CuGenDBv2

Gene ID	MS004250
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	intron-binding protein aquarius
Genome location	scaffold92:1178456..1181732
RNA-Seq Expression	MS004250
Synteny	MS004250
Gene Ontology terms	GO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process) GO:0071013 - catalytic step 2 spliceosome (cellular component) GO:0003729 - mRNA binding (molecular function) GO:0004386 - helicase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR026300 - CWF11 family IPR032174 - Intron-binding protein aquarius, N-terminal IPR045055 - DNA2/NAM7-like helicase

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0034743.1 aquarius [Cucumis melo var. makuwa]

1.6e-174

94.46

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKV DPSKPKKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPET+TFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQ+NS D N Q V  NGL +GDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

TYK09296.1 aquarius [Cucumis melo var. makuwa]

1.6e-174

94.46

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKV DPSKPKKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPET+TFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQ+NS D N Q V  NGL +GDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

XP_011655901.1 RNA helicase aquarius [Cucumis sativus]

9.4e-175

94.77

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWS V DPSK KKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRG VFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQ+NSGD +DQFV  NGL EGDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

XP_022138887.1 intron-binding protein aquarius [Momordica charantia]

2.9e-184

99.69

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

XP_038891528.1 RNA helicase aquarius [Benincasa hispida]

2.4e-178

96.62

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKV DPSKPKKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFP SNSGDGNDQFV VNGL EGDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KRL9 Uncharacterized protein

4.6e-175

94.77

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWS V DPSK KKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRG VFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQ+NSGD +DQFV  NGL EGDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

A0A1S3BH39 intron-binding protein aquarius

7.8e-175

94.46

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKV DPSKPKKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPET+TFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQ+NS D N Q V  NGL +GDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

A0A5A7SW59 Aquarius

7.8e-175

94.46

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKV DPSKPKKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPET+TFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQ+NS D N Q V  NGL +GDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

A0A5D3CG09 Aquarius

7.8e-175

94.46

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD+PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKV DPSKPKKPFDPELVKKIYETEL VKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPET+TFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGR+ISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTD+IKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLST E KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQ+NS D N Q V  NGL +GDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPT RY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

A0A6J1CCG6 intron-binding protein aquarius

1.4e-184

99.69

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
        MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDD PVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQ

Query:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
        RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET
Subjt:  RVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSET

Query:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
        VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN
Subjt:  VLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDN

Query:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
Subjt:  ACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O60306 RNA helicase aquarius

8.1e-36

32.99

Show/hide

Query:  TLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQRVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENV
        T+S+I  + +T++A   W+      K K PFD ++++ IYE E++    +    ++++M+LE SQYLENYLW N+ PE ++  ++MS+  MVNEKFRENV
Subjt:  TLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQRVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENV

Query:  AAWVCFYDRKDVFKGFLERVLR---LKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSETVLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAK
         AW  F  + D F  F + +L+    +   + S+ E+T  L+F+ + F SLE +++   V ++  L  W  L   R ++EL   T  ++K+  +IK    
Subjt:  AAWVCFYDRKDVFKGFLERVLR---LKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSETVLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAK

Query:  EFIKRGEVFDPLSTTEA----KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDNACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
           K  E  DP +  +A    +FL  LI++F+ VL      +  + D                  + YCERF+E +IDL + LPT R+
Subjt:  EFIKRGEVFDPLSTTEA----KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDNACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

Q8CFQ3 RNA helicase aquarius

2.3e-35

32.99

Show/hide

Query:  TLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQRVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENV
        T+S+I  + +T++A   W+      K K PFD +++++IYE E++    +    ++++M+LE SQYLENYLW N+ PE ++  ++MS+  MVNEKFRENV
Subjt:  TLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQRVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENV

Query:  AAWVCFYDRKDVFKGFLERVLR---LKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSETVLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAK
         AW  F  + D F  F + +L+    +   + S+ E+T  L+F+ + F SLE +++   V ++  L  W  L   R ++EL   T  ++K+  +IK    
Subjt:  AAWVCFYDRKDVFKGFLERVLR---LKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSETVLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAK

Query:  EFIKRGEVFDPLSTTEA----KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDNACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
           K  E  DP +  +A    +FL  LI++F+ VL      +  + D                  + YCERF+E +IDL + LPT R+
Subjt:  EFIKRGEVFDPLSTTEA----KFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDNACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G38770.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein

1.9e-125

69.33

Show/hide

Query:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVE-SNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPL
        M KVYGTG YDFKRHRVAEYP+E  +   ++P+ESKPG+ LP++ITLSEIQ+DRLTKIA  +W K      P+KPFDPE+VK+IY TEL V  GRK VPL
Subjt:  MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVE-SNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPL

Query:  QRVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSE
        QRVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILM+NEKFRENVAAW+CF+DR D+FK FL++VLRLKEGRD++IAEKTNYLVFMINAFQSLED +V+E
Subjt:  QRVMILEVSQYLENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSE

Query:  TVLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGD
         VL +AGLQSWHSLSYGRFQMELCL  D+IKKWKR  K+ A E   +GE FD  S+ EA F+R LIEEF+EVLD  VF          Q V        D
Subjt:  TVLRIAGLQSWHSLSYGRFQMELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGD

Query:  NACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY
        ++ +LYCERFMEFLID+L+QLPT RY
Subjt:  NACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCGAAGGTCTATGGAACTGGTGTGTATGATTTCAAGCGTCACAGAGTGGCGGAGTACCCCGTCGAATCCAATCAGGTCGACGACCAGCCCGTTGAGTCTAAGCCCGG
CGCGGCACTGCCAAACACGATAACACTATCGGAGATTCAACGAGACCGGCTGACGAAGATTGCGGCGGCGAACTGGTCGAAAGTAAGGGACCCCTCGAAGCCTAAGAAGC
CCTTTGATCCAGAGTTGGTAAAGAAGATTTACGAGACGGAGCTGTTGGTTAAAGAGGGCCGGAAAACCGTTCCGCTGCAGAGGGTGATGATTTTGGAGGTCAGTCAGTAT
TTGGAAAACTATCTGTGGCCCAATTTTGACCCGGAGACTGCGACGTTCGAGCATGTAATGTCGATGATACTCATGGTTAATGAAAAGTTTAGAGAGAATGTTGCAGCTTG
GGTATGTTTTTATGATCGGAAGGATGTCTTTAAGGGGTTTCTTGAGAGGGTTCTTCGACTGAAGGAGGGAAGAGATATAAGCATTGCAGAGAAGACAAATTATCTTGTTT
TTATGATTAATGCCTTTCAGAGCTTGGAGGATGAGATTGTCAGTGAGACTGTATTGAGAATAGCAGGTCTGCAGTCTTGGCACAGTTTATCTTATGGTCGTTTTCAGATG
GAACTTTGTCTTAATACTGATGTAATAAAGAAATGGAAAAGGATGATAAAGAGAGAGGCTAAAGAGTTTATTAAACGAGGGGAGGTTTTTGATCCATTGTCAACTACTGA
AGCGAAGTTCTTGAGAAACCTAATCGAGGAGTTCCTGGAGGTTCTGGATGGCGAAGTCTTCCCCCAGAGTAATTCAGGTGATGGAAATGATCAGTTTGTTGGTGTCAATG
GCTTGACAGAGGGAGACAATGCTTGCATTTTGTATTGTGAGAGGTTCATGGAGTTTCTGATTGACCTTTTAAGCCAGCTCCCTACAAGTAGGTAT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPKVYGTGVYDFKRHRVAEYPVESNQVDDQPVESKPGAALPNTITLSEIQRDRLTKIAAANWSKVRDPSKPKKPFDPELVKKIYETELLVKEGRKTVPLQRVMILEVSQY
LENYLWPNFDPETATFEHVMSMILMVNEKFRENVAAWVCFYDRKDVFKGFLERVLRLKEGRDISIAEKTNYLVFMINAFQSLEDEIVSETVLRIAGLQSWHSLSYGRFQM
ELCLNTDVIKKWKRMIKREAKEFIKRGEVFDPLSTTEAKFLRNLIEEFLEVLDGEVFPQSNSGDGNDQFVGVNGLTEGDNACILYCERFMEFLIDLLSQLPTSRY

MS004250 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome