; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS003946 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS003946
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionCLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 45
Genome locationscaffold1597:93788..94045
RNA-Seq ExpressionMS003946
SyntenyMS003946
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR038821 - CLE-related protein 45-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036085.1 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 45 [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-3382.56Show/hide
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KAG6584463.1 hypothetical protein SDJN03_20395, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-3279.07Show/hide
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KAG6607448.1 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.6e-2672.94Show/hide
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KAG7037105.1 hypothetical protein SDJN02_00726, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.4e-2272.6Show/hide
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KGN64003.1 hypothetical protein Csa_013092 [Cucumis sativus]4.3e-3482.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQI0 Uncharacterized protein2.1e-3482.56Show/hide
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A0A2P5F704 CLAVATA3/ESR-RELATED1.0e-1754.65Show/hide
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A0A5D3BHX9 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 451.3e-3382.56Show/hide
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A0A7J6EHR9 Uncharacterized protein2.3e-1755.95Show/hide
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A0A7N2MQ95 Uncharacterized protein1.4e-1754.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATTCTACTTCTTTGGATTGGGTTTTTGGCTCTTCAACCAGAAGGAACCAGTGGGTTGACAAACATTGATCTAGCACTCAGATGGGAGAAACCACAAGTTCCCATTTTTAA
CAGCTTCAAGTTTGTGAAGGATGCATCTCTTGGGGATGATTGGCAGAGAACAGTGGCTTTTGCACCGGCACCTTCGACCGGTTTAGATCCCACCCAATTGAATAAGAGAA
GAATCCGAAGAGGATCCGATCCCATTCACAACAAATGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTCTACTTCTTTGGATTGGGTTTTTGGCTCTTCAACCAGAAGGAACCAGTGGGTTGACAAACATTGATCTAGCACTCAGATGGGAGAAACCACAAGTTCCCATTTTTAA
CAGCTTCAAGTTTGTGAAGGATGCATCTCTTGGGGATGATTGGCAGAGAACAGTGGCTTTTGCACCGGCACCTTCGACCGGTTTAGATCCCACCCAATTGAATAAGAGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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