; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005239 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005239
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationscaffold83:238885..239475
RNA-Seq ExpressionMS005239
SyntenyMS005239
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586344.1 hypothetical protein SDJN03_19077, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-7683.92Show/hide
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XP_022142974.1 uncharacterized protein LOC111012972 [Momordica charantia]1.3e-94100Show/hide
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XP_022937837.1 uncharacterized protein LOC111444107 [Cucurbita moschata]3.6e-7683.42Show/hide
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XP_022965947.1 uncharacterized protein LOC111465673 [Cucurbita maxima]2.1e-7683.92Show/hide
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XP_038890503.1 uncharacterized protein LOC120080038 [Benincasa hispida]8.5e-7885.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E2K6 uncharacterized protein LOC1034964923.0e-7382Show/hide
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A0A5A7V7K3 Putative serine-rich protein C215.13-like protein3.0e-7382Show/hide
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A0A6J1CN00 uncharacterized protein LOC1110129726.3e-95100Show/hide
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A0A6J1FCB9 uncharacterized protein LOC1114441071.7e-7683.42Show/hide
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A0A6J1HLP3 uncharacterized protein LOC1114656731.0e-7683.92Show/hide
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        +SSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGI+SQ HAPYSP+RL+ARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAALIRPSSHQQRRR DFKPK SRLSIMS+A ET
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein4.6e-0544.9Show/hide
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        +S+V V SR      + ++ S +K  C+CSPTTHPGSFRC +H+ +  Q
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related1.4e-3852.07Show/hide
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        M  TS R  SNG VLRS SPSGRF         SSS SAFASS+SS  S+ +++FF             RS SP+RV L+ + P+S  S R++L S S+S
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Query:  VSSR--SGGNVQVVQRRSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGIVS---QSHAPYSPNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAALIRPSSHQQRRRA
         +++  S    Q         R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSH  +RRA
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Query:  DFKPKHSRLSIMSRAEE
         ++P+ SRLSIM++A+E
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related5.4e-1436.1Show/hide
Query:  MAATSRRSNGSVLRSLSPSGRFYN-----CRSSSPSAFASSSSSFSSTSATSFFCRSTSPSRVKLHGSSPVSVPSVRFALHSSVSVSSRSGGNVQVVQRR
        MAAT  RS+ SVLR LS S R +N      R  SPS                  C      R+K +    +  PSV       V+VSS            
Subjt:  MAATSRRSNGSVLRSLSPSGRFYN-----CRSSSPSAFASSSSSFSSTSATSFFCRSTSPSRVKLHGSSPVSVPSVRFALHSSVSVSSRSGGNVQVVQRR

Query:  SSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGIVSQ------SHAPYSPNR----------LNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAA-LIRPSSHQQRRRADFK
          +KR C+CSPTTHPGSFRCS H+ +  +      S      NR          LN R+ A+ NSL +IG VE +  +R+LAA L +PSS    RR +F+
Subjt:  SSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGIVSQ------SHAPYSPNR----------LNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAA-LIRPSSHQQRRRADFK

Query:  PKHSR
        P+ SR
Subjt:  PKHSR

AT5G25280.1 serine-rich protein-related4.1e-3851.8Show/hide
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        MA TS    RSNGS  LRS SPSGRF   Y+ R  SSSPS+  FASS+SS  S+ +T+FF           RS SP+RV L  S+P+      S+ +   
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        + + S++VSS    N   +     S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ
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Query:  QRRRADFKPKHSRLSIMSRAEE
         +RR+ ++P+ SRL+ MS+AE+
Subjt:  QRRRADFKPKHSRLSIMSRAEE

AT5G25280.2 serine-rich protein-related4.1e-3851.8Show/hide
Query:  MAATS---RRSNGSV-LRSLSPSGRF---YNCR--SSSPSA--FASSSSSFSSTSATSFFC----------RSTSPSRVKLHGSSPV------SVPSVRF
        MA TS    RSNGS  LRS SPSGRF   Y+ R  SSSPS+  FASS+SS  S+ +T+FF           RS SP+RV L  S+P+      S+ +   
Subjt:  MAATS---RRSNGSV-LRSLSPSGRF---YNCR--SSSPSA--FASSSSSFSSTSATSFFC----------RSTSPSRVKLHGSSPV------SVPSVRF

Query:  ALHSSVSVSSRSGGNVQVVQRRSSSKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGIVS---QSHAPYSPNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAALIRPSSHQ
        + + S++VSS    N   +     S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ
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Query:  QRRRADFKPKHSRLSIMSRAEE
         +RR+ ++P+ SRL+ MS+AE+
Subjt:  QRRRADFKPKHSRLSIMSRAEE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ACTGTAACGAAAATGGCGGCAACTTCTCGAAGATCGAACGGATCAGTTCTCCGATCGCTCTCTCCGTCCGGAAGATTCTACAATTGCCGTAGTTCATCCCCGTCGGCGTT
CGCGTCTTCGAGTTCCAGCTTCTCCTCTACATCAGCCACTTCCTTCTTCTGCAGATCGACTTCCCCGTCGCGCGTGAAGCTTCACGGCTCGTCTCCGGTTTCCGTGCCGT
CCGTGCGGTTTGCTCTTCACAGTTCCGTGTCTGTTTCTTCTCGCAGCGGTGGTAATGTTCAAGTGGTGCAGAGGCGGAGCAGTTCCAAGAGGACCTGTATGTGTTCTCCT
ACCACGCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGCCTCCATAAAGGCATCGTTTCGCAGTCTCACGCGCCGTATTCGCCGAATAGACTGAATGCTCGTAGATCGGCGATGACGAA
CTCTCTGGTTAGAATCGGAGGCGTTGAAGGCGATCTGGTGAAGCGAGCTTTAGCGGCTTTGATTCGGCCTTCTTCACATCAGCAACGGCGCAGAGCCGATTTTAAGCCGA
AGCATAGCCGGCTGTCGATTATGTCCAGGGCCGAAGAAACA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACTGTAACGAAAATGGCGGCAACTTCTCGAAGATCGAACGGATCAGTTCTCCGATCGCTCTCTCCGTCCGGAAGATTCTACAATTGCCGTAGTTCATCCCCGTCGGCGTT
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CTCTCTGGTTAGAATCGGAGGCGTTGAAGGCGATCTGGTGAAGCGAGCTTTAGCGGCTTTGATTCGGCCTTCTTCACATCAGCAACGGCGCAGAGCCGATTTTAAGCCGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
TVTKMAATSRRSNGSVLRSLSPSGRFYNCRSSSPSAFASSSSSFSSTSATSFFCRSTSPSRVKLHGSSPVSVPSVRFALHSSVSVSSRSGGNVQVVQRRSSSKRTCMCSP
TTHPGSFRCSLHKGIVSQSHAPYSPNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAALIRPSSHQQRRRADFKPKHSRLSIMSRAEET