; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS004459 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS004459
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold804:258298..259277
RNA-Seq ExpressionMS004459
SyntenyMS004459
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046869.1 hypothetical protein E6C27_scaffold230G00240 [Cucumis melo var. makuwa]3.1e-3278.16Show/hide
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KAE8650170.1 hypothetical protein Csa_010956 [Cucumis sativus]6.3e-3378.16Show/hide
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        MA W AA RR++ SH S+STPQIASLT  RGLAGGG+HHG PKVNFWEDP NP++WKREHFVIVSLTG GLVLYG Y+FFT+GKKEE
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KAF3962262.1 hypothetical protein CMV_013205 [Castanea mollissima]1.9e-2667.37Show/hide
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        MA WT AAR+ V     SS K+ ST Q ASL   RGLAGGG+HHG PKVNFW+DPL+P+KWK EHFVIVSLTG GL+ YGGY+FFT+   GKKEE
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XP_015896395.1 uncharacterized protein LOC107430112 isoform X1 [Ziziphus jujuba]2.5e-2668.13Show/hide
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        MA  T AAR+      +SS KS ST Q ASL   RGLAGGG+HHG PKVNFW+DPLNP+KWK EHFVIVSLTG GL+LYGGY++FT+GKK+
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XP_021606673.1 uncharacterized protein LOC110610908 [Manihot esculenta]1.1e-2665.22Show/hide
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        MA WTAAAR+      +SS +  S PQ ASL   RGLAGGG+HHG PKVNFW+DP++P+KWK EHFVIVSLTG GL+ +GGY+FFTRGKK++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L362 Uncharacterized protein3.0e-3378.16Show/hide
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        MA W AA RR++ SH S+STPQIASLT  RGLAGGG+HHG PKVNFWEDP NP++WKREHFVIVSLTG GLVLYG Y+FFT+GKKEE
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A0A2C9W6M2 Uncharacterized protein5.5e-2765.22Show/hide
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        MA WTAAAR+      +SS +  S PQ ASL   RGLAGGG+HHG PKVNFW+DP++P+KWK EHFVIVSLTG GL+ +GGY+FFTRGKK++
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A0A5A7U055 Uncharacterized protein1.5e-3278.16Show/hide
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A0A6P4AKA6 uncharacterized protein LOC107430112 isoform X21.2e-2668.13Show/hide
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        MA  T AAR+      +SS KS ST Q ASL   RGLAGGG+HHG PKVNFW+DPLNP+KWK EHFVIVSLTG GL+LYGGY++FT+GKK+
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A0A6P4BBQ1 uncharacterized protein LOC107430112 isoform X11.2e-2668.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20820.1 unknown protein2.3e-1747.56Show/hide
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        + +++S  QI S  +S G         LAG  +HHGS KV+FW+ P NP  WK EHFV++SL+G GL+ Y GY+  T GKKE
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AT2G20820.2 unknown protein4.4e-0841.38Show/hide
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        + +++S  QI S  +S G         LAG  +HHGS KV+FW+ P NP  WK EH++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGTGTGGACGGCCGCGGCTCGCCGTATGGTTTCCTCTCACAAATCAGTTTCTACGCCTCAAATCGCCTCTCTAACCCTAAGCCGCGGTCTTGCCGGCGGTGGCGA
ACATCATGGATCCCCGAAGGTGAACTTTTGGGAGGATCCTCTTAATCCAACCAAATGGAAAAGAGAACATTTTGTGATTGTGTCTTTGACTGGAGGGGGTTTAGTTCTTT
ATGGGGGCTACGAGTTCTTCACCAGAGGCAAGAAGGAAGAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGTGTGGACGGCCGCGGCTCGCCGTATGGTTTCCTCTCACAAATCAGTTTCTACGCCTCAAATCGCCTCTCTAACCCTAAGCCGCGGTCTTGCCGGCGGTGGCGA
ACATCATGGATCCCCGAAGGTGAACTTTTGGGAGGATCCTCTTAATCCAACCAAATGGAAAAGAGAACATTTTGTGATTGTGTCTTTGACTGGAGGGGGTTTAGTTCTTT
ATGGGGGCTACGAGTTCTTCACCAGAGGCAAGAAGGAAGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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