDD---DLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSDCNTT

Query:  KTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQ---HKIIKPAATLKRKCK------------DVAAG
        KTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA A   A +       G  P        NK  +    +KI+ P       CK            D+   
Subjt:  KTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQ---HKIIKPAATLKRKCK------------DVAAG

Query:  RGG---GGRKKLHFED--------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
                   ++F+D        S+YQ+VFP DE+EAAILLM LS+G
Subjt:  RGG---GGRKKLHFED--------SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG

AT5G26930.1 GATA transcription factor 237.7e-1256.86Show/hide
Query:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAM
        ++ + +     R CS+C TTKTP+WR GP GPKSLCNACGIR RK RR+ +
Subjt:  TLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAM

AT5G56860.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein1.9e-2640.18Show/hide
Query:  NSNPTETPAPINGGRNF-QDLNPSLSFDQT-----------NKRRTLN---VDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA
        N++      P+N   NF +D +  L+F              N+  T+N     +NN V R CSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA
Subjt:  NSNPTETPAPINGGRNF-QDLNPSLSFDQT-----------NKRRTLN---VDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMA

Query:  AAA----EEAAAA-------------------NGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATL---KRKCKDVAAGRGGGGRKKLHFED--------
        AAA    +E A A                   NG   Y   P      K  K   + +    A T+       K   +        K  F+D        
Subjt:  AAA----EEAAAA-------------------NGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATL---KRKCKDVAAGRGGGGRKKLHFED--------

Query:  SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG
        S+YQ+VFP DE+EAA+LLM LSYG
Subjt:  SSYQRVFPPDEREAAILLMTLSYG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GGTGGAAGAATCGTGGGTTGTAACAGCGATGATGGTGTGGAAACTGGACTAAGGTTTACTATTTGGAAGCAGATTGACAAGAGCGGGAGTTCGATTGATGACGATTTGGC
CTTGAAGTGGGATTCTTCTTCTTCCAATATCAGAATGGTTATAAATTCTAATCCAACAGAGACGCCAGCCCCGATCAACGGCGGTCGGAATTTTCAAGATCTCAATCCAT
CGTTGTCGTTCGATCAGACCAATAAACGGAGAACGTTGAACGTTGATGACAACAACTCCGTAACTAGAACTTGTTCGGACTGTAACACCACCAAGACTCCTCTATGGAGG
AGCGGACCAAGAGGTCCTAAGTCACTTTGCAACGCCTGTGGAATCCGACAAAGGAAAGCGAGACGAGCAGCCATGGCGGCAGCGGCGGAGGAGGCGGCGGCGGCGAACGG
CACTATTCCATACGGCGGAAAGCCGGCGGCCGCAGTAGTTCTGAAACCCAATAAAACCGCGGTGCAACACAAGATAATCAAGCCGGCGGCGACATTGAAGAGAAAATGCA
AAGACGTCGCCGCCGGCCGCGGCGGCGGAGGGAGAAAAAAGCTACATTTTGAAGATTCCTCTTACCAAAGAGTTTTCCCGCCGGACGAGAGGGAAGCCGCCATCTTGCTC
ATGACCTTATCTTATGGCTGGCCTTCTTCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGTGGAAGAATCGTGGGTTGTAACAGCGATGATGGTGTGGAAACTGGACTAAGGTTTACTATTTGGAAGCAGATTGACAAGAGCGGGAGTTCGATTGATGACGATTTGGC
CTTGAAGTGGGATTCTTCTTCTTCCAATATCAGAATGGTTATAAATTCTAATCCAACAGAGACGCCAGCCCCGATCAACGGCGGTCGGAATTTTCAAGATCTCAATCCAT
CGTTGTCGTTCGATCAGACCAATAAACGGAGAACGTTGAACGTTGATGACAACAACTCCGTAACTAGAACTTGTTCGGACTGTAACACCACCAAGACTCCTCTATGGAGG
AGCGGACCAAGAGGTCCTAAGTCACTTTGCAACGCCTGTGGAATCCGACAAAGGAAAGCGAGACGAGCAGCCATGGCGGCAGCGGCGGAGGAGGCGGCGGCGGCGAACGG
CACTATTCCATACGGCGGAAAGCCGGCGGCCGCAGTAGTTCTGAAACCCAATAAAACCGCGGTGCAACACAAGATAATCAAGCCGGCGGCGACATTGAAGAGAAAATGCA
AAGACGTCGCCGCCGGCCGCGGCGGCGGAGGGAGAAAAAAGCTACATTTTGAAGATTCCTCTTACCAAAGAGTTTTCCCGCCGGACGAGAGGGAAGCCGCCATCTTGCTC
ATGACCTTATCTTATGGCTGGCCTTCTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
GGRIVGCNSDDGVETGLRFTIWKQIDKSGSSIDDDLALKWDSSSSNIRMVINSNPTETPAPINGGRNFQDLNPSLSFDQTNKRRTLNVDDNNSVTRTCSDCNTTKTPLWR
SGPRGPKSLCNACGIRQRKARRAAMAAAAEEAAAANGTIPYGGKPAAAVVLKPNKTAVQHKIIKPAATLKRKCKDVAAGRGGGGRKKLHFEDSSYQRVFPPDEREAAILL
MTLSYGWPSS