; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS004630 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS004630
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiontranscription factor JUNGBRUNNEN 1
Genome locationscaffold995:799966..800415
RNA-Seq ExpressionMS004630
SyntenyMS004630
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004144678.1 transcription factor JUNGBRUNNEN 1 [Cucumis sativus]6.3e-2552.5Show/hide
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        L S A   E S    SSF N V+G+ G DD    TN GWDELRPVVQFAVDPS QLY+CI
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XP_008466794.1 PREDICTED: transcription factor JUNGBRUNNEN 1-like isoform X1 [Cucumis melo]8.3e-2550.93Show/hide
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         L        E S    SS  N V+G  G DD F T+ GWDELRP+VQFAVDPS QLY+CI
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XP_022135374.1 transcription factor JUNGBRUNNEN 1 [Momordica charantia]1.4e-7797.28Show/hide
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XP_038899483.1 transcription factor JUNGBRUNNEN 1 isoform X1 [Benincasa hispida]6.8e-2753.29Show/hide
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         EPSS  PSSF N VDG  G DD FT + GWDELRP+VQF VDPS QLY CI
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XP_038899484.1 transcription factor JUNGBRUNNEN 1 isoform X2 [Benincasa hispida]6.8e-2753.29Show/hide
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         EPSS  PSSF N VDG  G DD FT + GWDELRP+VQF VDPS QLY CI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L479 NAC domain-containing protein1.9e-1949.67Show/hide
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        N  EVWTLCRI +R+ SF+KY P+ +N  N N      P P      QNPN +SN IFTSK    F   P+ST  HH    ETKP P  Q   + NPNL 
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        L S A   E S    SSF N V+G+ G DD    TN GWDELRPVVQFA + S
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A0A1S3CTC4 transcription factor JUNGBRUNNEN 1-like isoform X14.0e-2550.93Show/hide
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        N  EVWTLCRIF+R+ SF+KY P+ NN  N N      P P      QNPN +SN IFTSK    F   P+ST +H     HETKP P  Q   + NPNL
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         L        E S    SS  N V+G  G DD F T+ GWDELRP+VQFAVDPS QLY+CI
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A0A498HF39 NAC domain-containing protein5.1e-1236.94Show/hide
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        EVWTLCRIF+R+ S++KYTP                  I   T QNP   S+   + +S +   + + LH   + +       P   Q++  N  L    
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         L    +  P ++  SS  N  DG     D FTN  WDELRPVVQ AVDPSSQ+YDC
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A0A5N5GDT3 Transcription factor JUNGBRUNNEN 1-like1.0e-1236.77Show/hide
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        EVWTLCRIF+R+ S+RKYTP       +      NP   S  T       + + +     ++ F     S P+H + + +  +  L      I++P    
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               P ++  SSF+N  DG     D FTN  WDELRPVVQ AVDPSSQ+YDC
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A0A6J1C187 transcription factor JUNGBRUNNEN 17.0e-7897.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AATGTGCAGGAAGTTTGGACCCTATGTAGGATTTTCAGAAGAGTCTCATCTTTCAGAAAGTACACTCCATCAACAAATAACCCTAAGAACCAAAACAATATTATTATTAA
TAATCCAATACCAATTTCTGATCTCACACTCCAAAACCCTAATTATCATTCCAATACTATTTTCACCTCTAAATCCAACGCCACCTTCCCCTTTTCAACTCCCCTACATC
ATGAAACCAAGCCAAACCCTAATTCTCAACAACTCAACATCTTCAACCCTAACTTACCCCTATCCCATGCTATTTTCTTGGAACCCTCTTCTTCGTACCCGTCCAGCTTT
CAGAACGACGTCGATGGAAAAGAAGGAAGAGACGATATCTTCACGAACAGAGGTTGGGATGAGCTCCGGCCTGTCGTGCAGTTCGCCGTCGATCCTTCTTCCCAACTATA
TGATTGTATA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATGTGCAGGAAGTTTGGACCCTATGTAGGATTTTCAGAAGAGTCTCATCTTTCAGAAAGTACACTCCATCAACAAATAACCCTAAGAACCAAAACAATATTATTATTAA
TAATCCAATACCAATTTCTGATCTCACACTCCAAAACCCTAATTATCATTCCAATACTATTTTCACCTCTAAATCCAACGCCACCTTCCCCTTTTCAACTCCCCTACATC
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TGATTGTATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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