; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS004705 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS004705
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiontranscription factor MYB35
Genome locationscaffold741:249437..249826
RNA-Seq ExpressionMS004705
SyntenyMS004705
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580990.1 Transcription factor MYB35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-2655Show/hide
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XP_022157667.1 transcription factor MYB35 [Momordica charantia]5.8e-5997.71Show/hide
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XP_022934424.1 transcription factor MYB35-like [Cucurbita moschata]2.9e-2655Show/hide
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          SSS  S+  +G      + EGSSS+  SSF+SFVDALL QD +IKGSFPEIL+ CFDY
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XP_023526254.1 transcription factor MYB35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-2656.6Show/hide
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         SSS  S+  +G      + EGSSS+  SSF+SFVDALL QD +IKGSFPEIL+ CFDY
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UJQ3 Transcription factor MYB352.7e-2556.21Show/hide
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        S+ S+G   +  R EGSSS+  SSF+SFVDALLEQDF+IKGSFPEIL+ CFDY
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A0A5D3D1E1 Transcription factor MYB352.7e-2556.21Show/hide
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        +GIDPITHKPFSQILFDYG+I SS  +TPKP +  FN      TTMAK  QPFS          FQTP +P    E PTSSS SSS+ +        +  
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        S+ S+G   +  R EGSSS+  SSF+SFVDALLEQDF+IKGSFPEIL+ CFDY
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A0A6J1DV32 transcription factor MYB352.8e-5997.71Show/hide
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A0A6J1F2J0 transcription factor MYB35-like1.4e-2655Show/hide
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A0A6J1J901 transcription factor MYB35-like1.4e-2655Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTGGGGATTGACCCAATAACCCACAAGCCATTCTCTCAGATCCTGTTCGACTATGGAACCATAAGCAGCAGCAGCAGCAGCACACCGAAACCCCCAATTCCGGCCTTCAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGGGGATTGACCCAATAACCCACAAGCCATTCTCTCAGATCCTGTTCGACTATGGAACCATAAGCAGCAGCAGCAGCAGCACACCGAAACCCCCAATTCCGGCCTTCAA
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CATCTTCTTCCTTGTCGCAGAGCTCAGATGGGTTCGTTTTGGGGCATCGATCTGAAGGGTCGTCTTCTAATTCTTCGTCGTCTTTCAATTCGTTTGTGGATGCTCTGTTG
GAGCAGGATTTCCAGATTAAGGGCTCGTTTCCAGAGATTTTGGAGGCCTGTTTTGATTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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